長讀長組裝錯誤更多?兩派學者起爭論
近日,英國愛丁堡大學的研究人員對三個利用長讀長測序技術組裝的人類基因組進行分析。他們發現,與短讀長組裝相比,這些長讀長組裝的蛋白編碼區域含有相當多的錯誤。他們在《Nature Biotechnology》上發表結果,并建議人們花大力氣去解決這些錯誤。 文章的共同作者Mick Watson和Amanda Warr表示:“對于那些準備利用單分子技術來測序基因組以及希望在臨床實踐中使用長讀長技術的研究人員來說,這些結果可能具有警示作用。” 然而,參與長讀長組裝的研究小組之一在同期雜志上進行了回應,對這些結果提出了質疑。他們認為,新的生物信息學工具已經改善了納米孔組裝,并且“算法和技術的進一步改進將能夠從Oxford Nanopore和PacBio數據中獲得參考級的一致序列”。 在這項研究中,Watson和Warr對五個已發表的人類基因組組裝進行比較。其中兩個是只利用PacBio序列組裝的(2015年和2017年),一個是利用......閱讀全文
檢測報告常見錯誤匯總(一)
本文主要對報告中文字圖片信息、數據信息、結論表述等內容的完整性、準確性、科學性和規范性的問題進行探討,希望對實驗室工作者有所幫助。1 、缺漏性問題分析檢測報告缺漏性問題歸納起來分五類:圖片缺漏、信息缺漏、標識缺漏、簽名缺漏、不規范性缺漏。01圖片缺漏較常見的問題是樣品外觀檢查后,有其試驗后照片,而缺
ELISA測定錯誤結果的原因分析
ELISA即酶聯吸附試驗,是一種常用的固相酶免疫測定方法。Engvall 和Perlmann于1971年最先應用該法進行了IgG定量測定,并命名為"enzyme linked immunosorbent assay (ELISA)"。 ELISA的基本原理是:①使抗原(或抗體)結合到某種固相載體表面
檢測報告常見錯誤匯總(二)
04簽名缺漏漏簽名這種問題雖少,但問題性質往往很嚴重,一般而言,報告編制、審核、批準漏簽名的情況基本沒有,但要謹防報告出現這兩種情況:①三方會簽漏簽名;②試驗日志記事人未簽名。05不規則性缺漏在各種質量審核檢查中,最常見的一種不規范性缺漏問題是“有欄目空白未填”,如表格有空白欄、“備注”欄空白未加“
DNA復制中的錯誤相關介紹
以DNA為模板按堿基配對進行DNA復制是一個嚴格而精確的事件,但也不是完全不發生錯誤的。堿基配對的錯誤頻率約為10-1-10-2,在DNA復制酶的作用下堿基錯誤配對頻率降到約10-5-10-6,復制過程中如有錯誤的核苷酸參入,DNA聚合酶還會暫停催化作用,以其3’-5’外切核酸酶的活性切除錯誤接
減少測序錯誤,你做對了么?
不論是哪種測序平臺,在測序過程中都不可避免地存在一些錯誤。Illumina的低成本高通量測序技術已經在許多領域得到了廣泛應用,不過人們還不了解其系統性錯誤對測序數據的影響。 英國格拉斯哥大學的研究人員在16S rRNA擴增子測序的基礎上,全面分析了Illumina臺式測序儀的錯誤模式。他們由此
錯誤?還是科學藝術的奇跡?
一位物理學家感嘆,“這兒發生了什么奇跡?” ,圖福特則笑說“我頭一次聽見‘錯誤’被形容為‘奇跡’。” 逢原 編譯 費曼圖,是諾貝爾獎得主、物理學家理查德﹒費曼在20世紀創造的,他用形象化的方式,直觀地展現了量子場中各種粒子的相互作用,如散射、反應、轉化……他的每張圖,都表達出亞原子微粒的時空
電源濾波器的常見錯誤
在實驗測試過程中,我們常遇到這樣的情況:雖然設計工程師在設備電源線上接了電源濾波器,但是該設備還是不能通過"傳導騷擾電壓發射"測試,工程師懷疑濾波器的濾波效果不好,不斷更換濾波器,仍不能得到理想的效果。 分析設備超標的原因,不外乎以下兩個方面: 1)設備產生的騷擾太強; 2)設備的濾波不足
UVProbe加載報告生成器錯誤
UVProbe加載報告生成器錯誤是因為故障UVProbe是具有多功能,操作便捷的軟件,作為標準配置于島津UV-VIS分光光度計中。軟件特色:(1)具有多種數據處理和計算功能的測定模式;動力學測定除了光譜和光度模式外,還有動力學模式。綜合數據處理功能可提供給每個模式。(2)自由格式的報告創建 自由創建
移液器錯誤操作及處理方法
移液器錯誤操作及處理方法做為液體操作中最常用的手動可調精密移液器,在使用過程中有些錯誤的操作會給操作本身帶來誤差,有些會造成機器的損壞等,在這里簡單總結如下:錯誤:裝配吸頭時用移液器反復撞擊吸頭,以上緊正確:插入吸頭,左右輕轉旋轉上緊吸頭分析:撞擊會造成移液器內部齒輪組合的松動,長期操作會對移液器的
光電直讀提示“全局通訊出錯,光源錯誤
儀器重啟也沒用,你不用急,檢查一下氬氣壓力你就知道了----沒氬氣,是氬氣壓力傳感器沒有及時反應造成的。主要原因是火花室積灰多,要及時清灰。
玻璃儀器使用中錯誤分析
一、玻璃儀器洗滌方面的差錯|分析化學|化學分析|儀器分析|分析測試|色譜|電泳|光譜|等交流6t%{)iN*q"K? ? ? ? udj1.玻璃儀器的清洗是檢驗工作的*步。在實際工作中,許多人往往忽視了在檢驗前和完畢后,立即清洗所用玻璃器具,或對器具的清潔檢驗工作。以至器具內壁嚴重掛有水珠、污垢、沉
微量移液器的常見錯誤操作
常見的錯誤操作1)吸液時,移液器本身傾斜,導致移液不準確(應該垂直吸液,慢吸慢放)。2)裝配吸頭時,用力過猛,導致吸頭難以脫卸(無需用力過猛,選擇與移液器匹配的吸頭)。3)平放帶有殘余液體吸頭的移液器(應將移液器掛在移液器架上)。4)用大量程的移液器移取小體積樣品(應該選擇合適量程范圍的移液器)。5
實驗室中常犯錯誤
1. 做實驗要按規程,減壓一定要用園底瓶,不可用錐形瓶,容易內吸爆炸,如果僅僅是回收溶劑,尚無大礙,如果是旋去溶劑得樣品,萃取整個水浴鍋,工作量…………2. 有時候文獻不一定完整,如果你按照文獻去做,后果?我曾經按照四面體的一篇文獻做硝化反映,文獻說是一個小時滴完,我就***正兒八經的想1h滴完,我
細胞系錯誤鑒定:終結的開始
2010年5月ATCC SDO(Standards Development Organization)工作組在Nature review cancer雜志上發表了題為《Cell line misidentification:the beginning of the end》前瞻性報道。以下是全文
4個Python數據讀取的常見錯誤
read_csv()是python數據分析包pandas里面使用頻次較高的函數之一。它包括的參數差不多20個,可能一開始未必需要完整知道每個參數作用。不過,隨著使用的深入,實際數據環境愈發復雜,處理的數據上億行后,就會出現這樣那樣的問題,這樣催促我們反過頭來再去理解某些參數的作用。今天,總結平時使用
6大錯誤“常識”,你中了哪些?
大眾心理學已經成為我們社會的重要組成部分,以格言、真理和半真理的形式充斥著我們日常生活的每一天,為我們提供了成堆的建議,引導我們走過人生的坎坷。每年大約有3500本這樣的書籍誕生。 由于在辨別心理學事實與虛構信息時缺乏可靠的專業指引,公眾只好任由自助大師、脫口秀電視節目主持人以及自詡的心理健康
ABO血型系統鑒定錯誤的原因分析
正確的血型鑒定是安全輸血的關鍵,ABO血型系統有兩個獨特性質,一是血清中常存在的反應性強的抗體,而紅細胞表面缺乏相應的抗原,二是許多組織細胞表面有規律的存在著ABH抗原,而分泌型的分泌液中也存在著ABH抗原,這兩種獨有的性質使ABO血型系統成為輸血和器官移植中最重要的血型系統,輸血前ABO血型鑒
負載率過高也導致ECU出現錯誤
隨著汽車電子技術的發展,車身零部件越來越多,ECU之間數據交互越來越容易受到影響,負載過高也會導致ECU報錯,這您知道嗎?1什么是ECU?ECU(Electronic Control Unit)電子控制單元,又稱“行車電腦”、“車載電腦”等。從用途上講則是汽車專用微機控制器。它和普通的電腦一
原代細胞培養中的常見錯誤
當培養原代細胞時,重要的是要記住,他們不是細胞系,不能同等對待。我們非常熟悉研究人員在培養原代細胞時遇到的常見問題。這里有六個在原代細胞培養中的常見錯誤,以及如何糾正這些錯誤。?錯誤1:一小管原代細胞在水浴中解凍一段時間糾正1:原代細胞對解凍過程非常敏感,因此將小瓶置于37℃水浴中,保持并輕輕旋轉直
墨魚也會形成視覺錯誤記憶
