科學家們對細菌的一種限制性內切酶進行研究,揭示了解旋酶沿DNA做長距離移動的機制,展示了這種酶對ATP能源的高效利用,相關論文刊登在了近期出版的《科學》(Science)雜志上。
解旋酶helicase是一類分布廣泛的三磷酸腺苷酶(ATPase),在基因組中具有重要的功能。人類中的一些癌癥就與細胞的解旋酶有關。德國 Bristol大學和Dresden工業大學的研究人員發現,解旋酶能夠將化學能和機械能巧妙的結合起來加以利用。這項研究深入解析了解旋酶的詳細作用機制,將有助于加深人們對解旋酶作用的了解,幫助研究者們開發新的相關技術和治療方法。
DNA解旋酶沿著DNA移動,并同時解開雙螺旋,露出單鏈DNA以便進行修復或復制。此前人們普遍認為,這一過程伴隨著化學能源ATP的消耗,并因此將解旋酶視為一種分子馬達。
在這項新研究中,Ralf Seidel及其團隊通過單分子熒光顯微鏡,觀察了EcoP15I限制性內切酶在病毒(噬菌體)DNA上的移動。他們對解旋酶進行了熒光標記,在伸展一個 DNA分子的同時,對單個解旋酶的移動進行觀察。此外,研究人員還通過高分辨率的熒光光譜法,分析了上述過程中蛋白構造的動態變化,以及ATP消耗的動力學情況。
令人驚訝的是,這種解旋酶只在反應初期消耗ATP。研究顯示,解旋酶在與目標位點結合時,水解ATP進行構象改變。此后解旋酶在 DNA上的長距離移動,僅由熱運動(thermal motion)驅使,這種熱運動是指與周圍水分子的碰撞。這樣的機制形成了典型的“隨機行走”(random walk)模式,即蛋白向前和向后移動的幾率相同。
“我們的研究指出,解旋酶使用ATP能源進行構象改變,而不是用來解旋DNA。解旋酶在 DNA上的長程移動,并不需要使用ATP能源。這種隨機移動發生得很快,比許多ATP驅動馬達更有效率。我們認為,解旋酶經由這一高效節能的途徑沿著 DNA移動,這一機制可能也參與了DNA修復等其它過程。”文章的資深作者之一,生化教授Mark Szczelkun說。
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