基因組所合作研究揭開兩種家養水稻起源進化“篇章”
6月9日，在最新一期的PLOS Genetics上，來自中國科學院北京基因組研究所的吳仲義研究員和中山大學施蘇華教授發表了合作研究文章《水稻基因組兩種進化歷史：馴化基因的角色》(Two Evolutionary Histories in the Genome of Rice: the Roles of Domestication Genes)，揭開了兩種家養稻起源進化的重要篇章。 水稻是最重要的糧食作物之一，供養著超過三分之一的世界人口。在我國及周邊很多亞洲國家，水稻是關乎國家民生大計的重要命脈。而目前，家養稻共分為粳稻和秈稻兩種品系。粳稻主要生長分布于中國北部、日本、韓國等高緯度地區。而秈稻主要生長分布在中國南部、東南亞、印度等低緯度地區。水稻是人類從打獵采集的生活狀態轉到農業栽種的過程中，被人類馴化培育的重要植物物種。兩種家養水稻的起源和演化，一直是進化生物學家、歷史學家和考古學家所關心的熱點問題。 ......閱讀全文
昆明植物所在進化起源方向最新進展
在植物進化的特定時期，植物獲得了生產結構豐富且功能多樣的天然產物的能力，呈現出結構相似的天然產物集中于系統發育樹上近源物種的分布特征。而部分結構相似的天然產物卻零散地分布于系統發育樹上遠源物種中，如托品烷生物堿、類固醇和環烯醚萜等。當前，科學家主要通過單個酶的獨立進化來闡明天然產物零散的分布特征。實
科研人員首次深度解析全球瘤牛起源和進化
11月28日，西北農林科技大學動物科技學院雷初朝教授團隊繼2018年在解析東亞家牛祖先的基礎上，對全球瘤牛起源和進化深度解析，通過分析全球57個主要瘤牛品種354個樣本，從全基因組水平揭示全球瘤牛常染色體、父系和母系遺傳特征，系統闡述了全球瘤牛的起源遷移擴散路線。該研究成果最近在線發表于《自然-
后代變“祖先”？人工選擇成進化研究“干擾項”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502791.shtm作為我國特有的優良地方蜜蜂資源，東北黑蜂已經在黑龍江省生存了上百年。為了對東北黑蜂的特性加以更好地利用，揚州大學動物科學與技術學院教授吉挺團隊進行了多年深入研究。然而他們意外地發現，此
973首席科學家發現基因功能新起源
來自中科院昆明動物所的研究人員發現在哺乳動物的一個重要轉錄抑制因子CDYL基因中，新外顯子反復在不同哺乳動物譜系中發生，而且這些新外顯子能給該基因帶來很大的功能改變，這說明基因中新外顯子的出現也是增加蛋白多樣性和新功能起源的一種重要方式。這一研究成果公布在國際著名遺傳學刊物《Trends in Ge
遺傳發育所等在亞洲稻群體結構和演化研究中取得進展
亞洲栽培稻是世界上最重要也是最古老的糧食作物之一，在亞洲文明和日常生活中扮演著舉足輕重的角色。水稻起源問題也引起了廣泛的研究興趣。經過一個多世紀不同學科研究者的不斷探索，已經積累了大量水稻馴化起源知識。但水稻馴化是單次起源還是多次起源尚沒有統一結論。 美國農業部（USDA）種質資源庫在過去10
中國科學家主導國際大協作助力水稻精準育種
英國時間4月25日，《自然》雜志長文報道由中國農業科學院作物科學研究所牽頭，聯合國際水稻研究所、上海交通大學、華大基因、深圳農業基因組研究所、安徽農業大學、美國亞利桑那大學等16家單位共同完成的3000份亞洲栽培稻基因組研究。 該研究針對水稻起源、分類和馴化規律進行了深入探討，揭示了亞洲栽培稻
關于基因組的大小和進化介紹
1、基因組大小： 基因組大小是一個拷貝的單倍體基因組中DNA堿基對的總數。 基因組大小與原核生物和低等真核生物的形態復雜性呈正相關 [8]。然而，在軟體動物和上述所有其它高等真核生物之后，這種相關性已不再存在 [8]，主要是因為重復DNA的緣故。 2、基因組進化： 基因組不僅僅是生物體基
蝴蝶基因組大小進化進展－發現表型多樣性進化遺傳基礎
蝴蝶因其豐富的形態多樣性，自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一，近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型，已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。 中國科學院昆明動物研究所科研團隊在2015年完成所有蝴蝶模式種金鳳蝶及其
煙草和水稻cpDNA基因組成及特點
煙草和水稻（Oryza sativa）葉綠體全序列分析表明cpDNA基因組成有以下特點：1.基因組由兩個反向重復序列（IR）和一個短單拷貝序列（short single copy sequence, SSC）及一個長單拷貝序列（long single copy sequence, LSC）組成；2.
