NatCommun:如何利用“DNA修復錯誤”機制治療疾病?
近日,由日本京都和加拿大蒙特利爾的研究人員開發的一種新的生物信息學工具MHcut揭示,DNA損傷的自然修復系統——“微同源性介導的末端連接”,在人類細胞中發生的幾率可能比以往人們認為的要普遍得多。研究人員使用MHcut和商業基因組編輯技術,以極高的精確度在iPS細胞中創建了突變,從而無需患者樣本即可對疾病進行建模。因此,即使在患者樣本稀少或無法獲得的情況下,也將使疾病的研究變得更加容易。 相關結果發表于Nature Communications。 DNA雙螺旋結構描述了堿基互補配對的情況。 進化過程中我們產生了很多修復配對錯誤的機制。其中,兩種最常被研究的機制分別為非同源末端連接和同源性定向修復。 此外, Knut Woltjen教授實驗室一直在研究第三種鮮為人知的修復系統,以開發新的基因編輯技術。 微同源性介導的末端連接[MMEJ]由于其側翼為長度較短的相同序列,因此被稱為微同源性。 通過使用MHcut基因分析工具......閱讀全文
研究發現DNA損傷修復與DNA轉錄的協同作用
最近,來自挪威科學技術大學的Barbara van Loon博士等人在遺傳信息修復方面有了新發現,該發現發表在最近的《Nature Communications》雜志上。 Van Loon的研究小組發現,閱讀DNA的分子元件和糾正DNA錯誤的分子元件可以協同工作。(圖片來源:NTNU) Va
DNA修復體系摧毀HIV病毒機理揭開
據物理學家組織網1月21日報道,美國約翰·霍普金斯大學通過實驗,詳細揭示了一種細胞機制是如何保護一種免疫細胞不受人類免疫缺陷病毒(HIV)感染的。研究人員認為,這一發現為從體內根除HIV提供了一條新途徑。相關論文發表在1月21日的美國《國家科學院學報》上。 這一機制有兩個關鍵部分:高濃度的
Cell:DNA修復必不可少的酶
最近,澳大利亞國立大學(ANU)和德國海德堡大學的科學家們,發現了DNA修復過程中的一個重要組成部分,將為開發新的抗癌藥物打開大門。相關研究結果發表在10月27日的《Cell》雜志。本研究資深作者、ANU副教授Tamás Fischer說,這項研究發現,由DNA和RNA組成的混合結構,對于DNA損傷
DNA修復蛋白研究進入亞納米時代
近日,中國科學技術大學蔡剛團隊與南京農業大學王偉武團隊合作,在DNA修復的關鍵蛋白ATR激酶研究方面獲得重大突破,在國際上首次在亞納米尺度上描繪出ATR激酶的三維結構。通過獲知這種蛋白對DNA損傷的響應機制,有望指導抗癌新藥開發。國際權威學術期刊《科學》12月1日發表了該成果。 據了解,人體細
DNA修復機制如何幫助抵御癌癥
2015年的諾貝爾化學獎頒發給了細胞DNA修復機制的相關研究,而理解細胞如何修復損傷的DNA對于開發有效的抗癌療法或許非常重要。通過揭示機體細胞如何自發地修復引發疾病的DNA突變,研究者或許就可以幫助開發改善治療癌癥的化療方法的有效性。 研究者Nora Goosen表示,我們可以利用知識來戰勝
癌細胞“劫持”DNA修復途徑來擴散
生物通報道:最近,美國匹茲堡大學癌癥研究所(UPCI)的科學家發現,癌細胞能夠“劫持”DNA修復途徑來防止端粒(染色體的端帽)縮短,從而使腫瘤細胞擴散。相關研究結果發表在11月8日的《Cell Reports》雜志上。 在一個細胞形成的時候,有一個倒計時鐘開始滴答作響,決定了細胞能活多久。這個
DNA修復是維護生命健康的根本
“這是很重要的工作。”得知2015年諾貝爾化學獎頒給了三位從分子層面上研究DNA修復機制的科學家——托馬斯·林達爾、保羅·莫德里奇和阿齊茲·桑賈爾,中科院基因組研究所研究員楊運桂對科技日報記者說,DNA修復機制是維持生命體遺傳物質DNA穩定性和健康的根本。 20世紀70年代以前,科學界一直認
揭秘古老蛋白修復損傷DNA的機制
通過對用于制造啤酒和面包的酵母進行研究,來自匹茲堡大學的科學家們日前揭開了一種新型機制,即古老蛋白修復DNA損傷的分子機制,同時研究者還揭示了修復過程發生功能障礙引發癌癥的機制,相關研究刊登于國際雜志Nature Communications上,該研究或為開發新型的抗癌療法帶來希望。 在人類機
DNA斷裂修復增加基因突變風險
