RPA 體系的重點是重組酶,這些酶與寡核苷酸引物形成復合體,并使引物與雙鏈 DNA 中的同源序列配對。單鏈 DNA 結合(SSB)蛋白與被取代的
DNA 鏈結合,并使形成的 D 環保持穩定。然后從引物啟動由聚合酶介導的 DNA
擴增,但前提是存在靶標序列。一旦啟動,擴增反應將快速進行,因此開始時只需一點靶標 DNA 拷貝數,高特異性 DNA
擴增在數分鐘內即可達到可檢出水平。
RPA 循環
RPA 的技術特點
為什么選擇 RPA 方法?
◇ 速度
RPA 非常快速,在 37~42 °C 這一通常最適宜的反應溫度下,只需少量核酸分子即可在 3~10 分鐘(通常)內擴增至可檢出水平,但這將取決于靶標大小。在大部分情況下,只需要一個人即可在半小時內采集樣本、制備樣本、運行檢測并取得結果,并且無需專業培訓。
◇ 靈敏度
RPA 可檢測復合樣本中的單拷貝 DNA 和 10 拷貝甚至更少 RNA,而無需預先純化核酸。
◇ 特異性
RPA 具有高度特異性,該技術可從可能含有數百納克來自多個不同物種的不相關復合基因組 DNA(包括人 DNA)的樣本中識別并擴增單個 DNA 分子,抗干擾能力強。
◇ 恒溫運行
RPA 在恒定的低溫(37~42 °C 最適宜)下運行。對于某些應用,如果需要,即便體溫也可支持 RPA
擴增。該反應在偏離溫度及低溫設置下也表現穩健,即使在常規室溫 25 °C 下也將奏效,雖然反應速度會下降;
在此溫度下,只要此生物化學過程被正確配置,仍可在一小時內獲得結果。