Cell?Reports報道揭示非編碼RNA和轉座子在長壽中的作用機制
3月21日,中國科學院-馬普學會計算生物學伙伴研究所研究員韓敬東在《細胞-報告》(Cell Reports)上在線發表了題為Impact of Dietary Interventions on Noncoding RNA Networks and mRNAs Encoding Chromatin-Related Factors 的研究論文,該研究在探索能量限制調控非編碼RNA和轉座子表達的機制上取得了新進展。 對生活方式的不同干預,比如改變飲食中糖、蛋白質和脂肪的攝入比例,熱量的攝取以及能量消耗,可以大大影響人類對衰老相關疾病的易感度,在某些情況下,甚至可以影響其壽命。在不引起營養不良條件下的能量限制以及其他一些生活方式(比如自主鍛煉)可以減少衰老相關疾病,比如肥胖、二型糖尿病和心血管疾病的發生。在不發生代償性食物攝入增多的情況下,能量限制可以延長多個物種的平均和最長壽命。然而,人們對于在長壽過程中轉錄組的改變,尤其是受表......閱讀全文
我國科學家構建目前最大活躍DNA轉座子數據集
DNA轉座子也稱跳躍基因,可被用作基因工程工具。近日,中國科學院動物研究所張勇和王皓毅研究組開展了迄今為止最大規模的DNA轉座子活性篩選,構建了目前最大的活躍DNA轉座子數據集,極大擴展了基于DNA轉座子的基因工程工具箱。相關研究成果5日在線發表于《細胞》雜志。130個新型DNA轉座子和20個已知活
我國科研人員在DNA轉座子研究領域取得新突破
DNA轉座子是存在于染色體DNA上可自主復制和位移的基本單位,是基因組中一段可移動的DNA序列,可以通過切割、重新整合等一系列過程從基因組的一個位置“跳躍”到另一個位置,對于生命科學研究具有非常重要的意義。中國科學院動物研究所科研團隊基于自然界豐富的動物遺傳資源開展了迄今為止最大規模的DNA轉座子活
轉座子-Tol2-的轉座機制與轉座優勢詳述
轉基因,豈能不知Tol2 ? Tol2轉座子 提及轉基因,大家首先映入腦海的是什么呢?轉基因大豆?玉米?食用油?(對于那些一個都想不到的孩紙們,小編我只想哭暈在廁所)名詞很熟悉,各大超市隨處可見,可何為轉基因,如何得到轉基因產品?今天小編簡單來跟大家聊一聊。 所謂轉
我國創建世界上最大轉座子插入資源庫
不知你有沒有注意到,從菜市場買回來的玉米,有的是黃燦燦的,有的卻像個大花臉,中間夾雜著紫色、白色的玉米粒? 其實,這是玉米的天性使然。玉米基因中有很多非常活躍的轉座子,它們就像一支“小畫筆”,跳到哪個基因上,就會抹去那里本來的“顏色”。因此導致籽粒顏色變化有一部分是轉座子運動產生的。 轉座
轉座子-Tol2-的轉座機制與轉座優勢詳述
轉基因,豈能不知Tol2 ? Tol2轉座子 提及轉基因,大家首先映入腦海的是什么呢?轉基因大豆?玉米?食用油?(對于那些一個都想不到的孩紙們,小編我只想哭暈在廁所)名詞很熟悉,各大超市隨處可見,可何為轉基因,如何得到轉基因產品?今天小編簡單來跟大家聊一聊。 所謂轉
動物中DNA轉座子通過兩種機制介導基因重復
轉座子被認為是宿主基因組演化的重要推動力。其類型眾多,包含non-LTR(Long Terminal Repeat)型逆轉座子、LTR型逆轉座子、Helitron型DNA轉座子、TIR(Terminal Inverted Repeat)型DNA轉座子等,可引起包含基因重復(gene duplic
天津大學Cell子刊揭示反轉座子調控新機制
來自天津大學及約翰霍普金斯大學的研究人員在新研究中證實,與自身免疫病Aicardi-Goutières綜合征相關的一種蛋白質SAMHD1調節了反轉座子LINE-1及其LINE-1介導的Alu/SVA反轉錄轉座。相關研究論文發表在9月12日的《Cell Reports》雜志上。 文章的通
天津大學Cell子刊揭示反轉座子調控新機制
來自天津大學及約翰霍普金斯大學的研究人員在新研究中證實,與自身免疫病Aicardi-Goutières綜合征相關的一種蛋白質SAMHD1調節了反轉座子LINE-1及其LINE-1介導的Alu/SVA反轉錄轉座。相關研究論文發表在9月12日的《Cell Reports》雜志上。 文章的通
在動物中發現介導水平基因轉移的載體:病毒樣轉座子
幾十年來,科學家們已經知道基因可以從一種物種轉移到另一種物種,無論是動物還是植物。然而,這類看似不可能發生的事件是如何發生的,其機制仍然是未知的。如今,來自奧地利科學院分子生物技術研究所Alejandro Burga實驗室的研究人員在線蟲中發現了一種水平基因轉移(horizontal gene