煙草和水稻葉綠體cpDNA基因組成特點
1.基因組由兩個反向重復序列（IR）和一個短單拷貝序列（short single copy sequence, SSC）及一個長單拷貝序列（long single copy sequence, LSC）組成；2.IRA和IRB長各10-24Kb，編碼相同，方向相反。3.cpDNA啟動子和原核生物的相
應用SNP芯片測基因組知起源地
歐洲的歷史上充滿著戰爭、入侵和移民，這些因素似乎可以徹底地將不同人種混合在一起。然而，美國和荷蘭科學家獨立進行的兩項最新研究表明，一個歐洲人的基因組信息足以表明他的地理起源，歐洲人的基因地圖和地理地圖間存在著一種映射關系。相關論文分別發表在《自然》和《當代生物學》雜志上。?領導其中一項研究的是美國加
應用SNP芯片測基因組知起源地
歐洲的歷史上充滿著戰爭、入侵和移民，這些因素似乎可以徹底地將不同人種混合在一起。然而，美國和荷蘭科學家獨立進行的兩項最新研究表明，一個歐洲人的基因組信息足以表明他的地理起源，歐洲人的基因地圖和地理地圖間存在著一種映射關系。相關論文分別發表在《自然》和《當代生物學》雜志上。 領導其中一項
《Cell》揭示基因組周期性的起源！
巴塞羅那生物醫學研究所（IRB Barcelona）的科學家發現，從酵母到人類，所有真核生物的基因組序列都具有周期性。這項發表在《細胞》雜志上的研究結果為基于自然選擇的相關研究提供了另辟蹊徑的新解釋。 研究人員證明，真核生物基因組序列周期性的生成對DNA損傷和修復過程具有重要意義。在細胞核內，
王文團隊發表3篇Science，在生命科學領域取得重大進展
2019年6月21日，西北工業大學王文團體同時發表了3篇Science 文章，這些研究使用基因組分析來解決主要反芻動物譜系之間的進化關系，確定參與頭帶進化的基因，并研究馴鹿如何適應北極地區漫長的日夜。這些研究使我們能夠更好地了解熟悉的家養奶牛，綿羊和鹿及其野生近緣種，并深入了解占據世界草原的羚羊
我國學者在野生稻基因解析和種質資源利用領域取得進展
圖普通野生稻和亞洲栽培稻泛基因組及進化分析 在國家自然科學基金項目（批準號：32388201）等資助下，中國科學院分子植物科學卓越創新中心韓斌院士團隊完成了145份亞洲栽培稻及普通野生稻的參考基因組級別的基因組組裝，繪制了高質量“野生稻-栽培稻泛基因組圖譜”，系統挖掘了普通野生稻廣泛的遺傳多樣
作物基因組學研究進展
摘要：農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１７年度主要農作物基因組
利用PLSM定向進化可為水稻育種提供遺傳新種質
遺傳變異是作物育種基礎。盡管近年來功能基因組研究為作物分子育種提供了大量主效改良位點/基因；但由于傳統誘變靶向性不足、突變隨機性較大等技術問題，在多數情況下，挖掘和鑒定主效基因最適等位型仍較為困難。如何在體內實現重要基因關鍵位點的飽和氨基酸突變是該類研究的難點問題。 2021年6月10日，安徽
昆明動物所新基因的功能起源和進化研究取得進展
基因復制是新基因和新功能產生的最主要的方式之一。然而，在分子水平，新產生的復制基因如何通過通路整合而獲得生物學功能以及產生適應性性狀卻并不清楚。 為了回答以上問題，中科院昆明動物研究所中德馬普進化基因組學青年科學家小組的博士生丁昀等在導師王文研究員的指導下，對黑腹果蠅亞群(Drosophi
基因組研究揭示歐洲馬鈴薯進化史
近日，來自德國、秘魯、英國和西班牙的一個國際研究團隊，對大量的馬鈴薯品種進行了測序，以了解更多關于現代歐洲馬鈴薯的歷史。在他們6月24日發表在Nature Ecology and Evolution上的論文中，該團隊描述了他們對馬鈴薯歷史的研究以及新發現。 過去的研究表明，馬鈴薯是在17世紀被
基因組測序揭示須鯨的罕見進化模式
單一物種如何演化成兩個新物種？進化學家給出的答案通常是地理隔離。不過，有時沒有地理隔離也能產生新的物種，這種罕見的情況被稱為同地物種形成（sympatric speciation）。根據瑞典和德國的最新研究成果，須鯨正是經歷了這種同地物種形成。 文章的共同第一作者、德國法蘭克福大學的Fritj
