研究揭示水稻RNA識別結構域蛋白抑制外源基因沉默的機制
植物是復雜的生物系統。植物體內基因的表達受到多種水平的調控,如轉錄水平、轉錄后水平、DNA甲基化/去甲基化等,從而對基因表達進行精密高效的調控。 中國科學院遺傳與發育生物學研究所張勁松研究組篩選OsEIN2過表達材料的抑制子,鑒定到一個包含RNA識別結構域(RRM)的蛋白SOE。SOE可以與剪接復合體組分互作,并結合到DNA去甲基化酶基因DNG701 mRNA上促進其剪接和穩定,從而維持DNG701介導的啟動子去甲基化與轉基因表達。 基于水稻三千份測序數據的分析發現,SOE基因啟動子及編碼區的核苷酸多態性可分為7個單倍型,且Hap 1單倍型與粒重顯著正相關。此外,研究發現SOE基因突變能夠使水稻籽粒增大并提高單株產量。這一研究揭示了基因表達調控新機制,并為促進水稻和其他作物產量提升提供了優異的候選等位基因。 3月20日,相關研究成果在線發表在《新植物學家》(New Phytologist,DOI:10.1111/nph......閱讀全文
RNA提取
RNA提取(主要內容如下)Tips for Handing RNA?Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum??Basic Procedures for Handing
RNA降解
新鮮細胞:如果試劑沒有問題,且外源性污染也可以排除,那么降解幾乎都來自裂解液的用量不足。如? 果將裂解液直接加入培養皿中裂解細胞,一定要使裂解液能覆蓋住細胞。 2. 新鮮組織:某些富含內源核酸酶的樣品(如肝臟,胸腺等),即使使用電動勻漿器勻漿也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮條件下將組織
RNA電泳
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RNA-電泳
①電泳RNA 所用器械如制膠的模具、梳子、電泳槽等用肥皂粉洗干凈后用雙蒸水沖洗二遍后在室溫晾干備用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %瓊脂糖凝膠,倒膠時溴化乙錠(E直接加入凝膠中。③制備好的瓊脂糖凝膠板放入電泳槽后再加入經高壓滅菌過的1XTBE ,液面只能剛好同膠面平齊,緩沖液不要淹過膠面。④點樣
指導RNA
中文名稱指導RNA英文名稱guide RNA;gRNA定 義一種小分子RNA,約含60~80個核苷酸,在RNA編輯中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或刪除的信息。由小環DNA及大環DNA編碼的指導RNA均帶有編輯區的序列信息,可介導編輯過程。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調
RNA電泳
RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and ?TransferUsing glyoxal
RNA標記
RNA標記是將標記物(如放射性同位素、熒光素或酶)共價地連接到RNA,通過檢測標記物,進而實現對RNA鑒別和檢測的目的。RNA標記在分子探針領域應用廣泛,在疾病診斷方面也很有前景。 理想的RNA標記方法應符合以下要求: 1. ?操作簡單,靈敏度高 2. ?不影響堿基配對的特異性 3. ?不影響RN
Quantitating-RNA
RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an
RNA-剪接
中文名稱RNA 剪接英文名稱RNA splicing定 義在真核細胞核中從RNA初始轉錄物切除內含子,連接外顯子形成成熟的mRNA的過程。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)
RNA-Electrophoresis
Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th
關于小干擾RNA的RNA激活介紹
已經發現dsRNA還可以激活基因表達,這種機制被稱為“小RNA誘導的基因激活”或RNAa。已經顯示靶向基因啟動子的dsRNA誘導相關基因的有效轉錄激活。使用合成的dsRNA在人細胞中證明RNAa,稱為“小活化RNA”(saRNA)。尚不清楚RNAa是否在其他生物體中是保守的。
RNA干擾相關知識Small-interfering-RNA(siRNA)
Small interfering RNA(siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。
“院士港”的海水稻
一粒稻谷,是一枚小舟,自七千年前,自河姆渡口,漸次蘇醒,順水漂流,泊入院士港。 院士港,是青島國際院士港,坐落于李滄區。10月剛扯開金色大幕,我乘著高鐵的激情和速度,追逐著這粒稻谷小小的身影,來到院士港。十六號樓,是青島海水稻研究發展中心,中國工程院院士袁隆平是該研發中心主任和首席科學家,這兒
水稻葉片寬度這樣調節
水稻正常植株與窄葉突變體nal21? ? ? ?中國農科院作科所供圖水稻葉片寬度調控基因NAL21在不同部位的表達?? ?中國農科院作科所供圖 2月16日,《植物生理》(Plant Physiology)在線發表中國農業科學院作物科學研究所作物功能基因組研究創新團隊揭示的水稻葉片寬度調節的新機制
破解水稻高產優質“密碼”
一粒種子可以改變世界,然而如何才能“多快好省”地培育出高產又優質的“黃金”種子? 中國科學院遺傳與發育生物學研究所李家洋課題組、中國科學院上海生命科學研究院韓斌課題組和中國農業科學院水稻研究所錢前課題組經過了20多年的密切合作、協同創新,給出了答案——這粒種子可以在“水稻高產優質性狀形成的分子
農桿菌介導水稻轉化
實驗概要本實驗介紹了農桿菌介導的水稻轉化。主要試劑GUS染色液:100 mmol/L NaPO4 (pH7.0);0.1% Triton X-100;10 mmol/L EDTA;0.5 mmol/L亞鐵氰化鉀頭抱霉素,乙醇,次氯酸鈉溶液主要設備高速離心機,培養箱,人工氣候室實驗材料水稻種子實驗步驟