研究揭示蘋果轉座子調控等位基因特異性表達機制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/8/484573.shtm ?蘋果花瓣顏色與MYB10和MYB110a的表達量相關。中國農科院果樹所供圖 近日,中國農業科學院果樹研究所蘋果資源與育種創新團隊聯合國內外科研機構,從全基因組層面上闡
酵母菌基因組轉座子的誘變實驗——基本方案
實驗材料誘變轉座子基因組文庫質粒DNA試劑、試劑盒10×TE緩沖液 pH 8.0無菌 E. coli tetskans (如 DH5c×)14 cm的LB培養基平板培養基中加入3 mg mL的四環素和40μg mL的卡那霉素LB培養基丙三醇無菌NotⅠ非限制性內切核酸酶及緩沖液Ura3_酵母菌培養一
轉座子-Tol2-的轉座機制與轉座優勢詳述(二)
當然,實踐是檢驗真理的唯一標準,2009年,Zoltán Ivics等[3]就為大家詳細闡述了Tol2轉座機制在鼠中的應用,具體流程如圖3,通過不斷地表型篩選,Tol2系統可以用于構建轉基因鼠和穩定的基因表達細胞系。?圖3 利用Tol2構建轉基因鼠和基因表達細胞系[3]3、Tol2轉座優勢與傳統的轉
轉座子-Tol2-的轉座機制與轉座優勢詳述(一)
Tol2轉座子提及轉基因,大家首先映入腦海的是什么呢?轉基因大豆?玉米?食用油?(對于那些一個都想不到的孩紙們,小編我只想哭暈在廁所)名詞很熟悉,各大超市隨處可見,可何為轉基因,如何得到轉基因產品?今天小編簡單來跟大家聊一聊。所謂轉基因,顧名思義,就是外源基因整合進入宿主基因組,目前哺乳動物系統最常
遺傳發育所等在表觀遺傳調控水稻轉座子活性方面獲進展
轉座元件是指在基因組中能夠移動或復制并重新整合到基因組新位點的DNA片段,它們對動植物基因組的組成、進化和基因表達具有重要影響。而在宿主基因組中,如果失去對轉座元件的有效抑制,這些元件將對基因表達和基因組的穩定性構成影響。水稻是主要的糧食作物同時也是重要的單子葉模式植物,其中
Nature子刊:華中農大發現轉座子可抑制mRNA翻譯
來自華中農業大學生命科學學院,作物遺傳改良國家重點實驗室的研究人員發現水稻中的一類DNA轉座子具有翻譯抑制功能,這揭示了微小反向重復轉座元件的新功能,對研究其他重復序列的功能提供了借鑒意義,同時也拓寬了對于轉座子的認識。 這一研究成果公布在3月3日的Nature Communications雜
上海生科院揭示非編碼RNA和轉座子在長壽中的作用機制
3月21日,中國科學院-馬普學會計算生物學伙伴研究所研究員韓敬東在《細胞-報告》(Cell Reports)上在線發表了題為Impact of Dietary Interventions on Noncoding RNA Networks and mRNAs Encoding Chromatin
Cell?Reports報道揭示非編碼RNA和轉座子在長壽中的作用機制
3月21日,中國科學院-馬普學會計算生物學伙伴研究所研究員韓敬東在《細胞-報告》(Cell Reports)上在線發表了題為Impact of Dietary Interventions on Noncoding RNA Networks and mRNAs Encoding Chromatin
研究發現水稻轉座子受馴化選擇和抗病抗逆中的調節功能
6月19日,Molecular Plant 雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所何祖華研究組題為Elimination of a retrotransposon for quenching genome instability in modern rice 的研究
PNAS:利用熒光顯微鏡實時觀測活細胞內的轉座子
美國伊利諾伊大學香檳分校的科學家們實時觀察到了活細胞內的跳躍基因活動。這項研究的長期研究目標是在分子水平上深入了解進化是如何運作的。直接觀察細胞內的基因組如何重組自我,可讓我們精確測定適應率,并可能揭示了一系列重要的進化問題,包括從生命的出現到癌癥的傳播。 生物通報道:美國伊利諾伊大學香檳分校
Nat-Genet:通過表觀遺傳療法激發轉座子新抗原,推進癌癥免疫治療
