DNA測序數據顯示新混合型大腸桿菌菌株是德國疫情的致病原因
使用Ion PGM?的進一步分析將確認數據,以研制用于篩選樣本的準確檢測試劑盒
2011年6月2日,美國加利福尼亞州卡爾斯巴德市——Life Technologies公司今天宣布,使用Ion Personal Genome Machine (PGM?)與德國明斯特大學醫院合作進行的DNA測序得出的初步數據有力地表明,一種新混合型致病大腸桿菌菌株是導致德國致命疫情的原因。
從DNA測序儀獲得的數據顯示,典型的基因存在于兩種不同類型的大腸桿菌中:腸聚集性大腸桿菌(EAEC)和腸出血性大腸桿菌(EHEC)。研究人員目前正通過Ion PGM?對結果進行進一步的數據分析和確認。這些結果有助于了解這種細菌的侵略性并阻止疫情進一步爆發。
“快速全基因組測序結果使我們在幾天內發現細菌毒力性狀的獨特組合……使德國經過此次疫情爆發克隆了一種來自不同大腸桿菌致病變型的獨特混合類型,”德國明斯特大學醫院衛生研究所德國國家溶血尿毒綜合癥(HUS)咨詢實驗室的科學家Alexander Mellmann博士說。
Life Technologies公司位于德國達姆施塔特市的實驗室收集的數據將被明斯特大學醫院的科學家用于開發更好的測試手段,以積極地識別這種表現為腎衰竭和出血性腹瀉的傳染性疾病。這是自疫情爆發以來人們第一次能夠詳細研究這種菌株致命性如此之強的原因。
Life Technologies公司負責此次測序工作的Simone Guenther博士說:“此次疫情爆發的嚴重性意味著一定要速戰速決。我們破紀錄地迅速為明斯特大學醫院提供了數據。在先前的疫情爆發中我們肯定需要比現在長得多的時間來達到這一階段。”
為了防止細菌的進一步傳播,Life Technologies公司本周開始向歐洲的實驗室運送其定制的大腸桿菌檢測試劑盒,用于篩選疫情爆發中心被認為污染的食物。此次歐洲的疫情爆發已造成17人死亡,1000多人感染。
這些試劑盒是第一道防線,用以檢測致病性大腸桿菌是否存在。之后研究人員會使用更細化的試劑盒進行第二輪檢測。未來幾天內,一旦測序數據分析完畢,Life Technologies公司便將開發用于檢測德國這種混合型菌株的新定制試劑盒。公司可在一周內開發出定制的化驗劑。
運往歐洲的試劑盒是大批Life Technologies公司研制的分子化驗劑的一部分。這些產品可準確檢測出絕大多數危害人類的病原體。Ion PGM?是一種采用半導體技術的DNA個體化操作基因組測序儀,它可以在短短兩個小時內完成高通量和高精確度的DNA測序。用于此次測序的DNA樣本采集自一位患有這種疾病的病人。
Ion Personal Genome Machine測序儀僅可用于研究用途。
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