英國生物庫數據開始對外開放
英國生物庫數據于3月30日正式面向研究人員開放。通過這一數據庫，全球的科學家都可以將近50萬英國人的各種健康數據用于研究，這無疑對全球醫學研究起到積極的推動作用。 英國生物庫項目于2006年8月正式啟動，旨在收集大量的生物樣本和醫學數據用于醫學研究。數據收集目標為40歲到65歲的英國人，數據內容包括身高、體重、體脂、手握力、骨密度、肺功能、血壓等，以及志愿者的病歷資料和生活方式，甚至他們的記憶、飲食、早期生活情況和社會心理事件(比如多久時間去看望其家人和朋友)也被記錄在案。在最新的10萬名志愿者的相關數據中還包括聽力、視力等。 經過近五年的信息收集，目前英國生物庫的數據量高達20萬億字節，相當于30000張CD的存儲量。而隨著時間的推進，生物庫內數據量將會越來越大。如按計劃有五分之一志愿者的特殊圖像掃描信息加入到數據庫，整個數據庫的信息量將增加十倍。 這些數據將對全球開放，來自英國及海外的科學家，只要其研究......閱讀全文
動物所等建立衰老生物學多組學數據庫
隨著人口老齡化程度加劇，實現健康老齡化是目前亟待解決的社會問題和科學問題。近年來，隨著衰老相關研究成果的不斷增多以及高通量測序技術的日益發展，衰老相關多組學數據層出疊見。然而，目前尚缺乏綜合性的整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫。 中國科學院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組，與北京基因組研
中國科學家建立全球首個冰川微生物數據庫
青藏高原被稱為世界“第三極”和“亞洲水塔”。除南北極外，它是全球最大的冰川分布區，現有冰川2萬條以上，面積超過2萬平方公里，也是我國及亞洲20億人賴以生存的十多條大江大河的源頭。青藏高原冰川是微生物的天然存儲器，封存了不同歷史時期的微生物。 現在，中國科學家構建的全球首個青藏高原冰川微生物
中國科學院：生物組學數據庫獲國際認可
記者12月20日從中國科學院北京基因組研究所獲悉，該所生命與健康大數據中心(BIGD)建成的生物組學數據庫首次獲得國際認可。 BIGD團隊近日在國際學術期刊《核酸研究》上發表研究論文《北京基因組研究所生命與健康大數據中心：從存儲到整合、再到轉化》，這是中國首次以數據中心的模式，整體發布中國生物
浙江省首個市級土壤生物數據庫在寧波建成
近日，寧波市土壤生物普查項目通過專家驗收，標志著浙江省首個市級土壤生物數據庫正式建成。該項目由寧波大學牽頭，聯合中國科學院城市環境研究所、武漢工程大學共同完成，系統摸清了寧波市土壤生物"家底"，為區域農業可持續發展、土壤資源保護利用和鄉村振興戰略實施提供了重要的科學依據。 本次普查工作是全國同
成都生物所研究構建易變山羊草首個轉錄組數據庫
易變山羊草(2n=4x=28, UUSvSv, Ae. variabilis syn. Triticum peregrinum (Hack In J. Fraser) Marie & Hackel)是小麥的近緣物種，與小麥進行遠源雜交時可產生可育后代，是小麥育種改良的重要資源。人們除了從
中國科學家建立全球首個冰川微生物數據庫
青藏高原被稱為世界“第三極”和“亞洲水塔”。除南北極外，它是全球最大的冰川分布區，現有冰川2萬條以上，面積超過2萬平方公里，也是我國及亞洲20億人賴以生存的十多條大江大河的源頭。青藏高原冰川是微生物的天然存儲器，封存了不同歷史時期的微生物。 現在，中國科學家構建的
siRNA數據庫與設計工具
siRNA DatabaseSearchable database of Silencer ? Validated and Pre-designed siRNAs to >34,000 human, mouse, and rat targets. All siRNAs in the database
鹽湖資源環境信息數據庫建成
? 日前，中國科學院青海鹽湖研究所在科技部基礎專項、中科院“百人計劃”等項目的支持下，立足柴達木盆地鹽湖資源優勢，歷時6年建成的鹽湖資源與環境科學基礎數據共享數據庫正式通過科技部驗收。這標志著目前我國數據量最大的鹽湖資源與環境科學基礎數據共享系統正式建成，并對基于科學數據的鹽湖資源合理利用、長遠決策
北京正在建罕見病數據庫
今日，2014第三屆中國罕見病高峰論壇在京舉辦。北京醫學會罕見病分會副主任王琳在論壇中透露，北京正在建立罕見病病例登記系統和病人數據庫，嘗試單病種追蹤調研和罕見病診治地圖的設置。 王琳介紹，中國目前所應用的罕見病相關數據都是基于歐盟、美國等地所提供的資料。“而國內到現在也沒有對本國進行過罕見病
國內首個向量數據庫標準發布
11月15日，中國信通院聯合騰訊云計算（北京）有限責任公司、中移（蘇州）軟件技術有限公司等多家企業共同編制的、國內首個向量數據庫標準正式發布，將為我國向量數據庫研發、測試及選型提供重要參考，推動我國人工智能產業高質量發展。 向量數據能夠從多個維度記錄事物特征，是人工智能時代的基礎數據形式。人工
“敦煌遺書數據庫”建成投用
3月10日，在十四屆全國人大二次會議甘肅代表團開放團組活動上，敦煌研究院黨委委員、保護研究部副部長汪萬福代表介紹，該院“流失海外敦煌文物數字化復原項目”邁出實質步伐，“敦煌遺書數據庫”業已建成投用。 汪萬福說，敦煌研究院還組建了甘肅省敦煌文物保護研究中心，建成國內首座文物保護領域多場耦合實驗室
生命科學國外重要數據庫
EMBL數據庫結構EMBL數據庫的基本單位也是序列條目，包括核甘酸堿基排列順序和注釋兩部分。序列條目由字段組成，每個字段由標識字起始，后面為該字段的具體說明。有些字段又分若干次子字段，以次標識字或特性表說明符開始，最后以雙斜杠“//”作本序列條目結束標記。條目的關鍵字包括ID（序列名稱），DE（序列
超4000種－融智生物發布商用化生物組學微生物質譜數據庫
近日，融智生物宣布建設完成基于全新生物組學理念的微生物質譜數據庫。這是全球首次發布商品化生物組學微生物質譜數據庫。 傳統上，基于不同的細菌或真菌內蛋白組成分特別是核糖體蛋白有顯著的差異，對核糖體蛋白組的質譜測試，可用于快速、高準確度鑒定微生物。基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜（MALDI-TO
微生物領域數據庫及其分析系統建設研究取得進展
中國科學院計算機網絡信息中心大數據技術與應用發展部與中科院微生物研究所等，在微生物領域數據庫及其分析系統建設方面取得新進展，提出了一種利用語義網技術構建知識圖譜的方法，可將冠狀病毒相關的毒株、基因組、蛋白序列、蛋白結構、抗體、文獻和ZL等多源異構數據映射至資源描述框架（RDF），并構建了基于語義網框
科學家合作構建再生生物學多組學數據庫
隨著細胞重編程、基因編輯、合成生物學、高通量測序等技術的快速發展，再生生物學進入前所未有的蓬勃發展時期，助力解決組織替代、功能修復、衰老干預、疾病治療等一系列生命醫學領域的重要科學難題。面對科學數據的爆炸式增長，亟需建立以再生生物學為核心的開放數據庫，以存儲世界范圍內的組學研究數據為基礎，推動再
解碼“基因寶藏”：最全海洋微生物基因數據庫出爐
9月4日晚，華大生命科學研究院（簡稱“華大”）聯合山東大學、英國東安格利亞大學、中國海洋大學、廈門大學、丹麥哥本哈根大學等機構，在《自然》上發表研究成果。他們通過對目前已公開的海洋微生物宏基因組數據進行分析和深度挖掘，構建了迄今為止最完整的海洋微生物基因數據庫，并從中發現了大量具有應用潛力的基因資源
研究團隊部合作建立衰老生物學多組學數據庫
隨全球人口老齡化程度加劇，實現健康老齡化是目前亟待解決的社會問題和科學問題.近年來，隨衰老相關研究成果不斷增多及高通量測序技術日益發展，衰老相關多組學數據逐漸增多.然而目前，尚缺乏一個綜合性的、整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫. 中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）研究員鮑一明研
英國建成首個糧食作物微生物組低溫庫
英國宣布建成全球首個公開資源的主要糧食作物微生物組低溫庫（UK-CMCB），將致力于保存栽培在英國土壤中的6種主要糧食作物的重要微生物組樣本，包括活性微生物、作物根部環境的基因組和DNA序列。 UK-CMCB由國際應用生物科學中心（CABI）、英國洛桑研究所（Rothamsted Resear
英國建成首個糧食作物微生物組低溫庫
英國宣布建成全球首個公開資源的主要糧食作物微生物組低溫庫（UK-CMCB），將致力于保存栽培在英國土壤中的6種主要糧食作物的重要微生物組樣本，包括活性微生物、作物根部環境的基因組和DNA序列。 UK-CMCB由國際應用生物科學中心（CABI）、英國洛桑研究所（Rothamsted Resear