最新果蠅基因組測序，展現奇妙的進化
對真核生物進行全基因組測序在二十世紀還是一項了不起的大工程，直到2000年末人們還只完成了四項這樣的研究。不過自那以后，測序技術的飛速進步使全基因組測序對于許多研究團隊來說觸手可及，現在每隔不久就會涌現出一項新的測序成果。日前，維也納獸醫大學Christian Schl?tterer研究組的
家養動物基因交流研究取得進展
家養動物被人類成功馴化后，伴隨著人類遷徙至世界各地。在這個過程中，家養動物會與當地各種野生近緣種相遇，從而發生雜交促使基因交流的發生。中國科學院昆明動物研究所研究員張亞平、吳東東課題組近期利用大規模基因組數據，闡明了基因交流在牛屬動物的馴化以及環境適應中的重要作用，相關工作發表在Nature Eco
水稻孕穗期耐冷基因克隆與進化研究獲進展
近日，湖北省農業科學院糧作所與中國農業大學等單位合作完成的水稻孕穗期耐冷基因克隆與進化研究取得新進展，該研究成果文章《Stepwise selection of natural variations at CTB2 and CTB4a improves cold adaptation durin
基因組研究讓水稻育種走向精準設計
由中國主導的國際間科研大協作項目“3000份水稻基因組研究”26日結出碩果——北京時間當日凌晨1時，國際頂級學術期刊《自然》正式發表《3010份亞洲栽培稻基因組研究》。該研究針對水稻起源、分類和馴化規律進行了深入探討，揭示了亞洲栽培稻的起源和群體基因組變異結構，剖析了水稻核心種質資源的基因組遺傳
水稻RGA基因組規模的鑒定與分析
實驗概要本實驗對粳稻蛋白質數據庫進行BLASTP，獲得所有粳稻的RGA序列，對RGA進行分類，分別統計了各類RGA在不同染色體上的分布情況，對兩個亞種間RGA多態性進行了鑒定和開發。實驗步驟1. 水稻RGA的搜索搜集已報道的45個R基因，然后用它們對粳稻蛋白質數據庫進行BLASTP (參數取E
研究揭示水稻基因組－“垃圾－DNA”－的真相
對于動植物的 DNA 來說，僅有不到 5% 能夠翻譯成蛋白質，進行生命活動。而大部分 DNA 轉錄成 RNA 之后，便不再繼續翻譯，這些非編碼 RNA 一度被認為是轉錄中的 “噪音”“暗物質”， 甚至有人認為這是 “垃圾 DNA”。 近十年來，隨著探索未知的技術的進步，這些所謂 “垃圾 DNA
研究揭示水稻基因組“垃圾DNA”的真相
對于動植物的DNA來說，僅有不到5%能夠翻譯成蛋白質，進行生命活動。而大部分DNA轉錄成RNA之后，便不再繼續翻譯，這些非編碼RNA一度被認為是轉錄中的“噪音”“暗物質”， 甚至有人認為這是“垃圾DNA”。 近十年來，隨著探索未知的技術的進步，這些所謂“垃圾DNA”的重要性才開始為人們所了解。
無缺口組裝！水稻完整參考基因組發布
近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合海南崖州灣實驗室、中國水稻研究所、中國農科院作物科學研究所和揚州大學等多個單位發布完整的水稻參考基因組，實現了全基因組所有染色體端粒到端粒無缺口組裝，為水稻育種研究提供了新的有力工具和重要大數據基礎。相關研究成果發表在《分子植物》（Molecular
我國科研團隊發布水稻完整參考基因組
水稻是重要的糧食作物，其基因組組裝對水稻育種意義重大。23日，記者從中國農業科學院深圳農業基因組研究所獲悉，該所聯合崖州灣實驗室、中國水稻研究所、中國農科院作物科學研究所和揚州大學等多個單位發布完整的水稻參考基因組，實現了全基因組所有染色體端粒到端粒無缺口組裝，為水稻育種研究提供了新的有力工具和重要
水稻LEA基因組規模的鑒定與分析
實驗概要本實驗鑒定了OsLEA基因，將基因定位到水稻染色上，進行了序列對比和基因轉變分析，LEA基因的表達分析及啟動子基序分析。實驗材料基因組及蛋白質序列的來源：分別從TIGR (http://www.tigr.org)和BGI (http://rise.genomics.org.cn/rice