近年來,免疫療法已在多種癌癥的治療中取得了突破性的進展。這種療法通過利用腫瘤中特異性表達的新抗原(neoantigen),使免疫細胞能夠精準地鎖定并消滅癌細胞【1】。傳統上,人們認為這些新抗原主要源于編碼基因的突變。然而,近年研究表明,基因組中非編碼區域在腫瘤中的異常表達也可能導致新抗原的產生,
我國學者揭示轉座子的遺傳變異可使植物快速適應新生境
在物種形成或物種入侵到新生境時,往往只涉及祖先物種里的少數群體或個體,從而導致形成的新物種或入侵群體的遺傳多樣性下降,即所謂“瓶頸效應”。盡管瓶頸效應使得新物種或入侵群體遺傳多樣性很低,但這些群體仍能夠適應新生境。這種很低的遺傳多樣性和很強的適應能力之間的巨大反差被稱為“生物入侵的遺傳悖論”。對
酵母菌基因組轉座子誘變實驗—?mTn誘變基因產物表位標記
實驗材料mTn誘變酵母菌株試劑、試劑盒pGAL-cre含有2% (W V)棉籽糖的-Leu-Ura Raff CM缺失成分培養基平板和培養基含有2% {m V)半乳糖的-Leu Gal CM缺失成分培養基含有2% (m V)葡萄糖的-Leu Glc CM缺失成分培養基5-FOA培養基平板(5-FOA
Science:新研究揭示轉座子編碼的內含子與向導RNA之間的拮抗沖突
TnpB核酸酶是CRISPR-Cas12的進化前身,廣泛存在于生命的各個領域,這可能是由于它們在轉座子擴增中的關鍵作用。近期的研究已證實IS605 家族的 TnpB 同源物通過利用轉座子編碼的向導RNA——ωRNA,來切割基因組 DNA,因而通過 DNA 雙鏈斷裂刺激的同源重組來驅動轉座子的維持
酵母菌基因組轉座子的誘變實驗—-小載體聚合酶鏈反應
實驗材料誘變轉座子基因組文庫質粒DNA試劑、試劑盒錨定囊泡引物1和2 、1 mol L MgCl2、普通小載體(UV)和mTn引物、轉座子誘變酵母菌株、合適的限制性內切核酸酶(如AZmI或DraI)和緩沖液、10×T4 DNA連接酶緩沖液、5 mmol L ATP、400 U μL T4 DNA連接
概述轉座因子在分子生物學研究中的應用
隨著人們對轉座因子的轉位機制和作用研究的逐步深入,轉座因子的應用也越來越廣泛,其中主要有以下三個方面的應用。 (1)遺傳育種上的應用。一方面,轉座子的轉位會在靶位點引起其鄰近基因序列和功能的變化而引起突變。因此,可根據轉座子轉座的遺傳學效應來篩選突變體,培育新品種。另一方面,某些轉座子可能是調
不需要RNA中間物的復制型轉座
在不需要RNA中間物的復制型轉座過程中,轉座子一般由Y2一轉座酶催化進行滾環復制。使用此途徑進行復制的轉座子有IS91和Helitron,轉座過程一般有兩種機制。一種機制的復制和插入分開進行,具體步驟如下:①轉座酶切開轉座子起點處的一條鏈,酶的Tyr—OH與切口的5‘—磷酸基以酯鍵連接,切口的另一側
不需要RNA中間物的復制型轉座介紹
在不需要RNA中間物的復制型轉座過程中,轉座子一般由Y2一轉座酶催化進行滾環復制。使用此途徑進行復制的轉座子有IS91和Helitron,轉座過程一般有兩種機制。一種機制的復制和插入分開進行,具體步驟如下: ①轉座酶切開轉座子起點處的一條鏈,酶的Tyr—OH與切口的5‘—磷酸基以酯鍵連接,切口
中科院PNAS表觀遺傳研究新進展
近日來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所的研究人員在組蛋白H3K4去甲基化酶研究中取得重要進展,證實水稻中的H3K4特異性去甲基酶JMJ703參與控制了轉座子活性,相關研究論文于1月14日在線發表在《美國科學院院刊》(PNAS)雜志上。 領導這一研究的是中國科學院遺傳發育所基因組生物學研究
研究揭示多倍體小麥亞基因組特異轉座子介導穗發育可塑性
普通小麥(Triticum aestivum,AABBDD)是經過兩次雜交事件形成的異源六倍體,融合了三個二倍體祖先不同的特性,具有強大的可塑性和環境適應能力,成為廣泛種植的主糧作物。從進化角度講,不同基因組的融合提供了豐富的原材料,促進多倍體的演化和表型可塑性,但具體分子機制尚不清楚。小麥亞基
Cell:永不停息的基因戰爭
我們的細胞中進行著激烈的基因戰爭,入侵的外源DNA頻頻試圖破壞人類的基因藍圖。現在,加州大學舊金山分校UCSF的研究人員發現了,細胞保護自身基因抵抗入侵者的新分子機制。 這一機制負責識別和靶標外源DNA,被研究人員稱為SCANR。UCSF的研究人員是在酵母中發現SCANR機制的,由于酵母與