單細胞測序揭示肺癌腫瘤免疫細胞亞型的細胞圖譜
最近免疫療法的出現標志著多種癌癥的研究和護理發生了巨大變化，給世界各地的患者和家庭帶來了新的希望。對于那些對治療有反應的人來說，結果可能是激動人心的。激活病人的癌癥免疫系統可以殺死或縮小腫瘤，在某些情況下，會導致完全緩解。 盡管取得了重大進展，但只有少數人從免疫治療中獲益，原因尚不清楚。 免疫治療研究主要集中在T細胞上，T細胞是一種學習識別特定蛋白并發動攻擊的免疫細胞。然而，腫瘤是多種不同細胞類型的復雜混合物，包括其他免疫細胞，這些免疫細胞統稱為腫瘤浸潤性髓細胞。這些細胞是免疫治療的替代靶點，但它們在腫瘤中的作用仍不清楚。 為了對這些免疫細胞家族進行了深入研究，哈佛醫學院的研究人員在布拉瓦尼克研究所、馬薩諸塞州總醫院、貝絲以色列女執事醫療中心、布里格姆婦女醫院等地使用單細胞測序來繪制肺癌患者腫瘤中骨髓細胞的細胞譜系。 該研究發表在Immunity雜志上，揭示了25個骨髓細胞亞群，許多以前未被描述過，具有不同的基因表達......閱讀全文
Fluidigm推出單細胞TCR測序產品
解析細胞表型是免疫學中一個共同的單細胞分析目標。然而，T細胞受體V(D)J基因區域的隨機重排帶來了T細胞群體的復雜變化。這形成了龐大的T細胞部隊，以便識別特定的外源蛋白，引發有效的免疫反應。 為了在單細胞水平實現深度的T細胞分析，Fluidigm近日在C1?系統上推出了一個全新的免疫學應用 –
！單細胞測序的”CPU－2.0”時代
對單個人類細胞的基因組進行準確的變異檢測和大范圍單倍體型分析一直以來都是測序領域的巔峰挑戰。單細胞測序使我們能在更高的分辨率下研究生命的機制。一方面，在像癌癥這樣的組織樣本中存在大量具有不同基因組類型的單個細胞,因此需要分析單細胞水平基因組而不是大量細胞的平均值；另一方面，對于非常珍貴的細胞樣品
漫談單細胞測序及其臨床應用
一、概述隨著現代生物學的發展，細胞群體的研究已不再能滿足科研需求。單細胞測序解決了用組織樣本測序或樣本少時無法解決的細胞異質性難題，為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向。單細胞測序正在成為科研熱點。二、單細胞測序倍受青睞的原因人們最初以為一個細胞類群是均質的（即各細胞都是
靶向深度測序和單細胞基因測序的區別
1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序，有效降低了測序成本，提高了測序深度，能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序
靶向深度測序和單細胞基因測序的區別
1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序，有效降低了測序成本，提高了測序深度，能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序
單細胞分離儀在單細胞測序領域有著很大的幫助
???單細胞分離儀可以實現從微孔芯片轉移單細胞到細胞收集管中。單細胞轉移分離系統集單細胞成像，單細胞隔離，單細胞選擇功能于一體，自動聚焦成像。? ? 轉移單細胞到微管，PCR微孔板或其它反應微管中，在隔離單細胞后，它可以對選定收集的細胞進行掃描并成像，采用倒置熒光顯微鏡，配備自動掃描顯微鏡載物臺，自
PNAS：單細胞測序繪制大腦的細胞圖譜
斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其同事本周在《美國科學院院刊》（PNAS）上發表文章，介紹了人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果。 研究小組對近500個成人或胎兒腦細胞進行了單細胞RNA測序。利用這種方法，他們能夠鑒定出大腦中所有主要的細胞類型，并確定神經元的亞型。他們還觀察了
基于單細胞RNA測序繪制人類大腦高分辨率免疫細胞圖譜
近日，在德國弗賴堡大學醫學中心科學家的指導下，一個聯合研究團隊利用單細胞RNA測序技術繪制了首個人類大腦高分辨率免疫細胞圖譜！有史以來第一次證明大腦中的小膠質細胞（即吞噬細胞）具有相同的核心特征，并會根據大腦功能需求進行適應性表達，揭示了小膠質細胞的時間和空間異質性。2月14日，相關研究成果發表
Cancer－Cell：單細胞測序確定膠質母細胞瘤免疫治療新靶點
Cancer Cell 期刊發表了題為：Integrative analysis of neuroblastoma by single-cell RNA sequencing identifies the NECTIN2-TIGIT axis as a target for immunother
單細胞測序技術“遍地開花”，精準醫療“如虎添翼”！
作者：Carrie? 單細胞測序技術 基因測序在體外診斷市場中的重要性日益突出。其中，單細胞測序技術自2009年問世，2013年被Nature Methods評為年度技術以來，越來越多地被應用在科研領域。2015年以來，10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-
Science：單細胞分析？并行測序技術可以
