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    納米孔測序技術

    測序長度和準確率的快速提升使得納米孔測序有望顛覆DNA測序市場。紐約威爾康奈爾醫學院的計算生物學家Christopher Mason喜歡在會議上表演一個“絕活”:他和同事先從志愿者手機上收集DNA樣本,然后就能在一個小時內現場進行譜系分析,甚至敘述志愿者一天的生活細節。“我們能從留在手機上的DNA信息推測誰剛剛吃了橘子或者誰吃了豬肉。”Mason說。Scott Tighe (左) 和 DavidGoerlitz 正在使用MinION設備,在南極的泰勒谷對微生物DNA進行測序。圖片來源:Sarah JohnsonMason之所以能夠進行如此快速的分析,主要得益于英國牛津納米孔技術公司(ONT)研發而成的一種手持測序設備——MinION。MinION通過將DNA長鏈穿過納米孔,探測由DNA中四種核苷酸引發的微小電流變化,從而讀取序列信息。Mason以一種輕松隨性的方式大致展示了該設備的性能,而早期用戶已經利用它取得了一些引人矚目的科......閱讀全文

    納米孔直接RNA和cDNA長讀長測序概述

      RNA測序已經在生物學和醫學的各個領域取得了前所未有的發展。在包括癌癥在內的諸多疾病中,轉錄異構體的表達和用途是健康組織和患病組織之間變異的重要來源。鑒定差異剪接的異構體和融合轉錄本,可以為疾病的診斷和治療提供信息。RNA測序還有助于揭示從單細胞到整個組織的轉錄組動力學。同時,cDNA測序也極大

    新型納米孔器件有望用于表觀遺傳學快捷測序

    新華社布魯塞爾5月9日電(記者潘革平)比利時校際微電子中心(IMEC)9日發表公報說,該中心成功開發出一種能直接讀取單分子DNA(脫氧核糖核酸)堿基的新型光學納米孔器件,有望用于遺傳學研究快捷測序。 據介紹,新型器件結合了表面增強拉曼光譜和納米孔流體技術,能以超高分辨率,實現無標記檢測DN

    科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法

      長期以來,直接讀取蛋白質的一級結構存在許多困難。科學家通常會根據基因序列和氨基酸密碼子表來“破譯”蛋白質的氨基酸序列。由于轉錄后修飾和翻譯后修飾等生命活動的存在,氨基酸序列破譯結果并非完全正確,甚至與真實序列有很大差異。近期,荷蘭科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法,該技術能夠讀取蛋白質信息內容,

    一種全新的高精度納米孔蛋白測序法

      長期以來,直接讀取蛋白質的一級結構存在許多困難。科學家通常會根據基因序列和氨基酸密碼子表來“破譯”蛋白質的氨基酸序列。由于轉錄后修飾和翻譯后修飾等生命活動的存在,氨基酸序列破譯結果并非完全正確,甚至與真實序列有很大差異。近期,荷蘭科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法,該技術能夠讀取蛋白質信息內容,

    科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法

      長期以來,直接讀取蛋白質的一級結構存在許多困難。科學家通常會根據基因序列和氨基酸密碼子表來“破譯”蛋白質的氨基酸序列。由于轉錄后修飾和翻譯后修飾等生命活動的存在,氨基酸序列破譯結果并非完全正確,甚至與真實序列有很大差異。近期,荷蘭科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法,該技術能夠讀取蛋白質信息內容,

    納米孔測序聯合光學測繪揭示轉基因植物細節

      索爾克的研究人員利用最新的DNA測序技術,在分子水平上研究植物插入新基因后會發生什么。  索爾克的研究人員繪制了具有最高分辨率的轉基因植物系基因組和表觀基因組圖,為了精確地揭示插入一段外源DNA后,在分子水平上會發生什么。他們的研究結果發表在2019年1月15日的PLOS Genetics,闡明

    新型納米孔器件有望用于表觀遺傳學快捷測序

      比利時校際微電子中心(IMEC)9日發表公報說,該中心成功開發出一種能直接讀取單分子DNA(脫氧核糖核酸)堿基的新型光學納米孔器件,有望用于遺傳學研究快捷測序。  據介紹,新型器件結合了表面增強拉曼光譜和納米孔流體技術,能以超高分辨率,實現無標記檢測DNA中的遺傳編碼以及表觀遺傳變異。研究近期發

    哪些因素影響納米孔測序儀的重復性?