在一個事件中,你看到的、聞到的、感覺到的細節不會被存儲在單一的記憶單元中。相反,它們被分別編碼并存儲在你的大腦中。為了找回記憶,這些碎片必須重新組合起來。當這個過程沒有以正確的方式發生或細節失真時,錯誤記憶就產生了。現在,科學家發現,墨魚也可能產生錯誤的記憶。相關研究近日發表于《交叉科學》。墨魚被認
檢驗工作中常見的取樣錯誤
???? 1.溶血和凝血。太常見了,不說也罷。 2.靜脈采血不當至血液淤滯。這樣血漿中的水和無機小分子會擴散到組織間隙中,致使血漿大分子成分和血細胞濃縮,其中血清Ca常與蛋白復絡合,因此Ca也可以偏高。 3.處理方式不當。對于不同的項目,根據不同的特點,在采血時要考慮更恰當的處理,這點國內做得都
微量移液器常見的錯誤操作
1)吸液時,移液器本身傾斜,導致移液不準確(應該垂直吸液,慢吸慢放)。 2)裝配吸頭時,用力過猛,導致吸頭難以脫卸(無需用力過猛,選擇與移液器匹配的吸頭)。 3)平放帶有殘余液體吸頭的移液器(應將移液器掛在移液器架上)。 4)用大量程的移液器移取小體積樣品(應該選擇合適量程范圍的移液器)。
墨魚也會形成視覺錯誤記憶
在一個事件中,你看到的、聞到的、感覺到的細節不會被存儲在單一的記憶單元中。相反,它們被分別編碼并存儲在你的大腦中。為了找回記憶,這些碎片必須重新組合起來。當這個過程沒有以正確的方式發生或細節失真時,錯誤記憶就產生了。 現在,科學家發現,墨魚也可能產生錯誤的記憶。相關研究近日發表于《交叉科學》。
移液器錯誤操作及處理方法
做為液體操作中最常用的手動可調精密移液器,在使用過程中有些錯誤的操作會給操作本身帶來誤差,有些會造成機器的損壞等,在這里簡單總結如下: 錯誤:裝配吸頭時用移液器反復撞擊吸頭,以上緊 正確:插入吸頭,左右輕轉旋轉上緊吸頭 分析:撞擊會造成移液器內部齒輪組合的松動,長期操作會對移液器的精確性造
拉伸測試中5個常見的錯誤
與所有測試一樣,只有盡可能多的注意到拉伸試驗機測試時一些重要的細節部分,zui終得出的測試數據才會更好。不斷發展的材料及其制造方法如果跟現在的年輕學者們說“塑料”一詞曾經是“廉價”的代名詞時,他們肯定會很驚訝。也許這也是為什么Dustin Hoffman在電影《The Graduate》(畢業生)中
Cell:瓦解錯誤折疊蛋白的新武器
蛋白質發生錯誤折疊,導致變形的蛋白無法執行正常功能,是諸如肌萎縮側索硬化癥(ALS)、阿爾茨海默氏癥、帕金森病等腦病形成的關鍵。當前,還沒有辦法來逆轉蛋白質錯誤折疊 來自賓夕法尼亞大學Perelman醫學院的生物化學和生物物理學副教授James Shorter博士,現在找到了一種可能的
兒童用藥錯誤常見類型及案例分析
? 用藥錯誤(MedicationError,ME),《醫療機構藥事管理規定》將其定義為:合格藥品在臨床使用及管理全過程中出現的、任何可以防范的用藥不當。可見,用藥錯誤可發生在醫療行為的任何環節,并且,不管該錯誤是否導致不良后果,一旦行為發生即可判定為用藥錯誤。??? 與成人患者一樣,兒童用
國航稱燒餅“過期”系因包裝錯誤
日前有媒體和網友曝出旅客乘坐國航某航班時,吃到過期牛肉餡燒餅而出現腹瀉情況。昨天,國航在官網微博上作出說明并道歉,稱初步調查是食品包裝袋配錯使旅客認為燒餅過期,航食公司已對此批次燒餅進行封存并送權威部門檢驗。 》事件回放 旅客餐后上吐下瀉 根據媒體報道,10月6日,張女士一家人
雀巢召回標識錯誤的瘦身特餐LEAN-CUISINE
據美國食品藥品管理局(FDA)消息,8月22日美國FDA發布通報稱,目前雀巢公司正在對一款瘦身特餐LEAN CUISINE實施召回,因為產品當中含有蝦成分,而標簽上面未做說明。 據了解,這款問題產品的外包裝名稱為LEAN CUISINE牌的花生醬雞肉,條形碼為13800 10154,生產代碼
輸血療法的開端竟是一個錯誤?
血液象征著生命,這對生活在今天的人們來說,是再自然不過的事了。血液的重要性無論怎么形容都不過分,而任何一個合格的情報人員都知道,大規模的血液調度是戰爭馬上爆發的準確信號。今天,輸血是外科手術中的一個基本程序,多少人因為輸血技術而獲救。然而,對人類健康影響巨大的輸血療法的開端,卻是肇因于徹頭徹尾的錯誤