印度實施大規模基因組測序計劃
據4月19日《印度教徒報》消息，印度將實施一項涉及1萬人的基因組測序項目，以便進一步開展相關疾病防治研究。 2003年人類基因組首次被測序，開啟了將個體特定基因與疾病相關聯的新途徑。包括囊性纖維病、珠蛋白生成障礙性貧血等在內的近萬種疾病與單個基因故障有關。同時基因還可能對特定藥物具有不同敏感性，基因測序還顯示癌癥可以從基因角度來理解，而不是特定器官的病變。從全球來看，目前很多國家已經開展了居民樣本基因組測序，以確定其中的易患病或抗病基因特性。 目前，印度的基因組數據主要局限于富裕的城市人群。為使基因組信息更具廣泛性，印度科學與工業研究理事會將對來自全印的約1000名農村年輕人進行基因測序，繪制基因組圖譜。這1000名年輕人大部分為全印各地生命科學或生物學專業的大學生。研究者稱，此研究不僅是收集樣本試驗，而且將到各個大學對這些學生進行基因組教育，并且提供一個系統以便這些學生能夠獲取他們的基因組信息。研究者希望最終使基因組測......閱讀全文
Nature新聞：基因組測序追蹤超級病菌
研究人員通過基因組測序最終了解了去年困擾英國劍橋一家新生兒特護病房達數月之久的超級細菌疫情。他們將這一案例報告在11月14日的《柳葉刀傳染病》(Lancet Infectious Disease)雜志上，標志著首次科學家們通過測序病原體基因組積極控制了一場持續爆發的疫情。 在兩天內Ro
The－scientists盤點最熱門的基因組測序
The scientist雜志對近期最熱門的一些基因組測序成果進行了盤點，以饗讀者。 一種新病毒 種屬：果蝠皰疹病毒（FBAHV1） 基因組：149,459bp 日本北海道大學的研究團隊測序了一種新病毒的基因組序列，并將結果發表在六月十八日的Journal of Virology雜志上。
當宏基因組遇上單細胞測序
日前，科學家們通過宏基因組測序和單細胞測序鑒定了一類新細菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性，使其成為了微生物檢測和分類鑒定的強有力工具。這種方法為科學家們揭示了微生物群體的高度復雜性，但它還是有所遺漏。美國能源部聯合基因組研究所上周的一次會議上，研究者人員向人們展示了在四個溫泉樣本
Nature－Methods發布基因組測序新工具
十月十七日Nature Methods雜志發表的一項研究顯示，新測序技術與新算法的結合可以為人們揭示復雜基因組的詳細信息。加州大學戴維斯分校和Pacific Biosciences公司的研究人員的FALCON-Unzip算法能夠將長讀取測序數據裝配成高度準確、連續和正確定相的二倍體基因組。 隨
近期最熱門的基因組測序成果
生物通報道：The scientist雜志對近期最熱門的一些基因組測序成果進行了盤點，包括瀕臨滅絕的幾維鳥和極其聰明的章魚。 種屬：甜瓜（Cucumis melo） 西班牙和意大利的研究團隊在Molecular Biology and Evolution雜志上率先發布了七個甜瓜品種的基因組分
PacBio助力感染菌株基因組重測序
Andrew Kasarskis博士是Icahn基因中心遺傳與基因組中心的副主任。他目前領導著一些專攻治療和診斷的合作項目，而他自己的研究也主要在病原體檢測，藥物基因組學，睡眠與遺傳的關系幾個方面展開。在加入西奈山之前，他曾經就職于PacBio，Sage Bionetworks和Merck。他有
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
Nature：實時、便攜式基因組測序
埃博拉病毒（EBOV）感染人類會引起致命的出血熱，發病率和病死率極高。2014年這種病毒在西非造成了嚴重的疫情，死亡人數已經超過11,000人。今年一月份，就在人們以為這場疫情正式結束之際，塞拉利昂又出現了新的病例。 本期Nature雜志發表的一項新研究展示了便攜式基因組測序儀在這次疫情中起到
基因組測序的方法和臨床應用
