肺結核(TB)的流行,特別是耐多藥結核病(MDR-TB),已成為今天結核病治療的一個重大挑戰。浙江大學細胞生物學研究所李繼承教授領銜的課題組采用iTRAQ標記結合2D LC-MS/MS,以及Solexa測序對MDR-TB患者,藥物敏感結核病(DS-TB)患者,和健康對照組血清中的蛋白質組和miRNA組進行了比較分析,鑒定出MDR-TB診斷的潛在生物標志物。相關研究工作發表在1月刊的International Journal of Biological Sciences。
相比于DS-TB患者和健康對照組,課題組在MDR-TB患者血清中共鑒定出50個差異表達蛋白質和43個差異表達miRNAs(差異倍數>1.50或<0.60,P值<0.05)。研究人員發現22%的差異表達蛋白質和32.56%差異表達miRNAs是相關的,可以構建一個主要為補體系統的網絡。在MDR-TB患者,DS-TB患者,和健康對照組中,CD44抗原(CD44),凝血因子XI(F11),激肽原1(KNG1),miR-4433b-5p,miR-424-5p,和miR-199b-5p存在顯著差異表達。這個結果已被ELISA和SYBR Green qRT-PCR所驗證。與靶基因預測一致,miR-199b-5p與KNG1存在顯著負相關(r=-0.232,P=0.017)。此外,研究人員還建立了基于5個標志物(CD44,KNG1,miR-4433b-5p,miR-424-5p,和miR-199b-5p)的MDR-TB診斷模型。在本項目中,聯川生物協助課題組完成了血清miRNA測序分析,miRNA測序數據和蛋白質組定量數據關聯分析的工作。