2023年顏寧、蘇士成、高福等中國學者在Cell發表62篇研究文章

　　截至到2023年12月19日，中國學者在Cell 發表了62篇研究文章，iNature編輯部統計了這些文章：

　　單位統計：中國科學院發了20篇，北京大學有8篇，復旦大學，清華大學及上海交通大學各發了6篇。

　　按照時間來看，6月發表的數量最多，有10篇；8月發表的數量最少，只有2篇。

　　按照通訊作者的人數，只有單一的通訊作者有18篇，多于一位通訊作者的有44篇。

　　按照主要單位是否有國外單位參與來劃分，有國外單位參與的有18篇，沒有的有44篇文章。

　　按通訊作者發表的數量來看（大于1），杜鵬、季維智、譚韜及吳軍各為2篇。

　　中國學者在Cell 發表的文章列表（時間比較匆忙，如有遺漏或者是紕漏，iNature編輯部深表歉意，可直接留言，方便我們進一步更正）：

　　中國學者在Cell 發表的詳細文章列表：

　　【1】2023年12月14日，浙江大學醫學院李曉明教授課題組、張巖教授課題組合作在Cell 上發表了題為“Snapshot of the cannabinoid receptor 1–arrestin complex unravels the biased signaling mechanism”的研究論文，該項研究成功從原子分辨率水平解析了大麻素受體CB1的β-arrestin1信號轉導復合物的精細三維結構，結合細胞水平功能分析闡明了大麻素受體CB1介導β-arrestin信號的關鍵結構決定因素以及下游G蛋白和β-arrestin選擇性信號轉導機制，為推動開發精細調控CB1功能信號的合成大麻素奠定基礎，從而在保留大麻治療效果的同時規避其副作用。

　　【2】2023年12月12日，中國科學院動物研究所焦建偉研究組、廣州國家實驗室董驥研究組、北京大學杜鵬研究組和北京大學靳蕾研究組合作共同通訊在Cell 在線發表題為“Spatiotemporal transcriptome atlas reveals the regional specification of the developing human brain”的研究論文，該研究通過結合空間轉錄組學(scStereo-seq)和scRNA-seq，建立了6-23孕周(GWs)人類大腦多個區域的時空發育圖譜。這項研究為發展中的人類大腦的區域特化供了全面的見解。

　　【3】2023年12月5日，中山大學蘇士成團隊在Cell 在線發表題為“Choroid plexus mast cells drive tumor-associated hydrocephalus”的研究論文，該研究通過單核RNA測序和空間轉錄組學，發現脈絡膜叢中有一個獨特的肥大細胞群，并且在TAH期間顯著增加。遺傳命運追蹤和顱內肥大細胞特異性胰蛋白酶敲除表明，脈絡膜叢肥大細胞(CPMCs)通過胰蛋白酶 -PAR2-FoxJ1途徑破壞脈絡膜叢上皮的纖毛，從而增加腦脊液的產生。人脈絡膜叢中也有肥大細胞。腦脊液中胰蛋白酶水平與TAH的臨床嚴重程度密切相關。BMS-262084是一種胰蛋白酶抑制劑，能穿過血腦屏障，在體內抑制TAH，并在人多能干細胞源性脈絡膜叢類器官模型中減輕肥大細胞誘導的上皮纖毛損傷。總之，該研究揭示了CPMCs的功能，并為TAH提供了一種有吸引力的治療方法。

　　【4】2023年12月4日，得克薩斯州西南醫學中心吳軍、昆明理工大學譚韜、季維智及中國農業大學魏育蕾共同通訊在Cell 在線發表題為“Dissecting embryonic and extraembryonic lineage crosstalk with stem cell co-culture”的研究論文，該研究利用激活FGF、TGF-b和WNT通路的統一培養條件，成功地從小鼠和食蟹猴囊胚的三種基礎組織中獲得了胚胎干細胞(FTW-ESCs)、胚胎外內胚層干細胞(FTW-XENs)和滋養細胞干細胞(FTW-TSCs)。胚胎和胚胎外干細胞共培養策略為開發更真實的胚胎模型和設計更發育相關的分化方案提供了有希望的途徑。

　　【5】2023年11月27日，北京生命科學研究所張二荃團隊在Cell 在線發表題為“Prolonged sleep deprivation induces a cytokine-storm-like syndrome in mammals”的研究論文，該研究表明在哺乳動物中，長時間的睡眠剝奪會引起細胞動力學風暴樣綜合征。該研究揭示了中樞神經系統中PGD2與睡眠相關的變化會對周圍免疫系統產生深遠的病理影響。

　　【6】2023年11月17日，福建農林大學徐通達及楊貞標共同通訊（于永強、唐文鑫、林文偉、周翔及李圍為論文共同第一作者）在Cell 在線發表題為“ABLs and TMKs are co-receptors for extracellular auxin”的研究論文，該研究發現了兩個新的生長素結合蛋白ABL1和ABL2，它們定位于外質體，并以生長素依賴的方式直接與TMKs的細胞外結構域相互作用。功能冗余的ABL1和ABL2在遺傳上與TMK相互作用，并表現出與ABP1重疊的功能，同時獨立于ABP1。重要的是，TMK1本身的胞外結構域與生長素結合，并在生長素結合中與ABP1或ABL1協同作用。因此，該研究發現生長素受體ABL1和ABL2與ABP1具有重疊但不同的功能，并與TMKs一起作為細胞外生長素的共受體。

