科學家進行基因組測序成功破譯金雕基因組
作為一種知名度極高的猛禽，金雕經常以威猛霸氣的形象出現在影視作品和小說中。現在，英國研究人員完成了對金雕的基因組測序工作，希望從基因層面深入了解這一物種，以便更好地保護它們。 金雕以巨大的體型和敏捷有力的飛行等特征而著名，其成鳥的翼展平均超過2米，體長可達1米。金雕一般生活于多山或丘陵地區，以鳥類和獸類為食。有統計顯示，全球約有30萬只金雕。 為更好地保護金雕，英國愛丁堡大學和桑格研究所合作對金雕進行基因組測序，獲得了國際上第一個高質量的金雕參考基因組。 愛丁堡大學近日發布新聞公報指出，該工作有望從遺傳信息角度揭示金雕如何適應不同的棲息地，從而幫助更好地安排物種引入等工作，推進金雕的保護工作。 金雕基因組測序項目是桑格研究所等機構開展的“25基因組計劃”的一部分。該計劃擬對25個英國最具代表性的物種進行基因組測序，其中包括紅松鼠、知更鳥等。......閱讀全文
復旦大學PNAS發表全基因組測序新發現
復旦大學上海醫學院高謙（Qian Gao）教授課題組的研究人員與來自中國、西班牙、瑞士等國的科學家們展開合作，在新研究中采用全基因組測序結合大規模基因分型揭示出了結核分枝桿菌北京家族菌株的起源、進化及其與現代人類遷移的聯系。這項研究發布在6月15日的《美國國家科學院院刊》（PNAS）雜志上。
我國多個大學研究團隊聯合完成壁虎基因組測序
南通大學顧曉松院士的研究團隊與華大基因、中科院成都生物研究所和浙江大學沃森基因組科學研究院聯合完成了壁虎基因組測序，這是迄今為止規模最大的爬行動物基因組測序，為了解壁虎的適應性進化和生物特性提供了基礎，相關研究于11月25日在線發表在《自然－通訊》上。 爬行動物經歷了3億年的適應性進化，在形態
關于全基因組測序的測序指標介紹
一、全基因組測序的測序指標— 深度 測序深度（Sequencing depth）是指測序得到的堿基總量（bp）與基因組大小的比值，它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系，測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體，如果采用的是雙末端或Ma
科學家進行基因組測序－成功破譯金雕基因組
?? 作為一種知名度極高的猛禽，金雕經常以威猛霸氣的形象出現在影視作品和小說中。現在，英國研究人員完成了對金雕的基因組測序工作，希望從基因層面深入了解這一物種，以便更好地保護它們。 金雕以巨大的體型和敏捷有力的飛行等特征而著名，其成鳥的翼展平均超過2米，體長可達1米。金雕一般生活于多山或丘陵地區
中國新生兒基因組、胚胎基因組計劃啟動
為從根本上實現新生兒遺傳病的早發現、早診斷、早干預，7日，中國遺傳學會遺傳咨詢分會聯合復旦大學附屬兒科醫院在上海發起中國新生兒基因組計劃。 中國新生兒基因組計劃將在未來的5年內開展10萬例樣本的新生兒基因檢測，旨在構建中國新生兒基因組數據庫，建立新生兒遺傳病基因檢測標準，促進新生兒遺傳病基因檢
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲，地理分布廣，感染率高，寄生于人體盲腸，導致人體慢性感染，對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
“新生兒基因組”計劃擬對10萬名嬰兒測序
據美國有線電視新聞網（CNN）20日報道，英國將于今年晚些時候開始對10萬名新生兒的基因組進行測序，繪制嬰兒完整的遺傳指令集。這將成為同類研究中規模最大的研究，有望對兒童醫學產生深遠影響。 耗資1.05億英鎊的“新生兒基因組”計劃由英國衛生與社會保障部下屬的“英格蘭基因組”主導，將篩查約200種
“新生兒基因組”計劃擬對10萬名嬰兒測序
據美國有線電視新聞網（CNN）20日報道，英國將于今年晚些時候開始對10萬名新生兒的基因組進行測序，繪制嬰兒完整的遺傳指令集。這將成為同類研究中規模最大的研究，有望對兒童醫學產生深遠影響。 耗資1.05億英鎊的“新生兒基因組”計劃由英國衛生與社會保障部下屬的“英格蘭基因組”主導，將篩查約200