基因組測序主要有兩種方法?鳥槍法?和克隆重疊群法。臨床全外顯子測序是針對人類全部基因的外顯子進行檢測，適用于一些難以判斷病因的復雜遺傳病的診斷，是一種常用的基因組測序方法。
人類基因組測序的緣起
雖然公眾對于開展人類基因組測序已經翹首以待，但是為這項計劃舉辦的首次協調會卻令人泄氣。1984年夏季，美國能源部（DOE）健康與環境研究項目主任查爾斯·德利西（Charles DeLisi）召開了專家會議，旨在評估人類基因組測序技術的可行性。自20世紀80年代早期以來，能源部的研究人員一直在致力
我國率先完成菊花全基因組測序
中國中醫科學院中藥研究所和安利植物研發中心對外發布消息稱，由他們共同發起的科研團隊，在菊花全基因組計劃獲重大進展的同時，還完成了重要的藥用菊花品種——杭白菊的全長轉錄組遺傳信息發掘。此舉使我國成為世界上首次完成菊屬植物菊花全基因組測序的國家。 據了解，菊屬植物染色體結構復雜，包含從2n=18到
中藥材“甘草”基因組測序完成
科技日報東京10月27日電 （記者陳超）日本理化學研究所、千葉大學、高知大學和大阪大學等組成的一個研究小組宣布，他們對中藥材“甘草”進行了全基因組測序，成功取得了推測的全部基因94.5%的基因信息。 甘草是一種豆科植物，廣泛應用于各種中藥中，是重要的中藥原料。它具有改善肝功能、治療消化性潰瘍
個人基因組測序預測能力遭質疑
一項新的研究給全基因組測序對每個人都很有用的說法潑了一盆冷水。圖片來源：N.J. Roberts等，《科學—轉化醫學》 ?“每個人都將擁有自己的基因組序列，并且可以將這些信息裝在一個U盤中”——生物醫學家曾這樣給我們描繪一幅美妙的藍圖，當脫氧核糖核酸（DNA）測序變得很廉價時，這一
近期最受關注的基因組測序研究
想象一下有人遞給你一杯奶昔，要你鑒別出里面所有的東西。或許你能夠辨別出有一點點的草莓或是酸奶的味道。但總體上它的味道就像是無法分辨的成分構成的混成品。 現在再想象一下，這杯奶昔是由來自大腦的2萬個碾碎了的細胞所組成。你可以通過測試來確定樣本中有什么分子，這就是科學家們現在所做的事情。這當然會提
簡述全基因組測序的技術路線
全基因組測序的技術路線：提取基因組DNA，然后隨機打斷，電泳回收所需長度的DNA片段（0.2~5Kb），加上接頭, 進行DNA簇（Cluster）制備，最后利用Paired-End（Solexa）或者Mate-Pair（SOLiD）的方法對插入片段進行測序。然后對測得的序列組裝成Contig，通
關于全基因組測序的應用介紹
全基因組測序的應用：通過生物信息手段，分析不同個體基因組間的結構差異，同時完成SNP及基因組結構注釋。 DNA突變可誘發癌癥。吸煙過程中所釋放的>60種致癌化學物質可與DNA結合并對DNA鏈上的鳥嘌呤和腺嘌呤進行化學修飾從而產生大的加合物，該加合物改變了DNA雙螺旋的結構，如果不被核苷酸剪切修復
近期最熱門的基因組測序成果
大千世界無奇不有，這都是進化的功勞。大航海時代，科學家們揚帆遠航去探索大自然的神奇造化。如今，科學家們正在測序技術的幫助下進一步揭示生命的奧秘。The scientist雜志對近期最熱門的一些基因組測序成果進行了盤點，華大基因參與的兩項測序研究格外引人矚目。 種屬：長頸鹿和okapi 基因組
中藥材“甘草”基因組測序完成
日本理化學研究所、千葉大學、高知大學和大阪大學等組成的一個研究小組宣布，他們對中藥材“甘草”進行了全基因組測序，成功取得了推測的全部基因94.5%的基因信息。 甘草是一種豆科植物，廣泛應用于各種中藥中，是重要的中藥原料。它具有改善肝功能、治療消化性潰瘍、抗炎癥及止疼止咳等多種功效。甘草根部富含
個人基因組測序收費將大幅降價
新華社倫敦2月9日電針對個人的基因組測序服務剛出現時，測序費用高達上百萬美元，普通人望塵莫及。不過，美國一家公司計劃從今年6月開始，推出低價個人基因組測序業務，顧客只需支付5000美元，就可向這家公司預約基因組測序服務。 據英國《新科學家》雜志網站報道，這家名為“完全基因組”的公司位于美國
關于全基因組測序的內容介紹