　　【7】2023年11月15日，顏寧教授聯合武漢大學藥學院高帥教授、北京大學宋晨研究員在Cell 在線發表題為“Structural basis for human Cav1.2 inhibition by multiple drugs and the neurotoxin calciseptine”的研究論文，該研究展示了人類Cav1.2的冷凍電鏡結構，既包括載脂蛋白形式，也包括與幾種藥物以及肽神經毒素Calciseptin的復合物。同時，S4-5III與S5III合并成為單螺旋，形成一個加寬但仍不導電的胞內門。

　　【8】2023年11月13日，山東大學孫金鵬教授團隊、楊帆教授團隊，聯合四川大學邵振華團隊、上海交通大學醫學院李乾團隊和山東第一醫科大學王越團隊在Cell 在線發表了研究論文“Structural and signaling mechanisms of TAAR1 enabled preferential agonist design”。研究團隊系統地分析了不同內源性胺類和SEP-363856激活TAAR1多種G蛋白信號的特征，解析了不同胺類激活TAAR1-Gs/Gq通路的分子機制和藥理學特征，進而成功開發出同時具有Gs和Gq雙激活活性的TAAR1小分子激動劑ZH8651，并在小鼠模型中驗證了其改善精神分裂的作用。該研究為靶向TAAR1治療精神分裂癥的候選化合物設計及藥物開發改造提供了重要參考。

　　【9】2023年11月9日，中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心（神經科學研究所）、上海腦科學與類腦研究中心劉真研究組，腦智卓越中心非人靈長類研究平臺孫強研究團隊和中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院Miguel A. Esteban研究組合作在Cell 在線發表題為“Live birth of chimeric monkey with high contribution from embryonic stem cells”的研究論文，該研究在國際上首次成功構建了高比例胚胎干細胞貢獻的出生存活嵌合體猴，并證實了猴胚胎干細胞可以高效的貢獻到胚外胎盤組織和生殖細胞。該研究系統地測試了建立猴胚干細胞的各種培養條件，并優化了嵌合胚胎的培養程序。這種方法產生了一個流產的胎兒和一個具有高供體細胞貢獻的嵌合猴。一個嚴格的表征管道表明，供體細胞有效地(高達90%)融入嵌合猴的各種組織(包括性腺和胎盤)。總之，該研究在國際上首次成功構建了高比例胚胎干細胞貢獻的出生存活嵌合體猴，并證實了猴胚胎干細胞可以高效的貢獻到胚外胎盤組織和生殖細胞。這對于理解靈長類胚胎干細胞全能性具有重要意義，為遺傳修飾模型猴的構建奠定了技術基礎。

　　【10】2023年11月2日，中國科學院深圳先進技術研究院腦認知與腦疾病研究所（以下簡稱“深圳先進院腦所”）/深港腦科學創新研究院（以下簡稱“深港腦院”）路中華/戴輯/鮑進團隊在Cell 上在線發表了題為“Circuit-specific gene therapy reverses core symptoms in a primate Parkinson’s disease model” 的研究論文，該研究研究報道了一種全新的基于逆向腺相關病毒（retrograde AAV）的神經調控策略，這一技術與現有左旋多巴和多巴胺受體激動劑類藥物相比的最大特點是可以實現對帕金森病累及的基底節神經環路的精準靶向干預，而不影響全腦全身任一其他多巴胺通路和系統，為帕金森病臨床治療提供了潛在的全新精準干預技術。

　　【11】2023年10月23日，法國內克爾兒童醫院Jonathan Bohlen，Jean-Laurent Casanova及Jacinta Bustamante共同通訊（復旦大學周欽華為共同第一作者）在Cell 在線發表題為“Human MCTS1-dependent translation of JAK2 is essential for IFN-γ immunity to mycobacteria”的研究論文，該研究報告了來自不同祖先(來自中國、芬蘭、伊朗和沙特阿拉伯)的分枝桿菌病男性的X連鎖隱性MCTS1缺乏癥。這些發現表明，X連鎖的隱性人MCTS1缺陷通過損害先天樣適應性T淋巴細胞中JAK2的翻譯，從而損害IL-23依賴性的IFN-γ誘導，從而成為分離的分枝桿菌疾病的基礎。

　　【12】2023年10月17日，西湖實驗室的王壽文研究員聯合波士頓兒童醫院的李莉博士和Fernando Camargo教授在Cell 雜志發表題為“A mouse model with high clonal barcode diversity for joint lineage, transcriptomic, and epigenomic profiling in single cells”的研究論文，開發了新一代譜系追蹤小鼠DARLIN，以及多組學譜系追蹤技術Camellia-seq。這項技術為系統理解細胞的分化、發育、遷移、穩態等一系列重要問題提供了全新的手段。

