青島農業大學完成紫扇貝基因組測序
近日，青島農業大學海洋科學與工程學院科研團隊日前完成了紫扇貝基因組的測序和分析，這是繼蝦夷扇貝和櫛孔扇貝之后人類完成的第三個扇貝基因組測序。圖片來源于網絡 青島農業大學海洋科學與工程學院教授王春德帶領的科研團隊結合第二代和第三代基因測序方法，對紫扇貝進行了全基因組測序分析，共獲得４６３．１９Ｇ測序數據。科研團隊通過測序并分析發現，紫扇貝共有２６２５６個基因，并含有４０．６３％的重復序列。 科研團隊通過基因組測序還發現，紫扇貝與蝦夷扇貝先聚為一支，再與其他雙殼類聚為一支，然后再與腹足綱物種聚類，同時紫扇貝與蝦夷扇貝的分歧時間為１１３．６百萬年前。 王春德介紹，對紫扇貝基因組的成功測序，為從分子水平解析紫扇貝及其雜交扇貝的生長、抗逆性、育性和壽命等重要性狀的決定機制及分子育種打下了基礎。 扇貝屬于雙殼貝類，作為５億年前就已出現的古老動物類群，雖歷經多次生物大滅絕事件，至今仍昌盛并繁衍不息，其非凡的環境適應能力使之成為研究......閱讀全文
青島農業大學完成紫扇貝基因組測序
近日，青島農業大學海洋科學與工程學院科研團隊日前完成了紫扇貝基因組的測序和分析，這是繼蝦夷扇貝和櫛孔扇貝之后人類完成的第三個扇貝基因組測序。圖片來源于網絡 青島農業大學海洋科學與工程學院教授王春德帶領的科研團隊結合第二代和第三代基因測序方法，對紫扇貝進行了全基因組測序分析，共獲得４６３．１９Ｇ
研究揭示海灣扇貝兩個亞種基因組測序和組裝
日前，青島農業大學在扇貝育種研究方面再次取得重要進展，海洋科學與工程學院教授王春德課題組與合作單位成功完成海灣扇貝北部亞種和南部亞種基因組測序和分析，相關研究成果在線發表于《自然》旗下開源期刊Scientific Data。 此前，王春德課題組已完成紫扇貝基因組測序和組裝，紫扇貝和海灣扇貝兩個
青島農大等完成海灣扇貝兩個亞種基因組測序
日前，青島農業大學在扇貝育種研究方面再次取得重要進展，海洋科學與工程學院教授王春德課題組與合作單位成功完成海灣扇貝北部亞種和南部亞種基因組測序和分析，相關研究成果在線發表于《自然》旗下開源期刊Scientific Data。 此前，王春德課題組已完成紫扇貝基因組測序和組裝，紫扇貝和海灣扇貝兩個
青島農大等團隊完成海灣扇貝兩個亞種基因組測序和組裝
日前，青島農業大學在扇貝育種研究方面再次取得重要進展，海洋科學與工程學院教授王春德課題組與合作單位成功完成海灣扇貝北部亞種和南部亞種基因組測序和分析，相關研究成果在線發表于《自然》旗下開源期刊Scientific Data。 此前，王春德課題組已完成紫扇貝基因組測序和組裝，紫扇貝和海灣扇貝兩個
紫鑫藥業與北京基因組所聯手進軍測序儀市場
10月29日上午，在青島召開的國際基因組學大會開幕現場，作為大會主辦方的吉林紫鑫藥業股份有限公司和中國科學院北京基因組研究所，就合作開發第二代高通量測序系統項目正式簽訂了投資意向協議，標志著此前由中科院自主研發的第二代測序儀項目即將進入市場轉化和產業化階段。 基因測序技術，自人類基因組計劃
煙臺海岸帶所探索貝類壽命的遺傳“密碼”
近日，中科院煙臺海岸帶研究所研究員王春德團隊利用生物信息學和分子生物學技術開展系統研究，首次揭示了胰島素/IGF-1信號（IIS）通路核心基因的遺傳變異對紫扇貝和海灣扇貝的壽命發揮了重要作用。相關研究成果分別發表于《水產養殖》與《生理學前沿》。 紫扇貝和海灣扇貝同為Argopecten屬扇貝，但
我國科學家完成扇貝基因組精細圖譜繪制
日前，中國海洋大學教授包振民團隊完成了扇貝基因組精細圖譜繪制，探究原始動物祖先染色體核型進化、軀體結構多樣性產生、眼睛起源及其調控機制等，在動物宏觀進化研究領域取得重要進展。相關成果日前發布于《自然.生態學與進化》。 動物界99%的物種隸屬于雙側對稱動物，進化學家推測這些雙側對稱動物可能起
中科院煙臺海岸帶所貝類壽命研究獲進展
FoxO和PTEN參與衰老和壽命調控的IIS通路 課題組供圖 抗衰老機制一直是生命科學前沿熱點問題，這個問題在人類和陸生模式生物中已進行了較為深入廣泛的研究，但是鮮有關于海洋無脊椎動物壽命決定機制的研究報道。 中國科學院煙臺海岸帶研究所研究員王春德團隊利用生物信息學和分子生物學技術開展系統研究，
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
長牡蠣和櫛孔扇貝全基因組框架圖繪制完成
日前，長牡蠣和櫛孔扇貝全基因組框架圖繪制完成，并篩查得到與重要性狀相關的基因或信號通路，在國際上填補了冠輪動物基因組學研究空白。 這是在國家863計劃支持下，由中國海洋大學、中國科學院海洋研究所、中國水產科學研究院黃海水產研究所、中國科學院南海海洋研究所、威海長青海洋科技股份有限公司、大連獐子
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
PNAS：甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值，日前西班牙的九個研究中心通力合作，利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組，科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組，文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器，于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫，從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道，以節約試劑用量。
關于全基因組測序的測序指標介紹
一、全基因組測序的測序指標— 深度 測序深度（Sequencing depth）是指測序得到的堿基總量（bp）與基因組大小的比值，它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系，測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體，如果采用的是雙末端或Ma