據美國物理學家組織網近日報道,美國印第安納大學與普渡大學印第安納波利斯聯合分校(IUPUI)和瑞典優密歐大學(Umea University)最近的一項聯合研究顯示,有一種細胞用于修復自身DNA斷裂的方法(稱為斷裂誘導復制),比正常合成DNA產生的基因變異要高出2800倍。
Cell:DNA修復必不可少的酶
最近,澳大利亞國立大學(ANU)和德國海德堡大學的科學家們,發現了DNA修復過程中的一個重要組成部分,將為開發新的抗癌藥物打開大門。相關研究結果發表在10月27日的《Cell》雜志。 本研究資深作者、ANU副教授Tamás Fischer說,這項研究發現,由DNA和RNA組成的混合結構,對于D
DNA損傷修復相關疾病取得新突破
華沙破損綜合征(Warsaw breakage syndrome,WABS)是一種可導致多種畸形的遺傳疾病,患者伴隨輕度到重度智力障礙,從出生開始身體發育受阻,導致身材矮小和小頭畸形。患者具有獨特的面部特征,包括額頭小、短鼻子、小下巴、人中平坦以及臉頰突出,其他常見特征包括內耳神經損傷引起的“感
《科學》:受損DNA修復機理被揭示
瑞典卡羅林斯卡醫學院日前說,他們研究發現了受損DNA(脫氧核糖核酸)的修復機理,這將有助于癌癥研究。?卡羅林斯卡醫學院的卡米拉·肖格倫在7月14日向記者提供的資料中說,細胞分裂前,一個DNA分子將會被復制成兩個,并通過一種叫做Cohesin的物質黏合在一起。一旦兩個DNA分子分開太早,新生成的細胞中
Nature:修復線粒體DNA損傷逆轉衰老
在醫療技術日趨完善的今天,健康不再是人們唯一所追求的,養生、保養等越來越成為人們津津樂道的話題,人人都想要永葆青春,而這其中最大的敵人便是“衰老”。之前《Science》雜志有報道稱衰老與線粒體DNA損傷相關,一直以來,科學家們將衰老歸因于遺傳及基因的損傷,卻并未深思過這種損傷是否可逆。而來自阿
DNA修復的一個未知秘密
加拿大阿爾伯塔大學醫學及牙科學院的腫瘤學教授Michael Hendzel非常清楚,幾乎沒有人能控制他們遺傳密碼的穩定性。但是,他希望,他最新的一項研究,將有助于影響醫學這一難以捉摸和重要的一面。最近在《Nature Cell Biology》發表的一項研究中,他帶領的研究小組,探討了DNA修復
DNA損傷修復對免疫的作用介紹
DNA修復功能先天缺陷的病人的免疫系統也常是有缺陷的,主要是 T淋巴細胞功能的缺陷。隨著年齡的增長細胞中的DNA修復功能逐漸衰退,如果同時發生免疫監視機能的障礙,便不能及時清除癌化的突變細胞,從而導致發生腫瘤。所以, 衰老、DNA修復、免疫和腫瘤四者是緊密關聯的。
細菌DNA轉錄偶聯修復的結構基礎
?活躍的轉錄基因中的DNA損傷修復比基因組中不活躍的區域更迅速。在細菌中,這個過程被轉錄修復偶聯因子(transcription repair coupling factor , TRCF)介導。TRCF破壞DNA損傷位點的處的RNA聚合酶,并重新啟動DNA切除修復機制(DNA excisi
DNA錯配修復的概念和過程
錯配修復(mismatch repair,MMR):在含有錯配堿基的DNA分子中,使正常核苷酸序列恢復的修復方式;主要用來糾正DNA雙螺旋上錯配的堿基對錯配修復的過程需要區分母鏈和子鏈,做到只切除子鏈上錯誤的核苷酸,而不會切除母鏈上本來就正常的核苷酸。
人類為何睡覺?或為修復遭損害DNA
人的一生中,有三分之一時間要用于睡覺。以前光知道,睡眠有助于加強記憶和提升學習能力。至于為什么會這樣,還有其它什么功效,則知之甚少,迄今為止缺乏系統科學解釋。 據英國《每日郵報》報道,以色列巴蘭大學里奧·艾波包姆教授領導的一個科研小組,最近開展了一項實驗。實驗是在斑馬魚身上進行的。斑馬魚基因
關于DNA損傷修復的檢測方法介紹
大部分DNA損傷修復都依賴于DNA的修復合成,所以對修復合成的測定常用來作為DNA修復的檢測方法。常用的有以下幾種: 1、放射法 在細胞培養物中加入氚標記的胸腺嘧啶核苷等放射源,用放射自顯影方法計數銀顆粒數來測定修復合成過程中參入到DNA分子中的量。 2、液體計數法 全稱液體閃爍計數法用
新研究揭示DNA損傷后的組蛋白降解促進DNA修復
幾年來,Gasser及其研究團隊一直在研究染色質結構如何在應對DNA損傷的過程中發生變化,以便了解這些變化是否以及如何提高修復速度。在早期的一項研究中,Gasser實驗室的前博士生Michael Hauer發現,染色質對急性DNA損傷既有局部的反應,也有全基因組范圍內的反應,大約30%的組蛋白在全基
