《細胞》（Cell）在線發表了南京農業大學動物醫學院/前沿交叉研究院聯合中山大學醫學院等國內外單位完成的研究論文。該研究發現13個病毒科中的102種病毒可以感染哺乳動物，其中65種病毒為首次發現存在于哺乳動物中。該成果極大的拓展了對多種野生動物攜帶病毒多樣性的認識，為人類和家畜疫病預警和防控提供了重要科學依據。
論文共同通訊作者、南京農業大學教授粟碩介紹，據統計，70%以上的人類傳染病病原來自動物。“研究與人類或者家畜可能密切接觸的野生動物的病毒攜帶情況及其多樣性，對人類和家畜新發傳染病的防控至關重要。”
該聯合團隊對來自中國20個省份18個物種共1941只哺乳動物的樣本展開了系統的病毒轉錄組研究。結果發現，13個病毒科中的102種病毒可以感染哺乳動物，其中65種病毒為首次發現存在于哺乳動物中，例如：海貍鼠輪狀病毒、穿山甲瘟病毒、竹鼠札幌病毒等。
野生動物中攜帶的與脊椎動物相關的病毒 南京農大供圖
這項研究發現了21種對人類和家畜具有潛在高傳播風險的病毒，如豪豬丁型冠狀病毒、牛副流感病毒3型、哺乳動物正腮腺炎病毒5型、H9N2亞型流感病毒等。
他們還發現，貉、果子貍、竹鼠、豪豬、刺猬等多種野生動物可攜帶冠狀病毒，其中腹瀉的貉樣本中攜帶的四株新型犬冠狀病毒（Canine coronavirus，CCoV）與最新報道的可導致人類疾病的重組CCoV毒株CCoV-HuPn-2018的基因同源性達93.65%-94.27%。基于病毒刺突蛋白中的非重組區域分析發現，這四株新的貉CCoV形成了一個單獨的譜系。因此，這種冠狀病毒的跨物種傳播風險值得關注。
該研究還發現了多種高豐度的輪狀病毒，包括A、B、C、D和I群。兔、貉、豪豬和海貍鼠等動物均攜帶輪狀病毒A群。同時高豐度的輪狀A群、C群和I群的共感染在腹瀉的貉中發現，提示輪狀病毒存在跨物種傳播和公共衛生風險。
貉CCoV的基因組重組與進化分析 南京農大供圖
論文共同通訊作者、中山大學教授施莽指出，盡管這些野生動物不一定是這些高風險病毒的存儲宿主，但可能會作為中間宿主通過跨物種傳播把病原體傳播給人類和家畜。
該研究結果還表明，一些看似健康的動物身上也可以攜帶和人類致病密切相關的病毒，并且在不同物種之間持續傳播。“這再次凸顯了交易、食用以及密切接觸野味動物的風險，揭示野生動物作為疾病出現的潛在驅動因素的重要性。”粟碩說，研究結果可為新發傳染病防控關口前移等重大疫病防控政策制定提供新的思路。
野生動物攜帶潛在人畜共患病病毒與宿主之間的關聯分析 南京農大供圖
據施莽介紹，這項成果主要有兩點重要突破。
首先，人類歷史上所有造成大流行疫病的病毒，大多來源于野生動物。之前，人們主要聚焦于蝙蝠這一類動物所攜帶的病毒，對于其它野生動物的病毒攜帶情況和多樣性缺乏系統研究。針對這些與人類有密切接觸的野生動物的病毒攜帶情況展開詳細的調查與研究，研究結論無論對于動物健康養殖，還是人類公共衛生疫病防控來說都具有十分重要的參考價值。
其次，以往采用的經典檢測方法對于已知的單一病原檢測來說是高效的，但傳統方法對于未知病原的診斷束手無策。“我們采用高通量宏轉錄組學的方法，能夠快速有效地揭示這些不同來源樣本中包括病毒、細菌、真核生物在內的‘全感染組’，并通過生物信息學分析篩選潛在的威脅人類健康的病原體。”施莽說。
這是南京農業大學首次以第一通訊作者單位在CELL發表研究成果。論文共同通訊作者還有澳大利亞悉尼大學教授愛德華·霍爾姆斯。南京農業大學博士研究生何婉婷、中山大學博士研究生侯新、南京農業大學碩士研究生趙晉為論文共同第一作者。該研究得到國家自然科學基金優青基金、國家重點研發計劃項目等支持資助。