Nature：測序人類皮膚微生物組解析真菌多樣性

　　歷史上，人類很久以前就會利用真菌做面包和啤酒了，然而我們對居住在自己身體上的真菌卻并十分不了解。

　　現在，美國國立衛生研究院(NIH)的研究人員，首次解析了人類皮膚上的真菌多樣性。他們對健康人不同皮膚部位的真菌 DNA 進行了測序，明確了皮膚上正常真菌群落的構成，為研究真菌類皮膚病打下了基礎。相關研究論文刊登在了近期出版的《自然》(Nature)雜志上。

　　人類皮膚表面的真菌、細菌和病毒組成了一個復雜的微生物生態系統，稱為“皮膚微生物組”。真菌生長慢而且難于培養，這大大影響了相關皮膚病的診斷和治療。 NIH 旗下的人類基因組研究所(NHGRI)和癌癥研究所(NCI)，對 DNA 測序技術進行了優化，在 ABI 3730xl 和羅氏 454 測序平臺上對皮膚真菌群落進行了分析。

　　研究人員發現，Malassezia 屬的真菌在頭部和軀干占據優勢。而在帶有多種細菌的手部，真菌種類卻相對較少。與此相反的是，腳部(包括腳趾甲、腳跟和腳趾)的真菌多樣性非常高。研究人員希望，通過解析人體上的真菌和細菌生態系統，更好的理解相關皮膚病。

　　研究人員在十位健康成年人身上收集了十四個部位的樣本，并對樣本中的真菌進行 DNA 測序。他們檢測了被稱為系統發育標記的 DNA 片段，以鑒別樣品中真菌的種類。 DNA 測序技術最終生成了超過五百萬個標記，代表了八十多種真菌。而傳統的培養方法只能鑒定出18種真菌。研究人員指出，這是因為 DNA 測序可以檢測到那些難于培養的真菌種類。

　　研究顯示，腳跟部感染的不同個體，具有相同的腳跟真菌群體。而對于腳趾甲感染而言，不同個體的腳趾甲真菌群體差異很大。研究人員還發現， Ascomycetes 和 Basidiomycetes 真菌是 14 個部位上共有的正常真菌。所有健康志愿者的皮膚上都存在 Malassezia 真菌，這種最常見的真菌出現在 11 個部位上。

　　研究人員表示，以 DNA 測序為基礎的鑒定方法，能夠解析皮膚上真菌群落的構成。研究發現，真菌多樣性依賴于皮膚所在的部位，與取樣個體關系不大。這項研究主要針對容易發生真菌性皮膚病的部位。

　　研究顯示，腳部的真菌組成最為復雜，約有80種真菌，其他部位則比較少。研究人員將同一人身上的真菌多樣性與細菌進行比較，發現手臂細菌多樣性高而真菌多樣性低，而腳部則剛好相反。另外，在身體主要部位的皮膚上，細菌和真菌的多樣性都不高。

　　研究人員還發現，同一人身體左右兩側的真菌群落結構非常相似。而且皮膚上的真菌群落相當穩定，在相隔三個月的兩次檢測中差異不大。