       掌上測序儀好不好?用過才知道。最近,五個試用了Oxford Nanopore MinION測序儀的實驗室評估了儀器的重復性,并在開發標準操作和參考數據。這些實驗室屬于MinION分析和參考聯盟(MARC),該聯盟由MinION早期試用計劃的參與者組成。目前,第一階段的結果已經發表在開放獲取期刊

    三代測序的前奏:Illumina再訴牛津納米孔

      Illumina今天正式宣布起訴Oxford Nanopore,訴訟涉及后者在納米孔測序相關領域涉嫌侵犯Illumina兩項ZL。  Illumina同時向美國國際貿易委員會和美國南加州地方法院提出此次訴訟,起訴Oxford Nanopore侵犯其美國ZL局第8673550號和9170230號Z

    第三代高通量測序技術簡介——納米孔

    ??? 第一代Sanger法為DNA測序打開了大門,但它高昂的費用限制了在大規模測序工程上的使用。當今發展迅猛的第二代高通量測序設備,包括Illumina的Solexa、Roche 454系列以及ABI的SOLiD系統等,使測序費用大幅降低到60-1美元/megabase。 它們共同的缺點是

    英一公司稱研發出納米孔基因測序技術

      早上起來刷個牙,就能順便檢測自己有沒有患癌癥或者老年癡呆的危險。這種便利方式離我們不遠了。英國一家公司首席技術官克萊夫·布朗24日在一次醫學會議上說,借助納米孔基因測序技術,有望很快實現測序儀微型化,從而使它們“無處不在”,持續監測我們的健康狀況。  納米孔基因測序技術采用微

    武大聯合團隊開發納米孔靶向測序-快速“捕獲”新冠病毒

       武漢大學聯合團隊創新性開發了納米孔靶向測序檢測方法(NTS),能大幅提升病毒陽性檢出率,并能實現當天同時檢測新冠和其他10大類、40種常見呼吸道病毒并監測病毒突變。  3月7日,該團隊在預印版平臺medRxiv發表題為《納米孔靶向測序精準全面檢測新冠病毒以及其他呼吸道病毒》的研究論文。  既往

    nanoporetech-使用納米孔測序技術的微生物學

    完整的細菌,真菌和病毒(DNA或RNA)基因組,可進行長時間的納米孔測序。通過快速的病原體檢測方法(無論是在實驗室還是在野外),從環境或單一生物樣品中鑒定并鑒定微生物。如果需要,還應附有抗菌素耐藥性分析。使用直接RNA或cDNA方法對全長轉錄本進行測序,以進行準確的基因表達和轉錄本亞型分析。?通過長

    2016國家自然科學基金:納米孔測序技術

      來自國家自然科學基金委員會的消息,8月17日國家自然科學基金委員會公布了2016年國家自然科學基金申請項目評審結果,其中面上項目16934項、重點項目612項、創新研究群體項目38項、優秀青年科學基金項目400項、青年科學基金項目16112項、地區科學基金項目2872項、海外及港澳學者合作研究基

    拉曼光譜應用:新型光學納米孔器件有望用于快捷測序

      比利時校際微電子中心(IMEC)9日發表公報說,該中心成功開發出一種能直接讀取單分子DNA(脫氧核糖核酸)堿基的新型光學納米孔器件,有望用于遺傳學研究快捷測序。  據介紹,新型器件結合了表面增強拉曼光譜和納米孔流體技術,能以超高分辨率,實現無標記檢測DNA中的遺傳編碼以及表觀遺傳變異。研究近期發

    納米孔測序重大升級,超高準確度,向臨床診斷邁進!

    近年來,第三代基因測序技術發展迅速,在基因組學研究以及臨床疾病診斷領域備受青睞。該領域上游企業英國Oxford Nanopore Technologies(以下簡稱“ONT”)因其測序技術在樣本處理以及成本等方面占據較大優勢,而受到國內基因測序服務企業的鐘愛。相較于二代測序,三代測序技術擁有單分子無

    首次!納米孔測序讓流感病毒終于“無所遁形”|-Nature

      4月12日,這項研究的領導者、美國疾病控制和預防中心(CDC)的微生物學家John Barnes在給bioRxiv服務器(生命科學領域專有的預印本文獻庫)的預印本(a preprint posted)中介紹了這項工作,他說:“我們第一次可以真正開始觀察基因組在其原始狀態的本質,這確實開始開辟了很

    中國科學家提出納米孔糖測序技術路線圖

    基于在納米孔糖測序這一前沿方向的率先探索和重要進展,中國科學院上海藥物研究所研究員高召兵、副研究員夏冰清團隊應邀對納米孔糖測序的發展和應用前景進行展望,給出了納米孔糖測序儀器的設計方案,并首次系統性提出了可能的納米孔糖測序路線。相關綜述發表于《化學科學》。糖類結構的精準解析是研究糖類在生命過程中的作

    利用納米孔測序技術揭示基因表達的染色質調控基礎

      作為染色質的基本單元,核小體由大約147 bp的DNA和組蛋白八聚體(H2A, H2B, H3和H4)組成。核小體的動態定位和折疊組織會產生兩種不同的染色質狀態:“開放”(open)和“閉合”(closed)。核小體的定位和染色質狀態的動態變化對以DNA為模板的生物學過程(比如,轉錄、DNA復制

    國產納米孔測序儀市場化加速,這家企業做對了什么?

