Oxford Nanopore的用戶組會議于上周四在倫敦召開。媒體并沒有被邀請,不過一些用戶和博主已經在Twitter上透露了最新消息。Oxford Nanopore正在開發一款智能手機供電的納米孔測序儀以及一款低成本的文庫制備系統。
Oxford Nanopore的用戶組會議于上周四在倫敦召開。媒體并沒有被邀請,不過一些用戶和博主已經在Twitter上透露了最新消息。Oxford Nanopore正在開發一款智能手機供電的納米孔測序儀以及一款低成本的文庫制備系統。
據首席技術官Clive Brown介紹,Oxford Nanopore正在開發一款名為SmidgIon的納米孔設備。這款設備采用與MinION和PromethIon設備相同的納米傳感技術,但它比MinION更小,每個流動槽中有256個通道。它可以通過充電接口和耳機接口與智能手機或其他移動設備連接,運行4-5小時。
SmidgIon設備適合各種現場分析,有望應用在疾病爆發時病原體的遠程監控,環境樣品的現場分析,食品、木材或野生動物的實時鑒定,以及農業環境的實地分析等。此產品有望在2017年第四季度推出。
Oxford Nanopore的Zumbador項目正在開發另一款簡單便攜的產品,希望將核酸提取和文庫制備融合在一個設備中。在示意圖中,這個設備直接插入流動槽。原始樣本在一端加入,從另一端出來,可立即用于測序。
據Brown介紹,第一臺PromethIon測序儀已于近期交付給了客戶。他展示了該平臺的一些內部數據,使用的是48個模塊化流動槽,每個含有3,000個通道。利用R9試劑,它的準確性和孔利用率與MinION一致。PromethIon能夠在每次48小時的運行內獲得高達6.2 Tb的數據,未來有望增加至12.4 Tb。
此外,帶有R7納米孔的流動槽將不再出售,而是被帶有R9納米孔的流動槽取代。新的流動槽采用更堅固的膜和新的解旋酶馬達蛋白。Brown表示,公司在新的流動槽上獲得的最長讀長達500 kb,目前正致力于提高通量和均聚物檢測。
公司表示,R9帶來更高的準確性,特別是對于1D序列,即只讀取DNA的一條鏈。R9流動槽以每秒250個堿基的速度測序,比之前R7的每秒70個堿基有很大提升,因此將大大提高MinION的產量。據Brown介紹,目前1D序列的準確性接近90%,而2D序列則在95%左右。
隨著R9流動槽的上市,Oxford Nanopore還將推出快速測序試劑盒。它的文庫制備只需要10分鐘,而且需要的耗材比以往更少,在MinION運行開始后立即分析數據。目前,這個試劑盒正被一些早期試用客戶測試,將盡快推出。
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