　　【13】2023年10月7日，北京大學瞿禮嘉及鐘聲共同通訊在Cell 在線發表題為“Antagonistic RALF peptides control an intergeneric hybridization barrier on Brassicaceae stigmas”的研究論文，該研究發現受體樣激酶FERONIA/CURVY1/ANJEA/HERCULES受體激酶1和細胞壁蛋白LRX3/4/5與自分泌的柱頭化RALF1/22/ 23/33肽配體(sRALFs)在乳頭細胞（papilla cell）表面相互作用，以建立鎖定，阻止不需要的花粉管滲透。兼容的花粉衍生的RALF10/11/12/13/25/26/30肽(pRALFs)作為關鍵，與sRALFs競爭并使花粉管穿透。通過用合成的pRALFs處理擬南芥柱頭，打開了這一屏障，促進了遠親蕓苔科物種的花粉管滲透，并導致種間/屬間雜交胚胎的形成。因此，該研究發現了一個控制蕓苔科種間/屬間雜交寬度的“鎖與鑰匙”系統。操縱這一系統有望促進作物的廣泛雜交。

　　【14】2023年9月28日，麻省理工學院Manolis Kellis及蔡理慧（Li-Huei Tsai）共同通訊（第一作者為浙江大學熊旭深）在Cell在線發表題為“Epigenomic dissection of Alzheimer’s disease pinpoints causal variants and reveals epigenome erosion”的研究論文，該研究分析了來自92名AD患者和非AD患者前額葉皮層的850,000個細胞核的表觀基因組和轉錄組圖譜，以構建大腦規則組圖譜，包括表觀基因組圖譜、轉錄調節因子、共可及模塊，以及以細胞類型特異性方式進行的峰-基因鏈接。該研究開發了使用峰-基因鏈接的多模態集成和檢測調節模塊的方法。研究發現，AD風險位點在小膠質細胞增強劑和特定TFs (包括SPI1、ELF2和RUNX1)中富集。作者檢測到9628個細胞類型特異性ATACQTL位點，將其與峰-基因鏈接結合起來，優先考慮AD變體調控回路。該研究報道了神經膠質細胞AD晚期和神經元AD早期調控模塊的可及性差異。引人注目的是，晚期阿爾茨海默病大腦顯示出全局表觀基因組失調，表明表觀基因組侵蝕和細胞身份喪失。

　　【15】2023年9月27日，上海交通大學瞿介明、諸江、李慶云及陳賽娟共同通訊在Cell 在線發表題為“Systemic immune profiling of Omicron-infected subjects inoculated with different doses of inactivated virus vaccine”的研究論文，該研究報道了對接種不同劑量滅活疫苗的Omicron感染受試者的全身免疫分析結果。在2022年上海爆發的Omicron疫情期間，該研究招募了122名未接種或接種了兩劑或三劑COVID-19滅活疫苗的感染成人和50名未感染的對照組，并對他們的外周血樣本進行了41-plex CyTOF、RNA-seq和Olink的綜合分析。HLA-DRhi經典單核細胞、非經典單核細胞和Th1樣Tem的頻率有增加的趨勢，而Treg的頻率有降低的趨勢，并且它們以疫苗劑量依賴的方式影響癥狀的發生。相互關系和機制分析表明，加強疫苗接種誘導單核細胞訓練，在Omicron感染時，單核細胞激活和成熟，而不是分化為髓源性抑制細胞。總的來說，該研究提供了關于加強疫苗接種如何闡明SARS-CoV-2變體的保護性免疫的見解。

　　【16】2023年9月22日，清華大學陳浩東團隊在Cell 在線發表題為“Amyloplast sedimentation repolarizes LAZYs to achieve gravity sensing in plants”的研究論文，該研究報道了重定向的重力刺激觸發絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)信號介導的擬南芥根小柱細胞中基本極化的LAZY蛋白磷酸化。LAZY的磷酸化增加了其與淀粉體表面葉綠體外膜(TOC)蛋白的幾個轉座子的相互作用，促進了淀粉體上LAZY蛋白的富集。淀粉質體沉積隨后引導LAZY遷移到小柱細胞的質膜下部，在那里LAZY誘導生長素不對稱分布和根的差異生長。總之，這項研究為淀粉-statolith假說提供了分子解釋：細胞器運動觸發分子極性形成。

　　【17】2023年9月20日，復旦大學張永振團隊在Cell 在線發表題為“Host traits shape virome composition and virus transmission in wild small mammals”的研究論文，該研究通過對來自中國4個棲息地的2443種野生蝙蝠、嚙齒動物和鼩鼱的內臟和糞便樣本進行meta轉錄組測序，共鑒定出669種病毒，其中包括534種新病毒，從而大大擴展了哺乳動物病毒組。該研究分析揭示了高水平的系統發育多樣性，確定了跨物種病毒傳播事件，闡明了病毒起源，并在哺乳動物宿主中確定了無脊椎動物病毒病例。宿主順序和樣本大小是影響病毒組成和病毒溢出模式的最重要因素。鼩鼱攜帶的病毒非常豐富，包括許多與多器官分布的無脊椎動物相關的病毒，而嚙齒動物攜帶的病毒具有更大的宿主跳躍能力。

　　【18】2023年9月12日，中國科學院深圳先進技術研究院李漢杰課題組聯合深圳市寶安區婦幼保健院、深圳大學、上海交通大學和復旦大學等單位在Cell 期刊上發表了題為“An immune cell atlas reveals the dynamics of human macrophage specification during prenatal development”的文章，該研究通過構建人類產前免疫細胞發育的時空動態圖譜，揭示了多種巨噬細胞亞型在發育過程中的分化起源、空間定位、功能特征及轉錄調控機制。

　　【19】2023年9月11日，北京大學杜鵬團隊在Cell 在線發表題為“Spatiotemporal insight into early pregnancy governed by immune-featured stromal cells”的研究論文，該研究表明，使用scStereo-seq技術可以用于對不同的免疫細胞、內皮細胞、滋養細胞和蛻膜基質細胞(DSCs)組裝的動態功能蛻膜中心進行空間可視化和定義。該研究揭示了DSC的轉分化軌跡，并令人驚訝地發現了一種雙特征類型的免疫特征DSC (iDSCs)。該研究發現未成熟的DSCs在脫細胞化起始過程中吸引免疫細胞并在間充質上皮過渡中心誘導蛻膜血管生成。iDSCs分別促進免疫細胞募集和抑制，控制血管形成，促進免疫細胞聚集和血管中心的細胞溶解，從而在后期建立個體穩態。有趣的是，功能失調和空間紊亂的iDSCs導致免疫細胞在血管中樞的異常積聚，從而破壞了個體樞紐的規范，最終導致DBA/2-交配CBA/J小鼠的妊娠并發癥。

　　【20】2023年9月4日，中國農業大學劉金華及中國科學院微生物研究所高福共同通訊在Cell 在線發表題為”Airborne transmission of human-isolated avian H3N8 influenza virus between ferrets“的研究論文，該研究證明了H3N8病毒能夠在器官型正常人支氣管上皮細胞(NHBE)和肺上皮細胞(Calu-3)中有效地感染和復制。因此，需要及時檢測病毒表型特征、診斷并通知疑似感染H3N8禽流感病毒的個體，以確保能夠追蹤、隔離接觸者，并在必要時進行治療，以控制傳播并防止流行病/大流行的發展。

　　【21】2023年8月21日，北京大學張澤民、王東方、朱琳楠及中國科學技術大學彭慧共同通訊在Cell 在線發表題為“A pan-cancer single-cell panorama of human natural killer cells”的研究論文，該研究為了描述它們在腫瘤微環境中的表型和功能多樣性，對716例癌癥患者的NK細胞進行了綜合單細胞RNA測序分析，涵蓋24種癌癥類型。該研究以腫瘤類型特異性的方式觀察到NK細胞組成的異質性。值得注意的是，該研究已經確定了一組腫瘤相關的NK細胞，它們在腫瘤中富集，顯示出受損的抗腫瘤功能，并且與不良預后和對免疫治療的抵抗有關。特定的髓細胞亞群，特別是LAMP3+樹突狀細胞，似乎介導NK細胞抗腫瘤免疫的調節。總之，該研究提供了基于NK細胞的癌癥免疫的見解，并強調了NK細胞亞群作為治療靶點的潛在臨床應用。

　　【22】2023年8月9日，首都師范大學何奕騉及弗萊堡大學Ralf Reski共同通訊在Cell 在線發表題為“Adaptive evolution of the enigmatic Takakia now facing climate change in Tibet”的研究論文，該研究在海拔4000米以上的地區記錄了有記錄以來最急劇的氣溫上升(2010-2021年)，引發了具有高度適應性的高海拔藻苔(Takakia lepidozioides )的減少。其新測序的基因組包含27,467個蛋白質編碼基因，包括對非生物脅迫的獨特適應，并在正選擇下包含最多的快速進化基因。6500萬前發生的印歐板塊碰撞使喜馬拉雅地區快速抬升，實驗基地的氣溫驟降紫外線輻射增強，該研究發現了Takakia 對這些環境變化的一些分子適應。令人驚訝的是，在更溫暖的環境中，特定的形態特征可能早于1.65億年前就出現了。經過近4億年的進化和恢復，這個物種現在正面臨滅絕。

　　【23】2023年7月28日，中國科學院遺傳與發育生物學研究所李紅菊團隊在Cell在線發表題為“Central-cell-produced attractants control fertilization recovery”的研究論文，該研究報道了在擬南芥中，當協同依賴的吸引失敗或被攜帶不育精子細胞的花粉管終止時，中心細胞分泌肽SALVAGER1和SALVAGER2以定向方式吸引花粉管。總之，該研究成果回答了一個百余年來遺留的生物學問題——植物受精失敗后，如何“自救”以確保繁衍：植物雙受精失敗后，胚珠為何仍會持續吸引花粉管的科學問題，為了解自然界某些物種在進化中丟失助細胞的原因提供了線索。更重要的是，該發現為人工授粉挽救瀕危植物提供了理論支持，對于人工授粉挽救瀕危植物的實踐具有指導意義。

