青島農業大學完成紫扇貝基因組測序
近日，青島農業大學海洋科學與工程學院科研團隊日前完成了紫扇貝基因組的測序和分析，這是繼蝦夷扇貝和櫛孔扇貝之后人類完成的第三個扇貝基因組測序。圖片來源于網絡 青島農業大學海洋科學與工程學院教授王春德帶領的科研團隊結合第二代和第三代基因測序方法，對紫扇貝進行了全基因組測序分析，共獲得４６３．１９Ｇ測序數據。科研團隊通過測序并分析發現，紫扇貝共有２６２５６個基因，并含有４０．６３％的重復序列。 科研團隊通過基因組測序還發現，紫扇貝與蝦夷扇貝先聚為一支，再與其他雙殼類聚為一支，然后再與腹足綱物種聚類，同時紫扇貝與蝦夷扇貝的分歧時間為１１３．６百萬年前。 王春德介紹，對紫扇貝基因組的成功測序，為從分子水平解析紫扇貝及其雜交扇貝的生長、抗逆性、育性和壽命等重要性狀的決定機制及分子育種打下了基礎。 扇貝屬于雙殼貝類，作為５億年前就已出現的古老動物類群，雖歷經多次生物大滅絕事件，至今仍昌盛并繁衍不息，其非凡的環境適應能力使之成為研究......閱讀全文
中國蓮基因組測序完成
繼中國科學家成功完成水稻、玉米基因組測序工作后，近日，中國科學院武漢植物園研究人員與國外多家科研機構合作，順利完成中國蓮的基因組測序，構建了首張中國蓮全基因組圖譜，相關論文在線發表于《基因組生物學》雜志。 “該項目為將來的蓮分子育種提供了堅實的基礎，也標志著我國相關研究將對生物進
測序解讀基因組，真的好嗎？
測序解讀基因組，真的好嗎？ “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire，在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說，“尤其是對自己基因組信息的了解。” 雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年，但
盤點最新基因組測序成果
the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者： 種屬：非洲腔棘魚（Latimeria chalumnae） 基因組：~2.86 billion bp 人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕，直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年
基因組測序拯救鸮鸚鵡
為了保護極度瀕危的新西蘭鸮鸚鵡kakapo，幾乎所有剩余個體的基因組都已被測序，這為其保護管理提供了重要信息。 新西蘭鸮鸚鵡kakapo（Strigops habroptila）有幾個特性。它是世界上最重的鸚鵡，有的雄性甚至超過3公斤，被認為有達90年的最長壽命。它是唯一一種不會飛的鸚鵡，通過
我國完成小麥A基因組測序
?? 5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征，對深入和
我國完成小麥A基因組測序
本報訊（記者丁佳）5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和
中國完成海帶等7種海洋生物全基因組測序
中國科學家10月30日在青島首次披露了海帶、櫛孔扇貝和南美白對蝦全基因組測序的部分成果，至此中國已完成7種大型海洋生物的全基因組測序，為改良這些海洋生物品質、提高產量奠定了科學基礎。 中國的海洋生物基因組學研究雖然起步較晚，但現在一些研究成果已達到國際前沿水準。目前，人類完成全基因組測序的
中科紫鑫BIGIS二代測序系統問世－打破國際壟斷
8月7日，中科紫鑫BIGIS二代測序系統推介會在京舉辦，會議邀請到了國家衛生管理部門、臨床醫療機構、科研院所、大專院校、司法鑒定、檢驗檢疫等各領域專家教授，共同見證了國產自主知識產權測序儀BIGIS系統的研發歷程，深入探討了國內測序產業發展現狀，并為國產測序儀的完善與發展提出了寶貴意見。 近年
察基因之微育扇貝良種