英國建成首個糧食作物微生物組低溫庫
英國宣布建成全球首個公開資源的主要糧食作物微生物組低溫庫（UK-CMCB），將致力于保存栽培在英國土壤中的6種主要糧食作物的重要微生物組樣本，包括活性微生物、作物根部環境的基因組和DNA序列。 UK-CMCB由國際應用生物科學中心（CABI）、英國洛桑研究所（Rothamsted Resear
美國CDC將建炭疽桿菌公共數據庫
日前，美國疾病預防控制中心（CDC）表示，將在亞特蘭大建立一個有關炭疽桿菌的公共數據庫。CDC稱，已經在尋找可以建立這一公共數據庫的承包商。 這一舉動源于6月份在亞特蘭大實驗室發生的炭疽桿菌事件。由于實驗室部分研究人員，在讓炭疽桿菌失去活性時未遵守適當程序，便將可能含有活菌樣本轉移到安
建立臨床數據庫的好處有哪些？
建立臨床數據庫具有以下諸多好處：??1. 提高醫療質量：通過對大量病例數據的分析，可以發現治療過程中的優勢和不足，從而優化治療方案，提高醫療效果和患者的預后。??2. 支持臨床研究：為醫學研究提供豐富的數據資源，有助于發現疾病的發病機制、危險因素和新的治療靶點，推動醫學科學的發展。??3. 促進個性
英特爾將建帕金森患者數據庫
帕金森癥的患者通常都會被要求盡可能細致地做好自己的病情記錄，以便于醫生判斷病情的進展。但不少患者都抱怨，我雖然正視自己的病情，但帕金森病并不是我生活的全部啊，按醫生要求那樣的忠實完整記錄自己的病情？說起來容易做起來難！ 好消息是，現在的病情監測可以很容易了。拜可穿戴技術所賜，帕金森病患者運
我國首個尋親DNA數據庫在京建立
?? 科技日報消息，我國第一個專門面向失散人員的尋親DNA數據庫日前在京宣告建立。據數據庫建設方中科院北京華大方瑞司法物證鑒定中心的有關負責人介紹，通過該庫，尋親工作將變得方便快捷。同時，該庫將免費為我國失散人群提供尋親幫助，包括港澳臺地區。 ??? 據悉，該庫的第一批樣本檢測用試劑已經得到了美國
全球最大自閉癥數據庫上線
總部位于美國紐約的Simons基金會日前宣布，全球最大的自閉癥數據庫（SSC）正式上線并向全球科學家開放。目前已有來自美國、加拿大、中國、法國、冰島、澳大利亞、愛爾蘭、巴西和卡塔爾等17國家相關機構的自閉癥研究人員，通過云端查詢等方式使用了這一數據庫。 SSC包含近2600個家庭的基因組序列數
美國CDC將建炭疽桿菌公共數據庫
日前，美國疾病預防控制中心（CDC）表示，將在亞特蘭大建立一個有關炭疽桿菌的公共數據庫。CDC稱，已經在尋找可以建立這一公共數據庫的承包商。 這一舉動源于6月份在亞特蘭大實驗室發生的炭疽桿菌事件。由于實驗室部分研究人員，在讓炭疽桿菌失去活性時未遵守適當程序，便將可能含有活菌樣本轉移到安全措施
天津建成食品污染物數據庫
日前從天津市衛生計生委、市衛生監督所獲悉，為了擴大食品污染物及有害因素監測覆蓋面，實現對食源性疾病的主動監測，該市食品安全風險監測區域已覆蓋全市16個區縣，食源性疾病監測哨點醫院已由18家增加到33家，并已形成了市食品污染物數據庫。 根據目前在食品安全領域擔負的職責，該市衛生計生部門規劃建立了
Nature：癌癥數據庫ClinVar打破Myriad壟斷
??????? 去年，美國最高法院判定Myriad Genetics持有的BRCA1和BRCA2 DNA序列測試ZL無效，美國最高法院判定也意味著未來美國國內的癌癥檢查價格將變得更加便宜、普遍。 BRCA1基因的發現和致病相關性是Mary-Claire King博士在1990年發現，盡管當時她的研
首個免疫衰老多組學數據庫設立
記者12月17日從中國科學院基因組所（國家生物信息中心）了解到，該所研究員張維綺團隊、鮑一明團隊與中國科學院動物研究所研究員劉光慧、曲靜研究組合作，建立了免疫衰老領域首個多組學數據庫Immunosenescence Inventory，旨在為整合和分析與免疫衰老相關數據提供一體化平臺。隨著全球人口老
代謝組學常使用的數據庫
代謝組主要是對小分子代謝物（一般50-1500 Da）進行高通量定性和定量分析，代謝組分析產生了大量的生物信息數據。代謝組數據庫的開發對于歸納總結這些大數據，方便后續的代謝組學數據分析，揭示隱藏在大數據背后的生物學機理具有十分重要的作用。 目前常用的代謝組學數據庫有HMDB、NIST、LMSD