　　【24】2023年7月26日，南京農業大學及中國農業科學院等多單位合作，萬建民，吳傳銀及王海洋共同通訊在Cell 在線發表題為“A natural gene drive system confers reproductive isolation in rice”的研究論文，該研究報道了一個控制秈粳雜交稻雄性配子不育的主要基因座RHS12的鑒定。該研究發現RHS12由兩個基因(iORF3/DUYAO和iORF4/JIEYAO)組成，這兩個基因賦予RHS12-i型雄性配子優先傳遞給后代，從而形成自然的基因驅動。DUYAO編碼一種線粒體靶向蛋白，該蛋白與OsCOX11相互作用觸發細胞毒性和細胞死亡，而JIEYAO編碼一種蛋白，該蛋白通過直接物理相互作用將DUYAO轉至自噬體降解，從而使DUYAO解毒。進化軌跡分析表明，該系統可能是在AA基因組稻枝中從頭形成的，并對水稻不同譜系之間的生殖隔離(RI)起了重要作用。總之，該研究結果為RI的遺傳基礎提供了機制見解，并為雜交水稻育種的戰略設計提供了見解。

　　【25】2023年7月12日，中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心（神經科學研究所）研究員李澄宇、劉志勇、青年研究員孫怡迪、副研究員沈志明，華大生命科學研究院研究員徐訊、劉龍奇、黎宇翔，臨港實驗室研究員魏武，騰訊AI Lab AI醫療首席科學家姚建華研究員共同通訊在Cell 在線發表題為“Single-cell spatial transcriptome reveals cell-type organization in the macaque cortex”的研究論文，該研究利用大規模單核RNA測序和143個獼猴皮質區域的空間轉錄組學分析，獲得了264種轉錄組定義的皮質細胞類型的綜合圖譜，并繪制了它們在整個皮質的空間分布。該研究表征了谷氨酸能、氨基丁酸能和非神經元細胞類型的皮質層和區域偏好，以及細胞類型組成和鄰里復雜性的區域差異。值得注意的是，作者發現了視覺和體感系統中各種細胞類型的區域分布與區域等級水平之間的關系。來自人類、獼猴和小鼠皮層的轉錄組學數據的跨物種比較進一步揭示了靈長類特異性細胞類型在第4層富集，其標記基因以區域依賴的方式表達。該研究為理解靈長類動物大腦的進化、發育、衰老和發病機制提供了細胞和分子基礎。

　　【26】2023年7月7日，中國科學院深圳先進技術研究院葉克強、上海交通大學李丹及武漢大學張振濤共同通訊在Cell 在線發表題為“Development of an α-Synuclein positron emission tomography tracer for imaging synucleinopathies”的研究論文，該研究報道了一種腦滲透和快速沖洗的PET示蹤劑[18F]-F0502B，該示蹤劑對α-Syn具有高結合親和力，但對Aβ或Tau原纖維沒有親和力，并且在腦切片中優先結合α-Syn聚集體。通過對幾種小鼠模型和人類受試者的體外原纖維、神經元內聚集體和神經退行性疾病腦切片進行多次反篩選，[18F]-F0502B圖像顯示了小鼠和非人靈長類PD模型大腦中的α-Syn沉積。進一步通過冷凍電鏡測定了α-Syn原纖維-F0502B配合物的原子結構，并通過配體間相互作用發現F0502B在原纖維表面通過強烈的非共價鍵網絡平行對角堆疊。綜上，[18F]-F0502B是一種很有前景的先導化合物，用于突觸核蛋白病中聚集的α-Syn的成像。

　　【27】2023年6月27日，美國希望之城國家醫療中心貝克曼研究所陳建軍、蘇瑞及上海交通大學夏強共同通訊（趙之聰、卿瑩和董磊為該研究的共同第一作者）在Cell 在線發表了題為“QKI shuttles internal m7G-modified transcripts into stress granules and modulates mRNA metabolism”的研究論文，該研究報道了m7G內部的mRNA被Quaking protein (QKIs)選擇性識別。通過轉錄組分析/繪制內部m7G甲基組和QKI結合位點，該研究確定了1000多個具有保守的“GANGAN (N = a /C/U/G)”基序的高置信度m7G修飾和QKI結合的mRNA靶標。引人注目的是，QKI7(通過C端)與應激顆粒(SG)核心蛋白G3BP1相互作用，并將內部m7G 修飾的轉錄物轉運到SGs中，以調節mRNA在應激條件下的穩定性和翻譯。具體來說，QKI7降低了Hippo信號通路中必需基因的翻譯效率，從而使癌細胞對化療敏感。總的來說，該研究將QKIs描述為mRNA內部m7G結合蛋白，可調節靶mRNA代謝和細胞耐藥性。

　　【28】2023年6月27日，中國科學院遺傳發育所高彩霞團隊在Cell 在線發表了題為“Discovery of deaminase functions by structure-based protein clustering”的研究論文，該研究使用AlphaFold2來預測并隨后基于預測的結構相似性對整個蛋白質家族進行聚類。研究選擇脫氨酶蛋白來分析和鑒定許多以前未知的特性。該研究發現在Ddda-like進化枝中的大多數蛋白質不是雙鏈DNA脫氨酶。該研究設計了最小的單鏈特異性胞嘧啶脫氨酶，使有效的胞嘧啶堿基編輯器(CBE)可被包裝到單個腺相關病毒(AAV)中。重要的是，研究從這個分支中分析了一種脫氨酶，它在大豆植物中進行了強有力的編輯，這在以前是CBEs無法獲得的。這些發現的脫氨酶，基于人工智能輔助的結構預測，極大地擴展了堿基編輯器在治療和農業應用中的效用。