紫鑫藥業:基因測序儀量產基地已落戶北京
紫鑫藥業(14.590, -0.11, -0.75%)（002118）周五在全景網互動平臺上表示，公司用于批量生產基因測序儀的基地已落戶北京，目前已處于籌劃批量生產階段。 紫鑫藥業主營業務為加工銷售中成藥，化學藥制劑，藥材原料，針織品加工，種養殖業；設計、制作，代理電視
雜交扇貝技術引領產業中興
雄性不育且雌性可育個體的發現為海灣扇貝育種提供了珍貴材料，其可用于構建動物育種中的首個雜交扇貝不育系三系配套育種方法，是動物育種技術的重大突破，不亞于植物界推動雜交水稻育種革命的雄性不育株。 從秘魯空運回紫扇貝，找到實現雌雄同體扇貝雜交的“訣竅”，發現雜交扇貝雄性不育的材料，利用雜交后代進行種
青島農大扇貝育種技術獲4項美國發明ZL授權
近日，青島農業大學教授王春德團隊申請的“紫扇貝與海灣扇貝三系雜交育種體系及應用”等4項發明ZL獲得美國ZL與商標局授權，實現了對紫扇貝與海灣扇貝雜交育種和制種技術的國際保護。 這些發明ZL是王春德團隊在開展紫扇貝與海灣扇貝雜交育種和制種過程中形成的。據介紹，為改良海灣扇貝種質，該團隊自200
454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目
一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代，其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1，科學家通過454全基因組測序，掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因，包括抗病能力、牛奶產量，這些性狀已通過北美的當
扇貝發育演化研究獲進展
《自然》（Nature）子刊《自然-生態學與進化》（Nature Ecology & Evolution）日前以Article形式在線發表了中國科學院海洋研究所劉保忠課題組參與完成的研究論文"Scallop genome provides insights into evolution of b
我國完成小麥A基因組測序
本報訊（記者丁佳）5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和
我國完成小麥A基因組測序
?? 5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征，對深入和
什么是基因組測序技術
自1998年美國塞萊拉遺傳公司組建以來，人類基因組研究開始由兩部分科學家同時展開，分別是由公共經費支持的人類基因組工程和美國塞萊拉遺傳公司。在研究過程中，他們也分別采用了兩種不同的測序和分析的方法。塞萊拉公司的核心分析方法被稱為"霰彈法"，人類基因組工程則采用了"克隆法"。所謂"霰彈法"，其實是一種
盤點最新基因組測序成果
the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者： 種屬：非洲腔棘魚（Latimeria chalumnae） 基因組：~2.86 billion bp 人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕，直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年
基因組測序的具體過程
講起來很復雜哈，簡單來說，就是邊合成邊測序，把所要測序的序列通過各種手段來建庫，然后加上5‘和3’都加上接頭，放在一個小玻璃片一樣的芯片上，上面一般是8個lane，把樣品加入到lane上之后和上面長好的接頭序列相結合（之前的建庫時加的接頭與之反向互補），然后再經過PCR擴增的過程形成一個DNA簇，然
簡化基因組測序好做嗎
簡化基因組方法是一種利用酶切技術、序列捕獲芯片技術或其他實驗手段降低物種基因組復雜程度，進而研究基因組各類遺傳結構性變異的技術手段。目前常見的簡化基因組技術包括RAD（Restriction site Associated DNA）和GBS（Genotyping By Sequencing）。這些技
白肉靈芝完成基因組測序
?在韶關產業園種植的白肉靈芝。吳清平團隊 供圖 近日，中國工程院院士、廣東省科學院微生物研究所名譽所長吳清平團隊完成了第一個白肉靈芝全基因組測序。據悉，這是世界上首次對白肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關研究發表于《G3：基因，基因組，遺傳學》（G3-Genes Genomes Genet
人類全基因組測序計劃
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年， Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列，對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部（DOE）與美國國家衛生研究院（NIH），分別在1986年與1987年加入人類基
中國蓮基因組測序完成
繼中國科學家成功完成水稻、玉米基因組測序工作后，近日，中國科學院武漢植物園研究人員與國外多家科研機構合作，順利完成中國蓮的基因組測序，構建了首張中國蓮全基因組圖譜，相關論文在線發表于《基因組生物學》雜志。 “該項目為將來的蓮分子育種提供了堅實的基礎，也標志著我國相關研究將對生物進
讓基因組測序繞過PCR
?在基因組測序中，PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而，PCR也帶來一些問題，包括不均勻擴增，導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序（NGS）平臺而言，測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR-