看電泳槽多大，兩電極直接的距離，每cm 3~5V。例如一個20cm的電泳槽，電壓就應該設為60~100V間。電壓大，速度就快。還要考慮DNA長度，小片段DNA適宜用比較低的電壓。
DNA分子提取得到以后，需要通過電泳技術來檢測其數量和質量。自從瓊脂糖和聚丙烯酰胺凝膠被引入核酸研究以來，按相對分子質量大小分離DNA的凝膠電泳技術，已經發展成為一種分析鑒定DNA分子的重要實驗手段。
瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠電泳是基因操作的核技術之一，它能夠用于分離、鑒定和純化DNA片段。