　　【29】2023年6月26日，英國塞恩斯伯里實驗室馬文勃及中國科學院生物物理研究所王艷麗共同通訊在Cell 在線發表題為“Pathogen protein modularity enables elaborate mimicry of a host phosphatase”的研究論文，該研究發現，在多個疫霉菌效應物中，一個由特定的(L)WY-LWY組合形成的功能模塊，可以有效地在植物宿主中募集絲氨酸/蘇氨酸蛋白磷酸酶2A (PP2A)核心酶。效應器-PP2A復合物的晶體結構表明，(L)WY-LWY模塊可以劫持宿主PP2A核心酶形成功能性全酶。雖然在氨基端共享PP2A相互作用模塊，但這些效應物具有不同的C端LWY單元，并調節宿主中不同的磷酸蛋白組。該研究強調了通過病原體的分子模擬和效應器庫中蛋白質模塊化促進的多樣化來分配必需宿主磷酸酶。

　　【30】2023年 6月26日，清華大學生命科學學院、清華-IDG/麥戈文腦科學研究院、清華-北大生命科學聯合中心吝易課題組與清華大學生命科學學院楊雪瑞課題組合作在Cell 發表題為“Circadian clocks are modulated by compartmentalized oscillating translation”的研究論文，該研究揭示了細胞中利用相分離協調蛋白質翻譯的精細時空調控，從而維持晝夜節律周期的分子機制。

　　【31】2023年6月19日，中國科學院成都生物研究所李家堂團隊在Cell在線發表題為“Large-scale snake genome analyses provide insights into vertebrate development”的研究論文，該研究利用大規模多組學技術與基因編輯等研究手段，全面揭示了蛇類起源及特有表型演化的遺傳機制。為了闡明蛇表型的遺傳基礎，研究人員收集并分析了來自12個蛇科的14個新生基因組。該研究還通過功能實驗研究了蛇類形態特征的遺傳基礎。該研究確定了基因、調控元件和結構變異，這些基因、調控元件和結構變異可能導致蛇的肢體喪失、細長的身體、不對稱的肺、感覺系統和消化適應的進化。此外，作者還確定了一些基因和調控元件，這些基因和調控元件可能影響了盲蛇的視覺、骨骼系統和飲食的進化，以及紅外敏感蛇的熱感受性。該研究為蛇和脊椎動物的進化和發展提供了見解。

　　【32】2023年6月15日，中國科學技術大學朱書，田志剛及耶魯大學Richard A. Flavell等團隊合作（何愷鑫、萬婷婷、王德財和胡冀同學為本論文的共同第一作者）在Cell 在線發表題為”Gasdermin D licenses MHCII induction to maintain food tolerance in small intestine“的研究論文，該研究發現IECs積累了一個不易識別的GSDMD的13-kD N端片段，該片段在響應膳食抗原時被caspase-3/7切割。與30-kD GSDMD裂解片段不同，IEC積累的GSDMD裂解片段易位到細胞核，誘導CIITA和MHCII分子的轉錄，進而誘導上小腸的Tr1細胞凋亡。用caspase-3/7抑制劑處理的小鼠、抗caspase-3/7切割的GSDMD突變小鼠、IECs中MHCII缺乏的小鼠和Tr1缺乏的小鼠都表現出食物耐受表型的破壞。總之，該研究支持GSDMD的差異切割可以被理解為控制小腸免疫與耐受的調節樞紐。

　　【33】2023年6月13日，復旦大學陳海威及耶魯大學Noah W. Palm共同通訊在Cell 在線發表題為”Highly multiplexed bioactivity screening reveals human and microbiota metabolome-GPCRome interactions“的研究論文，該研究開發了一種稱為PRESTO-Salsa的高度復用篩選技術，可以在96孔板的單孔中同時評估幾乎所有常規GPCR(>300個受體)。使用PRESTO-Salsa，該研究篩選了1041種與人類相關的抗GPCRome代謝物，并發現了以前未報道的內源性、外源性和微生物GPCR激動劑。接下來，該研究利用PRESTO-Salsa生成了435種人類微生物組菌株來自多個身體部位的微生物組-GPCR相互作用圖譜，揭示了跨組織GPCR相互作用和口腔牙齦卟啉單胞菌分泌的牙齦蛋白酶K通過靶向K290來激活宿主孤兒CD97/ADGRE5的保守模式。這些研究因此建立了一種高度多重的生物活性篩選技術，并揭示了人類、飲食、藥物和微生物群代謝組-GPCR相互作用的多樣化景觀。