11月23日,國際權威期刊《自然》子刊Nature Communications以Article形式,在線發表了中國海洋大學海洋生物遺傳學與育種教育部重點實驗室包振民教授團隊的最新論文——“扇貝基因組揭示其對半附著生活方式和神經毒素耐受的分子適應機制”。 包振民教授課題組與北京諾禾致
扇貝肌肉品質研究獲進展
日前，中國水產科學研究院黃海水產研究所貝類遺傳資源與育種研究團隊在《基因組學》（Genomics）在線發表研究論文。該研究通過對蝦夷扇貝閉殼肌主要細胞類群的分類鑒定，繪制了神經、肌肉和血淋巴等細胞類群的分化軌跡，揭示了間充質干細胞參與多樣化的基因轉錄調控，不僅為貝類細胞類型、干細胞維護及細胞分化
最新基因組測序成果盤點
近來，各大雜志上陸續發表了不少重要的基因組測序成果。the scientist雜志對此進行了盤點，以饗讀者。 種屬：野鴨，綠頭鴨(Anas platyrhynchos) 基因組：約13 billion bp 鴨子是幾乎所有甲型流感病毒的天然宿主(包括H5N1)。日前，研究人員測
Nature發布基因組測序重要發現
由科隆大學Roman Thomas領導的一個國際研究小組，對110個小細胞肺癌（SCLC）樣本進行了測序，發現除了兩個樣本其余所有的均包含失活的TP53和RB1基因。通過調查這一疾病的基因組景觀，他們還發現有不少的腫瘤具有與TP73基因相關的基因組重排或突變，以及激酶基因突變和Notch家族基因
基因組測序竟能準確預測長相！
克萊格·文特爾（Craig Venter）博士是一名不折不扣的“科學狂人”。幾十年前，他創立的Celera Genomics曾以一家公司之力，加快了“人類基因組計劃”的發展。他本人也于2000年和美國NIH負責人弗朗西斯·柯林斯（ Francis Collins）博士一道，共同宣布了人類基因組草
基因組測序揭示家鴿起源史
2月1日，由美國猶他大學、深圳華大基因研究院等單位合作完成的鴿子基因組研究成果在《科學》雜志在線發表。該研究從分子層面揭示了家鴿的起源歷史，并發現了鴿子羽冠多樣性的遺傳基礎。 據悉，鴿子是目前為數不多的已完成測序的鳥類之一，其基因組與家雞、火雞、斑馬雀及虎皮鸚鵡的基因組一起，將為鳥類的群體
GenomeBiology發布基因組測序重要成果
Genome Biology雜志發布了遠東豹（Far Eastern Amur leopard）的首個全基因組序列，為人們揭示了肉食對基因多樣性和種群規模的影響。“我們將遠東豹基因組與其它哺乳動物基因組進行比較，發現肉食似乎是很強的選擇壓力。這種現象在雜食動物和食草動物中并不明顯。舉例來說，牛吃肉對
全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查檢測來解
小麥野生遠祖基因組測序完成
11月15日出版的《自然》雜志刊登了一篇研究論文稱，美國加州大學戴維斯分校科學家領導的國際團隊，成功為小麥的一種野生遠祖——節節麥（Aegilops tauschii）進行了基因組測序，向破解小麥基因組難題邁進了一步。 作為全球主要糧食作物，小麥為人類提供了超過20%碳水化合物和23%蛋白質等
PNAS：基因組測序的驚人發現
科學家們發現，水母（平凡的海洋生物）經過漫長的進化變成了生活在其它動物體內的奇特寄生蟲。這項研究發表在本周的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。 Myxozoa是感染無脊椎動物和脊椎動物宿主的微小寄生蟲，由少數幾個細胞組成。美國堪薩斯大學的研究人員對這種生物進行了基因組測序，發現它們實際上是高度
Cell公布最新基因組測序結果
去年夏天西非埃博拉爆發的早期階段，科學家們以空前的規模和速度測序了這種致命病毒的基因組，為人們揭示了許多疫情蔓延的關鍵信息，比如說病毒只通過人與人接觸傳播，病毒在多次傳播中獲得了許多新突變等等。 雖然埃博拉爆發最糟糕的時期已經過去，但這場疫情并未結束，還有許多問題需要人們去解答。為此，哈佛大學
基因組測序揭示家鴿起源史
2月1日，由美國猶他大學、深圳華大基因研究院等單位合作完成的鴿子基因組研究成果在《科學》雜志在線發表。該研究從分子層面揭示了家鴿的起源歷史，并發現了鴿子羽冠多樣性的遺傳基礎。 據悉，鴿子是目前為數不多的已完成測序的鳥類之一，其基因組與家雞、火雞、斑馬雀及虎皮鸚鵡的基因組一起，