中美倡議啟動“地球生物基因組計劃”－對所有真核生物測序
在美國斯密森尼生物多樣性基因組學項目組與中國華大基因公司近日聯合主辦的生物基因組學會議（BioGenomics2017）閉幕論壇上，加州大學戴維斯分校基因組學家哈瑞斯·萊文等人和華大基因生物學家張國捷等組成的科研團隊聯合倡議，全球科學家合作開啟另一項與人類基因組計劃（HGP）類似的項目——地球生
“千種動植物基因組計劃”一期啟動100多種測序
由深圳華大基因研究院發起的“千種動植物基因組計劃”，一期已啟動100多種動植物基因組測序分析項目，其中近一半的項目已經完成或接近尾聲。 華大基因5月13日召開發布會稱，該“千種計劃”在重要物種基因組學研究領域和巨型基因組數據庫構建上取得階段性進展，該計劃將加速全球基因組學研
－盤點全球各國政府主導的人類基因組測序計劃
美國科學家于1985年率先提出人類基因組計劃，1990年正式啟動，美國、英國、法國、德國、日本和中國科學家都參與了這一預算達30億美元的人類基因組計劃。之后，2000年6月26日，六國科學家共同宣布，人類基因組草圖的繪制工作已經完成。在這場規模宏大、影響世界的基因測序項目落幕后，全球內陸續又有不
亞洲10萬人類基因組測序計劃發布！
非盈利聯盟GenomeAsia 100K最近宣布了一項計劃，測序10萬亞洲人的基因組，希望能加速精準醫療在亞洲人群中的應用。該計劃除測序外也將利用大數據分析和數據科學及人工智能的研究進展。至少12個南亞國家，7個北亞和東亞國家將參與其中。 第一階段，該計劃將主要為亞洲所有主要種族分布構建參考基
斯坦福大學借助PacBio首次臨床全基因組測序
在Ricky Ramon 7歲時進行一次例行檢查中，猶豫不決的兒科醫生送他去拍一張胸部X光片，結果顯示在他心臟左上腔里有一個良性腫瘤。對于Ramon來說，這是長達二十年的痛苦而漫長的就醫史的開始——伴隨他20年的，是沒完沒了的預約、診斷、和手術。 在此期間，非惡性腫瘤不斷重新出現在Ramon的
Cell公布最新基因組測序結果
去年夏天西非埃博拉爆發的早期階段，科學家們以空前的規模和速度測序了這種致命病毒的基因組，為人們揭示了許多疫情蔓延的關鍵信息，比如說病毒只通過人與人接觸傳播，病毒在多次傳播中獲得了許多新突變等等。 雖然埃博拉爆發最糟糕的時期已經過去，但這場疫情并未結束，還有許多問題需要人們去解答。為此，哈佛大學
盤點基因組測序的最新成果
近日，the scientist雜志發表文章盤點了最近發布的幾項基因組測序成果，一起來看看吧。 昏睡病傳播者 種屬：采采蠅(Glossina morsitans morsitans) 基因組：360 million bp 國際舌蠅基因組計劃(International G
基因組高通量測序的原理
測序方案建立在雙脫氧測序法(Sanger等，1977)的基礎上。為了從每一克隆插入片段兩端成對地進行測序，每一個質粒模板DNA板應配備兩個384孔循環測序反應板。測序反應采用Big Dye Terminator chemistry version 3．1(AppliedBiosystems)和標準M
Nature發布基因組測序驚人發現
來自沖繩科學技術研究院大學(OIST)的一支研究團隊與合作者們，完成了對兩個稱作為柱頭蟲(acorn worm)的小水生生物物種的測序，顯示相比于許多其他動物，我們與柱頭蟲共享了更多的基因，確立了它們是我們的遠親。研究結果發布在《自然》（Nature）雜志上。 研究發現，所有后口動物（deut
美洲大蠊基因組測序完成
中科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所詹帥及同事對美洲大蠊進行了基因組測序和分析，表明在已測基因組的昆蟲中，其基因組規模僅次于蝗蟲。這項研究3月21日在線發表于《自然—通訊》，文章揭示了該物種成功適應城市環境的遺傳學基礎的相關洞察。 美洲大蠊（Periplaneta americana