　　【34】2023年6月9日，清華大學劉俊杰和王家共同通訊在Cell 在線發表題為“Structural RNA components supervise the sequential DNA cleavage in R2 retrotransposon”的研究論文，該研究確定了具有核糖體DNA靶RNA和調控RNA的真核R2逆轉座子的冷凍電鏡結構。結合生化和測序分析，該研究揭示了識別和切割所必需的兩個DNA區域，Drr和Dcr。3’調控RNA與R2蛋白的結合加速了第一鏈的切割，阻斷了第二鏈的切割，并開始了從3’尾部開始的逆轉錄。通過逆轉錄去除3 '調控RNA允許5 '調控RNA結合并啟動第二鏈切割。綜上所述，該研究工作解釋了DNA識別和RNA監督的序列逆轉錄轉座子R2機制，為逆轉座子和應用重編程提供了見解。

　　【35】2023年6月8日，西湖大學吳建平、南京醫科大學劉明兮及浙江大學桂淼共同通訊在Cell 在線發表題為“Structures of sperm flagellar doublet microtubules expand the genetic spectrum of male infertility”的研究論文，該研究利用冷凍電鏡(cryo-EM)和基于人工智能(AI)的建模技術，確定了小鼠和人類精子DMT的結構，并建立了小鼠精子DMT 48 nm重復的原子模型。總之，該工作為理解精子運動的結構基礎以及相關男性不育癥的診斷和治療提供了重要線索。

　　【36】2023年6月8日，中國科學院遺傳與發育生物學研究所陳宇航，周儉民及王偉共同通訊在Cell 在線發表題為“WeiTsing, a pericycle-expressed ion channel, safeguards the stele to confer clubroot resistance”的研究論文，該研究報道了從擬南芥中分離到的廣譜根腫病抗性基因WeiTsing (衛青，WTS)。Pb 感染后，WTS在中柱鞘中被轉錄激活，以防止病原體在中柱上定植。攜帶WTS基因的甘藍型油菜對鉛具有較強的抗性。WTS編碼一種定位于內質網(ER)的小蛋白，其在植物中的表達可誘導免疫應答。冷凍電子顯微鏡(cryo-EM)結構揭示了一種以前未知的具有中心孔的五聚體結構。電生理分析表明，WTS是一個鈣滲透的陽離子選擇通道。結構導向誘變表明通道活性是觸發防御的嚴格要求。總之，該研究揭示了一種類似于在中柱鞘中觸發免疫信號的抵抗體的離子通道。

　　【37】2023年5月15日，德州農工大學何平及單立波共同通訊（華中農業大學于曉為第一作者）在Cell 在線發表題為“A phospho-switch constrains BTL2-mediated phytocytokine signaling in plant immunity”的研究論文，該研究通過在擬南芥中部署基于RNAi的遺傳篩選，鑒定了BAK1

　　-to

　　-life 2 (BTL2)，這是一種未知的受體激酶，可檢測BAK1/SERK4的完整性。當BAK1/SERK4受到干擾時，BTL2通過激活Ca2+通道CNGC20以激酶依賴的方式誘導自身免疫。為了彌補BAK1缺失，BTL2與多種植物細胞因子形成受體復合物，導致由輔助NLR ADR1家族免疫受體介導的強效植物細胞因子反應，表明植物細胞因子信號是連接PRR和NLR介導的免疫的分子鏈接。值得注意的是，BAK1通過特異性磷酸化抑制BTL2的激活以維持細胞完整性。因此，BTL2作為監測變阻器，感知BAK1/SERK4免疫共受體的擾動，促進NLR介導的植物細胞因子信號傳導，以確保植物免疫。總之，該研究結果對于深入理解植物自身免疫及多種植物細胞因子信號傳導機制具有重要意義。

　　【38】2023年5月12日，清華大學戴瓊海、祁海及吳嘉敏共同通訊在Cell在線發表了題為“Two-photon synthetic aperture microscopy for minimally invasive fast 3D imaging of native subcellular behaviors in deep tissue”的研究論文，該研究利用TPM中的合成孔徑雷達的概念，在毫秒尺度上實現了亞細胞動力學的像差校正3D成像，深度組織中超過100,000個大體積，光漂白減少了三個數量級。利用其優勢，該研究發現了創傷性腦損傷后通過遷移體產生的直接細胞間通訊，可視化了小鼠淋巴結生發中心的形成過程，并表征了小鼠視覺皮層中的異質細胞狀態，為活體成像在整體水平上理解生物系統的組織和功能開辟了一個視野。

　　【39】2023年5月11日，昆明理工大學譚韜，陳永昌，季維智，中國人民解放軍總醫院劉兵及德克薩斯大學西南醫學中心吳軍在Cell 在線發表題為“Ex utero monkey embryogenesis from blastocyst to early organogenesis”的研究論文，為了解決這一問題，該研究開發了一種嵌入式3D培養系統，可以在受精后的25天內延長食蟹猴胚胎的體外培養時間。形態學、組織學和單細胞RNA測序分析表明，體外培養的猴子胚胎在很大程度上再現了體內發育的關鍵事件。通過這個平臺，研究人員能夠描繪出猴子神經誘導、側板中胚層分化、卵黃囊造血、原始腸道和原始生殖細胞樣細胞發育的譜系軌跡和遺傳程序。該研究開發的嵌入式3D培養系統為從囊胚到早期器官發生的猴子胚胎生長和靈長類動物胚胎體外發生的研究提供了一個強大的可復制平臺。