1998年，克萊格·凡特的塞雷拉基因組公司成立，而且宣布將在2001年完成測序工作。隨后國際團隊也將完成工作的期限提前。2000年6月26日，塞雷拉公司的代表凡特，以及國際合作團隊的代表弗朗西斯·柯林斯（Francis Collins），在美國總統柯林頓的陪同下發表演說，宣布人類基因組的概要已經
HiSeqXTen開創基因組測序的新時代
新年伊始，Illumina公司在第32屆摩根大通保健大會上重磅推出最強大的測序儀：HiSeq X Ten。這一套測序系統包括10臺HiSeq X測序儀，適合群體規模的測序項目。據Illumina介紹，HiSeq X Ten首次讓$1000的基因組測序成為現實。以Illumina成熟的
Nature子刊發布重磅測序技術：基因組和轉錄組平行測序
四月二十七日的Nature Methods雜志上發布了一項引人注目的測序技術，G&T-seq（Genome and Transcriptome Sequencing）。該技術能夠實現大規模的DNA和RNA平行測序，同時展現單個細胞的基因組序列和基因活性。 研究人員用G&T-seq對220個小鼠
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術，并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
科學家進行基因組測序－成功破譯金雕基因組
?? 作為一種知名度極高的猛禽，金雕經常以威猛霸氣的形象出現在影視作品和小說中。現在，英國研究人員完成了對金雕的基因組測序工作，希望從基因層面深入了解這一物種，以便更好地保護它們。 金雕以巨大的體型和敏捷有力的飛行等特征而著名，其成鳥的翼展平均超過2米，體長可達1米。金雕一般生活于多山或丘陵地區
今年底要測序3000個基因組
1月17日，美國《國家科學院院刊》刊發了一組文章，描述了地球生物基因組計劃（EBP）的目標、迄今的成就和下一步的行動。這意味著旨在繪制地球上所有植物、動物、真菌和其他微生物基因組圖的EBP進入一個新階段，從試點項目轉向全面測序。“EBP特輯報道了生物學史上最大規模協同工作的本質和激動人心之處。”EB
科學家完成古老綠藻基因組測序
已知最小的真核生物Micromonas之一的電子斷層切片( 0.5微米厚) 一個國際研究小組日前對兩株被認為屬于同一種藻類的古老綠藻進行了基因組測序，結果發現二者的基因只有90%相同。由于研究所用的綠藻位于真核生物生命樹底部，科學家認為，這一發現為研究藻類以及陸地植物的進化提供了新線索
全基因組測序提高罕見病診斷率
每4300人中就有1人患有線粒體疾病，并會導致進行性的不治之癥。這種疾病是最常見的遺傳疾病之一，但對臨床醫生來說很難診斷，這是因為它們可以影響許多不同的器官，并與許多其他疾病相似。而其中40%的患者未能被目前的基因檢測制度診斷。 近日，英國研究人員的一項新研究為尚不能被確診的患者帶來了希望。該
國際研究小組完成團藻基因組測序
德國比勒費爾德大學9日報告說，一個有德國研究者參加的國際研究小組最近完成了對最簡單的多細胞生物團藻的基因組測序。科研人員希望以此幫助探尋單細胞生物向多細胞生物演變的奧秘。 單細胞生物怎么能演變為多細胞生物乃至人這樣高度復雜的生物，一直是生物研究的重要課題。一個由德國、美國、
甲基化的基因組直接測序法
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理，并以連接介導的PCR來放大信號強度，然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解，故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解
全基因組測序解密慢性高原病
8月16日，由加州大學圣地亞哥分校、華大基因等單位共同完成的安第斯高地人慢性高原病全基因組測序及相關研究，在《美國人類遺傳學雜志》上發表。研究為探索高原適應性的遺傳機制提供了基礎理論，也為慢性高山病的機理研究及治療提供了科學依據。 全球約有1.4億人世居高原。對于高原低氧環境的不適，通常會