液相色譜儀是利用混合物在液-固或互不相溶的兩種液體之間分配比的差異，對混合物進行分離和分析鑒定的儀器，應用極其廣泛。
流動相
流動相：保持貯液瓶清潔，對專用貯液瓶應定期清潔；定期（如半個月）在稀硝酸溶液中超聲、清潔過濾器，清潔后用純水清洗到中性，保持過濾器暢通。
使用的流動相應為HPLC級或同等級，在配置過程中，所有非HPLC級的試劑或溶液均應用0.45/0.22μm濾膜過濾。流動相經超聲波清洗機超聲波除氣后使用。
所使用的水必須是經過蒸餾純化后再經過0.45/0.22μm濾膜過濾后使用，超純水和娃哈哈/怡寶純凈水或同等級水可直接使用，所有試液均新用新配，配置后液體需經過0.45/0.22μm濾膜過濾后使用，并且分析的樣品都必須經過0.45/0.22μm濾膜過濾后進樣，防止微粒阻塞進樣閥和減少對進樣閥的磨損。
保存時間：純有機相，比如甲醇、乙腈等為1個月；水相（含超純水，磷酸水，乙酸水，緩沖鹽水，離子對試劑等）最好現配現用，存放不超過3天為宜；水相與有機相混合的為7天。有效期內，每1-2天要進行脫氣。水相每兩天過濾和脫氣，如果在有效期內發現長發和濁度，則應重新制備為變質。
泵
高壓輸液泵是液相色譜儀的核心，泵將流動相從溶劑瓶輸送到液相流路系統中，并要在高壓下保持流量和壓力的穩定，確保系統的穩定運行和系統的重現性。
狀態正常的高壓泵是液相色譜準確分析的基礎。高壓輸液泵由步進電機和柱塞組成。高壓長期運行會逐漸磨損泵的內部結構。最好以梯度的方式增加流量，最好是每次0.2ml/min，然后在壓力穩定時，使其重復，直到上升到所需的流量。同時，注意排除泵頭內氣泡，以避免泵的壓力波動等。
色譜柱
采用保護柱，延長柱的使用壽命。如果污染物堆積在保護柱頭上，柱壓增大，柱效降低，當峰型變差時，去除強溶劑后使用或更換新的保護柱..為避免固定相的破壞，選擇了合適的流動相。
檢測器
分析過程中要注意流通池的耐受壓力。在樣品分析完畢后，及時關閉燈光源。如果分析過程中使用酸（堿）/緩沖鹽溶液，進樣分析前、后都需使用水：甲醇（95：5/90:10）清洗管路和色譜柱1小時以上，并使用甲醇/甲醇：水（95:5）沖洗管路和色譜柱40分鐘以上并保存。
液相色譜儀周圍應干燥清潔，避免流動相或化學試劑濺到儀器上，造成腐蝕..如果儀器長時間不用，要經常定期開啟儀器，盡量半個月到一個月開啟一次儀器，并用甲醇沖洗系統。