    “目前,已有超過100個機構使用齊碳QNome測序平臺。”?在6月28日舉行的新品發布會上,齊碳科技聯合創始人謝丹博士回顧了公司商業化探索的第一項成績單。QNome-3841是齊碳科技研發的國內首款商業化納米孔測序儀,在2021年12月正式面市,隨后被迅速應用到疾病控制與預防、病原體研究、動物疫病防

    INCSeq:提高納米孔測序準確性的新方法

      新加坡基因組研究院(GIS)的研究人員開發了一種方法,稱為INC-Seq,能夠提高牛津納米孔技術公司掌上測序儀MinIon的測序準確性。目前他們正努力改進該方法,將它應用到復雜樣本的16S測序、RNA測序以及基因組復雜區域測序等中。  研究人員在近日發表于《Giga Science》的文章中描述

    牛津納米孔收購加拿大Northern-Nanopore-擴張固態納米孔領域

      近日,牛津納米孔技術公司(Oxford Nanopore)表示收購加拿大生物技術初創公司Northern Nanopore Instruments(NNi),這家公司開發了一種固態納米孔制造技術。  本次收購沒有披露財務條款。  據Oxford Nanopore介紹,NNi專門從事低成本、精確的

    固態納米孔:下一代DNA測序技術原理、工藝與挑戰

      科學通報,中國科學C輯:生命科學,這兩份期刊均是由中國科學院和國家自然科學基金委員會共同主辦的,我國學術期刊中的知名品牌,被國內外各主要檢索系統收錄,如國內的《中國科學論文與引文數據庫》(CSTPCD)、《中國科學引文數據庫》(CSCD)等;美國的SCI、CA、EI,英國的SA,日本的《科技文獻

    納米孔測序企業「今是科技」完成近億元B++輪融資

      3月3日消息,近日,國內納米孔測序技術領軍企業今是科技宣布完成近億元B++輪融資。本輪融資由國生資本(成都天府國際生物城投資公司)領投,川創投跟投,募集資金將用于加速全球首個“單堿基納米孔測序”(SNS)技術平臺的商業化落地,推動其在臨床診斷、科研服務及公共衛生領域的規模化應用。  今是科技成立

    基于納米孔的第三代測序技術:每個人支付得起的基因測序

    典型的納米孔測序過程示意圖   最近的一項研究發現,在低NaCl濃度下長鏈DNA更利于納米孔測序,這為納米孔測序技術的發展提供了線索。   這篇名為“鏈長對DNA構象及摩擦行為的影響”的研究論文發表于《中國科學:技術科學》英文版2013年第12期,從摩擦學角度初步探討了不同鏈長DNA在納米孔測序

    可控介電擊穿納米孔制備與納米孔捕獲機制研究取得進展

    固態納米孔作為單分子檢測領域的變革性工具,憑借無標記、實時分析的核心優勢,為DNA、RNA及蛋白質等生物分子的精準表征提供了全新途徑,在生命科學基礎研究與臨床診斷領域具有重大應用潛力。在固態納米孔可控制備領域,傳統可控介電擊穿技術因存在制備隨機性強、精度調控難等問題,限制了其產業化應用。針對這一瓶頸

    中國首發納米孔RNA直接測序揭示其在全長轉錄本中的作用

      近日發表在RNA Biology上的研究中,來自中國科學院北京生命科學研究院、動物研究所及中國科學院大學等多家單位的科學家們首次通過5’-Cap捕獲法對蝗蟲的 RNA直接測序,揭示了Piwi 外顯子化模式的廣泛建立以及蝗蟲轉錄組中的轉座子(TEs)對RNA剪接的重要作用。  轉座子(TEs)在后

    英研發第三代基因測序技術-用納米孔單分子讀取

      基于納米孔的單分子讀取技術,英國牛津納米孔公司成功研發出第三代基因測序技術。該測序技術讀取數據更快、有望大大降低測序成本,改變個人醫療的前景。   當前,基因測序工作費時且昂貴,測序時,分子必須進行多次復制(這一步被稱為擴增),同時進行熒光示蹤標記,這一過程會帶來錯誤,因此,一個基因要被測序多

    直接分辨單個氨基酸分子小小納米孔破解蛋白質測序難題

    蛋白質是生命活動的主要承擔者。測量組成蛋白質的氨基酸的排列順序被稱為蛋白質測序。由于缺乏普適、高效的測序技術,人類對蛋白質的了解還極其有限,生命世界的諸多奧秘仍待破解。近日,浙江大學化學系馮建東團隊提出了基于固體納米孔的氨基酸識別方法。他們構建了直徑為1納米左右的人工納米孔,可進行單個氨基酸分子的精

    武漢大學開發納米孔測序法,較qPCR陽性率檢測率提升43.8%

      2019年底爆發新型冠狀病毒性肺炎COVID-19疫情,全球已有許多感染和死亡病例,截止2020年3月1日,累計確診超8萬人,死亡近三千例,但仍存在許多臨床疑似病例無法確診。既往COVID-19診斷依賴于qPCR核酸檢測,但是該方法顯示出較高的假陰性率和低敏感性(陽性檢出率僅為30%至50%),

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