最新基因組測序成果盤點
近來，各大雜志上陸續發表了不少重要的基因組測序成果。the scientist雜志對此進行了盤點，以饗讀者。 種屬：野鴨，綠頭鴨(Anas platyrhynchos) 基因組：約13 billion bp 鴨子是幾乎所有甲型流感病毒的天然宿主(包括H5N1)。日前，研究人員測
Science公布最新基因組測序結果
來自法國農業科學研究院（Institut National de Recherche Agronomique）的研究人員發表了題為“Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome”
Nature發布基因組測序重要發現
由科隆大學Roman Thomas領導的一個國際研究小組，對110個小細胞肺癌（SCLC）樣本進行了測序，發現除了兩個樣本其余所有的均包含失活的TP53和RB1基因。通過調查這一疾病的基因組景觀，他們還發現有不少的腫瘤具有與TP73基因相關的基因組重排或突變，以及激酶基因突變和Notch家族基因
基因組測序竟能準確預測長相！
克萊格·文特爾（Craig Venter）博士是一名不折不扣的“科學狂人”。幾十年前，他創立的Celera Genomics曾以一家公司之力，加快了“人類基因組計劃”的發展。他本人也于2000年和美國NIH負責人弗朗西斯·柯林斯（ Francis Collins）博士一道，共同宣布了人類基因組草
基因組測序揭示家鴿起源史
2月1日，由美國猶他大學、深圳華大基因研究院等單位合作完成的鴿子基因組研究成果在《科學》雜志在線發表。該研究從分子層面揭示了家鴿的起源歷史，并發現了鴿子羽冠多樣性的遺傳基礎。 據悉，鴿子是目前為數不多的已完成測序的鳥類之一，其基因組與家雞、火雞、斑馬雀及虎皮鸚鵡的基因組一起，將為鳥類的群體
全基因組測序各步驟工具
全基因組測序（WGS）是下一代測序技術，用于快速，低成本地確定生物體的完整基因組序列。基因組的深度測序對于臨床研究的意義重大，解讀WGS數據并了解基因組突變在健康和疾病中的重要性是精準醫療的基石。WGS分析流程能分為三大塊，數據處理、檢測變異和綜合分析，具體如下圖所示：由于WGS現在已經非常成熟了，
基因組測序助力腫瘤精密治療
最近，約翰霍普金斯大學Kimmel癌癥中心的科學家，在對101例胰腺癌患者的血液和腫瘤進行基因組測序后發現，至少三分之一患者的腫瘤有基因突變，這些突變有朝一日可能幫助指導疾病的精密治療。他們說，與標準的影像學檢查方法相比，血液檢測的結果，可以早半年預測到癌癥的復發。 約翰斯霍普金斯大學醫學院腫
讓基因組測序繞過PCR擴增
在基因組測序中，PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而，PCR也帶來一些問題，包括不均勻擴增，導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序（NGS）平臺而言，測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR
基因組測序揭示家鴿起源史
2月1日，由美國猶他大學、深圳華大基因研究院等單位合作完成的鴿子基因組研究成果在《科學》雜志在線發表。該研究從分子層面揭示了家鴿的起源歷史，并發現了鴿子羽冠多樣性的遺傳基礎。 據悉，鴿子是目前為數不多的已完成測序的鳥類之一，其基因組與家雞、火雞、斑馬雀及虎皮鸚鵡的基因組一起，
GenomeBiology發布基因組測序重要成果
Genome Biology雜志發布了遠東豹（Far Eastern Amur leopard）的首個全基因組序列，為人們揭示了肉食對基因多樣性和種群規模的影響。“我們將遠東豹基因組與其它哺乳動物基因組進行比較，發現肉食似乎是很強的選擇壓力。這種現象在雜食動物和食草動物中并不明顯。舉例來說，牛吃肉對
全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查檢測來解