　　【40】2023年5月11日，中國科學院動物研究所王紅梅、李偉、郭帆和賓夕法尼亞大學Nicolas Plachta團隊合作在Cell 在線發表了題為“Neurulation of the cynomolgus monkey embryo achieved from 3D blastocyst culture”的研究論文，該研究建立了一個三維(3D)長時間體外培養(pIVC)系統，支持食蟹猴胚胎在受精后7~25天的發育。通過單細胞多組學分析，該研究發現pIVC胚胎形成了三個胚層，包括原始生殖細胞，并在原腸胚形成階段建立了適當的DNA甲基化和染色質可及性。此外，pIVC胚胎免疫熒光證實神經嵴形成、NT閉合和神經祖細胞區域化。最后，該研究證明了pIVC胚胎的轉錄譜和形態遺傳學類似于體內發育階段相似的食蟹動物和人類胚胎的關鍵特征。因此，該項工作描述了一個通過先進的原腸胚形成和早期神經發育來研究非人靈長類動物胚胎發生的系統。

　　【41】2023年5月4日，中國農業科學院黃三文團隊在Cell 在線發表題為“Phylogenomic discovery of deleterious mutations facilitates hybrid potato breeding”的研究論文，該研究表明有害突變的系統發育基因組發現有助于雜交馬鈴薯育種。利用92個茄科及其姊妹分支物種的全基因組系統發育，該研究采用進化策略來識別有害突變。深層系統發育揭示了高度受限位點的全基因組景觀，占基因組的2.4%。基于二倍體馬鈴薯多樣性小組，作者推測出367499種有害變異，其中50%發生在非編碼位點，15%發生在同義位點。與直覺相反，具有相對較高純合有害負荷的二倍體系可以成為自交系發育更好的起始材料，盡管其生長不那么旺盛。包含推測的有害突變將基因組產量預測的準確率提高24.7%。該研究深入揭示了有害突變的全基因組發病率和特性，闡明了它們對育種的深遠影響。

　　【42】2023年4月24日，清華大學向燁及中國科學院生物物理研究所章新政共同通訊在Cell 在線發表題為“Structure of Semliki Forest virus in complex with its receptor VLDLR”的研究論文，該研究揭示了塞姆利基森林病毒及其受體VLDLR復合體的結構。該研究檢查了SFV與VLDLR配合物的結構。該研究發現VLDLR通過其遠端LDLR A類(LA)重復序列結合SFV的多個E1-DIII位點。在VLDLR的LA重復序列中，LA3與SFV的結合親和力最好。高分辨率結構表明，LA3通過378 ?2的小表面積與SFV E1-DIII結合，主要在界面處進行鹽橋作用。與單個LA3s的結合相比，LA3周圍連續的LA重復促進了與SFV的協同結合，在此過程中，LA進行旋轉，允許在病毒粒子上的多個E1-DIII位點同時進行關鍵相互作用，并使來自不同宿主物種的VLDLR與SFV結合。

　　【43】2023年4月24日，中國科學院分子細胞科學卓越創新中心孟飛龍及上海交通大學葉菱秀共同通訊在Cell 在線發表題為“Mesoscale DNA feature in antibody-coding sequence facilitates somatic hypermutation”的研究論文，該研究表明抗體編碼序列中的中尺度DNA特征促進體細胞超突變。該研究發現易感性突變依賴于AID脫氨酶基序周圍的中尺度序列所決定的單鏈(ss) DNA底物靈活性。含有柔性嘧啶-嘧啶堿基的中尺度DNA序列可以有效地與AID的正電荷表面斑塊結合，從而產生優先的脫氨活性。CDR的高易變性在體外脫氨酶實驗中是可模仿的，并且在使用SHM作為主要多樣化策略的物種中是進化保守的。作者證明了中尺度序列的改變調節了小鼠體內的易變性，并促進了其他寒冷區域的突變。該研究結果表明，抗體編碼序列在指導超突變中具有非編碼作用，為優化抗體發現的人源化動物模型的合成設計鋪平了道路，并解釋了淋巴瘤中AID的突變模式。

　　【44】2023年4月11日，北京大學高寧及李寧寧共同通訊在Cell 在線發表題為“Structural basis of membrane skeleton organization in red blood cells”的研究論文，該研究揭示了血紅細胞膜骨架組織的結構基礎。該研究報道了天然血影蛋白-肌動蛋白連接復合物(來自豬紅細胞)（一種特化的短F-肌動蛋白，作為膜骨架的中心組織單位）的冷凍電鏡結構。當α-/β-adducin異質四聚體結合到F-肌動蛋白的倒刺端作為一個柔性帽時，tropomodulin（原肌球調節蛋白）和SH3BGRL2一起在尖端形成一個絕對帽。連接復合物通過dematin中間層的環狀結構與原肌球蛋白（tropomyosin）在其整個長度上的周期性相互作用而加強。這項工作為理解膜骨架的組裝和動力學提供了一個結構框架，并為其他F-肌動蛋白系統中各種無處不在的F-肌動蛋白結合因子的