基因組測序助力腫瘤精密治療
最近，約翰霍普金斯大學Kimmel癌癥中心的科學家，在對101例胰腺癌患者的血液和腫瘤進行基因組測序后發現，至少三分之一患者的腫瘤有基因突變，這些突變有朝一日可能幫助指導疾病的精密治療。他們說，與標準的影像學檢查方法相比，血液檢測的結果，可以早半年預測到癌癥的復發。 約翰斯霍普金斯大學醫學院腫
讓基因組測序繞過PCR擴增
在基因組測序中，PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而，PCR也帶來一些問題，包括不均勻擴增，導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序（NGS）平臺而言，測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR
美洲大蠊基因組測序完成
中科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所詹帥及同事對美洲大蠊進行了基因組測序和分析，表明在已測基因組的昆蟲中，其基因組規模僅次于蝗蟲。這項研究3月21日在線發表于《自然—通訊》，文章揭示了該物種成功適應城市環境的遺傳學基礎的相關洞察。 美洲大蠊（Periplaneta americana
Nature發布基因組測序驚人發現
來自沖繩科學技術研究院大學(OIST)的一支研究團隊與合作者們，完成了對兩個稱作為柱頭蟲(acorn worm)的小水生生物物種的測序，顯示相比于許多其他動物，我們與柱頭蟲共享了更多的基因，確立了它們是我們的遠親。研究結果發布在《自然》（Nature）雜志上。 研究發現，所有后口動物（deut
盤點基因組測序的最新成果
近日，the scientist雜志發表文章盤點了最近發布的幾項基因組測序成果，一起來看看吧。 昏睡病傳播者 種屬：采采蠅(Glossina morsitans morsitans) 基因組：360 million bp 國際舌蠅基因組計劃(International G
Science公布最新基因組測序結果
來自法國農業科學研究院（Institut National de Recherche Agronomique）的研究人員發表了題為“Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome”
基因組高通量測序的原理
測序方案建立在雙脫氧測序法(Sanger等，1977)的基礎上。為了從每一克隆插入片段兩端成對地進行測序，每一個質粒模板DNA板應配備兩個384孔循環測序反應板。測序反應采用Big Dye Terminator chemistry version 3．1(AppliedBiosystems)和標準M
全基因組測序各步驟工具
全基因組測序（WGS）是下一代測序技術，用于快速，低成本地確定生物體的完整基因組序列。基因組的深度測序對于臨床研究的意義重大，解讀WGS數據并了解基因組突變在健康和疾病中的重要性是精準醫療的基石。WGS分析流程能分為三大塊，數據處理、檢測變異和綜合分析，具體如下圖所示：由于WGS現在已經非常成熟了，
簡述單分子測序技術—第三代測序技術的基因組測序應用
由于具有讀長長的特點，SMRT測序平臺在基因組測序中能降低測序后的Contig數量，明顯減少后續的基因組拼接和注釋的工作量，節省大量的時間[25]。Christophern等[26]僅僅用0.5*的Pacbio RS系統長度的數據與38*的二代測序(NGS)的測序數據，對馬達加斯加的一種指猴基因
人類基因組測序先驅欲進軍生物醫療測序領域
J. Craig Venter(中)希望通過利用基因組學實現對抗衰老的目標 美國人類基因組測序先驅J. Craig Venter將和其新創立的公司Human Longevity Inc.(HLI)進軍生物醫療測序領域。HLI是“基因組學和細胞的診斷與治療公司”，計劃于今年夏季啟動，終極目標