根據其發病年齡、臨床表現及輔助檢查，定性診斷多不困難，尤其是年輕的三叉神經痛病人，病因多為表皮樣囊腫。CT及MRI的臨床應用使各部位的表皮樣囊腫的定性、定位診斷變得快速、準確、容易。甚至可以發現未意料到的病變。各常見部位的表皮樣囊腫診斷要點如下：
1、腦橋小腦角表皮樣囊腫
(1)發病年齡相對較早而病程較長。
(2)主要表現為三叉神經痛或表現為腦橋小腦角綜合征，但聽力和前庭功能損害較輕
(3)腦脊液蛋白含量正常。
(4)顱骨平片內聽道正常。
2、鞍區表皮樣囊腫
(1)病史長，進展緩慢。
(2)出現原發性視神經萎縮和雙顳側偏盲等視交叉壓迫表現。
(3)垂體功能正常。
(4)顱骨平片蝶鞍大小正常、但視神經孔、視交叉溝等可有局限性破壞。
3、顱中窩表皮樣囊腫
(1)以三叉神經損害為主，病程長。
(2)部分病例后期可出現顱內壓增高。
(3)顱底片常顯示巖骨尖有邊緣清楚的骨質缺損。
(4)腦脊液蛋白含量一般不高。
(5)耳前皮膚出現藏毛竇時，對定性診斷幫助很大。
4、側腦室內表皮樣囊腫
(1)多見于青中年人。
(2)當腫瘤沒有造成腦室內梗阻或壓迫重要結構以前可無癥狀，出現顱內壓增高時一般腫瘤體積已長得較大，可有輕偏癱、偏身感覺障礙。
(3)腦脊液蛋白含量一般正常。
(4)CT及MRI可見點位表現的影像。