學者首次發現植物環狀RNA編碼蛋白
華南農業大學植物保護學院周國輝教授/楊新副研究員團隊在國家自然科學基金等項目的資助下,首次發現植物環狀RNA編碼多肽的功能,并揭示該多肽賦予水稻對多種病原物的廣譜抗性。2月25日,相關成果發表于《新植物學家》(New Phytologist)。水稻條紋花葉病毒的感染促進水稻植株中circ-WRKY9
“優質高產水稻生產技術集成與示范”助山西水稻產業提升
近日,山西省星火計劃“優質高產水稻生產技術集成與示范” 項目通過山西省科技廳組織的專家驗收。 該項目圍繞水稻新品種晉稻9號、11號及配套技術轉化,以項目為平臺,品種為載體,展示為亮點,技術服務為保障,技術服務體系建設和培育大米品牌戰略為主線,提高水稻綜合生產能力為目標。在項目實施區域太原、
我國主導水稻基因國際研究離“設計水稻”更近一步
記者日前從中國農業科學院獲悉,由中國科學家主導的“3010份水稻基因組計劃”結出碩果,剖析了水稻核心種質資源的基因組遺傳多樣性,這一研究的重大成果將提升全球水稻基因組研究和分子育種水平,加快優質、廣適、綠色、高產水稻新品種培育。 水稻種群的基因有著豐富的多樣性和復雜的作用機制,是水稻育種改良的
北方水稻研究中心成立,加速水稻產業創新與提質增效
中國水稻研究所北方水稻研究中心近日在黑龍江省寶清縣正式成立,標志著我國首個國家級北方水稻科研平臺的建設取得了重要進展。該中心的任務是集聚專業力量和整合資源,專注于解決北方水稻生產中的重大科技難題,以促進農業產業的升級和提質增效。9月5日,中國水稻研究所北方水稻研究中心在黑龍江省雙鴨山市寶清縣落成。艾
表觀遺傳調控水稻重要農藝性狀研究獲進展
轉座子(transposon)是一段自身能夠插入到基因組上的DNA片段,上世紀40年代,芭芭拉·麥克林托克(Barbara McClintock)首先在玉米中發現了轉座子。從簡單的細菌到復雜的人類,轉座子廣泛存在。轉座子隨機插入到重要基因中,會引發疾病、癌癥和其他生理缺陷。DNA甲基化、組蛋
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(1)
Rnai最近由于RNA 干擾(RNA interference,RNA i)的發現使反義領域的研究增多。這種自然發生的現象最早是在秀麗線蟲中發現的(1),是序列特異性地使轉錄后的基因沉默的有力機制。由于最近兩年在 RNA i領域取得的進步,已經有許多這方面的綜述發表(2-4)。RNA 干擾是
純化RNA實驗——從組織中純化總RNA
實驗材料組織試劑、試劑盒RNA 抽提緩沖液氯仿實驗步驟1. 從動物取下組織,直接進行第 2 步或在液氮中快速冷凍新鮮解剖的組織。冷凍后的組織可以貯存在 -70℃。2. 組織(0.05~0.3 g)在 2.0 ml RNA 抽提緩沖液中勻漿。3. 每管加 200 μl 氯仿,混合均勻,冰浴 15 分鐘
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(2)
1RNA i的發現RNA i是在研究秀麗新小桿線蟲(C. elegans)反義RNA (antisenseRNA )的過程中發現的,由dsRNA 介導的同源RNA 降解過程。1995年,Guo等發現注射正義RNA (senseRNA )和反義RNA 均能有效并特異性地抑制秀麗新小桿線蟲par
Science聚焦:球形RNA讓RNA療法重獲新生
幾十年來,RNA療法在治療遺傳疾病的道路上走得并不順遂。不過,隨著新型RNA(球形核酸SNA)在人體試驗中取得成功,這一領域似乎煥發出新的活力。Science網站特別撰文介紹了這項重要突破。 RNA療法一般是用反義RNA破壞疾病相關蛋白的生產。在美國化學學會(ACS)上周的一次會議上,研究人員
什么是RNA?RNA的作用是什么?
核糖核酸(縮寫為RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物細胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。RNA由核糖核苷酸經磷酸二酯鍵縮合而成長鏈狀分子。一個核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和堿基構成。RNA的堿基主要有4種,即A(腺嘌呤)、G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶),其中,U(尿
什么叫做外源性RNA和內源性RNA
核糖核酸(縮寫為RNA,即RibonucleicAcid),存在于生物細胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。RNA由核糖核苷酸經磷酸二酯鍵縮合而成長鏈狀分子。一個核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和堿基構成。RNA的堿基主要有4種,即A腺嘌呤、G鳥嘌呤、C胞嘧啶、U尿嘧啶,其中,U(尿嘧啶)取代了DNA
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(3)
SiRNASmall interfering RNA (siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。ShRNAshRNA 短發夾RNAshRNA
水稻條紋花葉病毒在寄主水稻上的侵染機制獲揭示
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508167.shtm
利用水稻考種系統準確估算水稻田間生產力
?? 水稻考種是水稻新品種考察中的一項重要內容,主要目的就是通過對水稻形狀的相關信息測量來進行田間估產,評價水稻品種的田間生產力,由于過去采用人工考種存在著許多的弊端,比如工作量大,易出錯等,因此隨著科技的發展,水稻考種工作開始逐漸被水稻考種系統來代替,并在實際的工作過程中,發揮了科技應用于農業的巨