DNA損傷修復信號通路相關因子WRN
該基因編碼dna螺旋酶蛋白recq亞家族的一個成員。編碼的核蛋白在維持基因組穩定性中起著重要作用,在dna修復、復制、轉錄和端粒維持中發揮著重要作用。該蛋白在其中心區域包含一個n端3'到5'的外切酶域、一個atp依賴的螺旋酶域和rqc(recq螺旋酶保守區)域,以及一個c端hrdc(
DNA損傷修復信號通路相關因子MUTYH
該基因編碼一種參與dna氧化損傷修復的dna糖苷酶。這種酶在腺嘌呤與鳥嘌呤、胞嘧啶或8-氧-7,8-二氫鳥嘌呤(一種主要的氧化損傷的DNA損傷)不適當配對的部位從DNA主干上切除腺嘌呤堿。蛋白質定位于細胞核和線粒體。這種基因產物被認為通過在氧化損傷后引入單鏈斷裂而在細胞凋亡信號中發揮作用。該基因突變
DNA損傷修復信號通路相關因子SDHC
這個基因編碼四個核編碼亞單位之一,包括琥珀酸脫氫酶,也被稱為線粒體復合物ii,一個三羧酸循環和線粒體有氧呼吸鏈的關鍵酶復合物。編碼的蛋白質是兩個完整的膜蛋白之一,它們將復合物的其他亞單位(形成催化核心)固定在線粒體內膜上。這個基因在不同染色體上有幾個相關的假基因。這個基因的突變與副神經節瘤有關。另外
DNA損傷修復信號通路相關因子DPYD
該基因編碼的蛋白是嘧啶分解代謝酶,是尿嘧啶和胸腺嘧啶分解代謝途徑的起始和限速因子。該基因突變導致二氫嘧啶脫氫酶缺乏,嘧啶代謝錯誤與胸腺嘧啶尿嘧啶尿有關,癌癥患者接受5-氟尿嘧啶化療后毒性增加。兩個編碼不同亞型的轉錄變體已經被發現。The protein encoded by this gene is
DNA損傷修復信號通路相關因子FANCI
fanconi貧血互補組(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也稱為brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也稱為brip1)、fancl、fancm和fancn(也稱為palb2)。先前定義的組fanch與fanca相
DNA損傷修復信號通路相關因子BLM
bloom綜合征基因產物與含有dna解旋酶的desh盒recq亞群有關,具有dna刺激的atp酶和atp依賴的dna解旋酶活性。引起布魯姆綜合征的突變會刪除或改變螺旋酶基序,并可能使3'-5'螺旋酶活性喪失。正常蛋白可能起到抑制不適當重組的作用。[由RefSeq提供,2008年7月]
DNA損傷修復信號通路相關因子PRKDc
該基因編碼dna依賴性蛋白激酶(dna-pk)的催化亞單位。與ku70/ku80異二聚體蛋白共同參與dna雙鏈斷裂修復和重組。編碼的蛋白質是PI3/PI4激酶家族的成員。[由RefSeq提供,2010年7月]This gene encodes the catalytic subunit of the
Nature:DNA修復新模式解答轉錄爭議
紫外線和其他環境因素不多對我們的DNA造成破壞,可以說我們的健康在很大程度上依賴于細胞發現和修復DNA損傷的能力。紐約大學醫學院的一項新研究展示,RNA聚合酶負責在基因組中搜尋DNA損傷,并招募盟友對其進行修復。這一機制能夠有效減少突變,幫助人體控制癌癥和其他疾病。這項研究由Evgeny N
DNA損傷修復信號通路相關因子NBN
該基因突變與nijmegen破碎綜合征(一種以小頭畸形、生長遲緩、免疫缺陷和癌癥易感性為特征的常染色體隱性染色體不穩定綜合征)有關。編碼蛋白是由5種蛋白質組成的MRE11/RAD50雙鏈斷裂修復復合物的成員。這種基因產物被認為與DNA雙鏈斷裂修復和DNA損傷誘導的檢查點激活有關。Mutations
DNA損傷修復信號通路相關因子FANCF
fanconi貧血互補組(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也稱為brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也稱為brip1)、fancl、fancm和fancn(也稱為palb2)。先前定義的組fanch與fanca相