近日，一項發表于國際雜志Science上的研究論文中，來自美國的研究者描述了一種新型的大規模并行技術，通過利用新一代測序技術來在單細胞水平上實現對基因表達的監測；研究者表示，單細胞分析對于理解人類造血系統的必要性及重要性不斷凸顯，如果沒有這種分析的話，來自少許細胞的大量表達改變就和來自許多細胞的
《自然—方法學》年度方法：單細胞測序
2014年1月《自然—方法學》(Nature Methods)上發表年度特別報道，將“單細胞測序”(Singled out for sequencing)的應用列為2013年度最重要的方法學進展。 近幾年來，基于單細胞測序技術的科學研究取得了突飛猛進的發展，其成果有望為一些重
Nature－methods發布單細胞測序新技術
來自瑞典Ludwig癌癥研究所及Karolinska研究所的研究人員，在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)雜志上報告了一項獲得重大改良的新技術，可以利用它來分析單細胞中的基因表達——這一性能與從基礎研究到未來癌癥診斷的一切事物均存在關聯。 資深作者Ri
Nature新技術：CRISPR+單細胞測序=？
CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因組編輯技術是生物研究和新型靶向藥物研發的有力工具。比如利用CRISPR篩選基因（pooled CRISPR screens），可以通過CRISPR gRNAs靶向成百上千個不同的基因，同時編輯許多細胞，然后實驗篩選編輯細胞，gRNA可以幫助確定哪些基因對于生物
通過單細胞測序解析體細胞重編程路徑
隨著單細胞技術日新月異的發展和應用，準確有效地解讀數據提供的信息尤為重要。這項研究提供了利用單細胞測序數據研究細胞命運動態變化的新方法，通過發現細胞命運分支的產生，找到影響分支產生的原因，更好的實現對生理或病理條件下細胞命運變化理解，實現控制細胞命運變化的目標。 體細胞重編程是研究細胞命運轉
單細胞測序繪制首個人胚胎造血和免疫系統發育圖譜
2019年10月10日，來自英國Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等機構的科學家在Nature上以長文形式發表了題為“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究，首次報道了由胎肝驅動的人胚胎
單細胞測序繪制首個人胚胎造血和免疫系統發育圖譜
2019年10月10日，來自英國Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等機構的科學家在Nature上以長文形式發表了題為“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究，首次報道了由胎肝驅動的人胚胎
默沙東腫瘤免疫療法批準－一線治療非小細胞肺癌（NSCLC）
英國國家衛生與臨床優化研究所（NICE）近日發布最終治療指南，批準默沙東（Merck & Co）PD-1腫瘤免疫療法Keytruda（pembrolizumab）用于英國國家服務系統（NHS），用于既往未接受治療（初治）的PD-L1陽性轉移性非小細胞肺癌（NSCLC）成人患者的一線治療。 用藥
首個肺癌全息細胞圖譜問世
肺癌是發病率和死亡率增長最快、對人群健康和生命威脅最大的惡性腫瘤之一。近年來，肺癌患者有更加年輕化的趨勢，治愈較為困難。雖然目前科學家在肺癌治療方面已取得了巨大進展，但對其細胞層面上的科學認識仍難盡如人意。近日，著名學術期刊《自然—醫學》推出史上最完整的肺癌細胞圖譜，這將是科學家們在細胞層面深入
《Immunity》封面文章：腫瘤細胞與免疫細胞的相互作用
猶他大學Huntsman癌癥研究所（HCI）在《Immunity》發表的一篇文章對不同類型肺腫瘤微環境提出了新的見解，并描述了這些復雜的細胞生態系統如何影響治療反應。 猶他大學Huntsman癌癥研究所（HCI）在《Immunity》發表的一篇文章對不同類型肺腫瘤微環境提出了新的見解，并描述了這些
北大生科院PNAS發布單細胞測序新技術
來自北京大學生命科學學院等處的研究人員發表了題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章，開發出了一種新型微流控單細胞全轉錄測序新方法，這種方法有效地消除轉錄組高度動態特性所帶來的測量差異，提高單細胞全轉錄組分析的準
Nature子刊：癌癥單細胞測序新技術
只有通過近距離觀看修拉(Seurat)的繪畫，你才能鑒別出點描法背后的復雜性。其在模式中應用了不同的純色小點，從遠處看就形成了一幅圖像。與之相似，生物學家們和遺傳學長期以來也在尋求在單細胞水平上分析基因的圖譜，然而技術局限性使得直到現在也只能在遠處遙望。 發布在7月22日《自然生物技術》(
單細胞研究指南：測序方法大比拼
??多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過，近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們，每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定組合的機制，即使是同類型細胞，基因表達也會出現差異。??那么，細胞之間的哪些差異有生物學意義，哪些差異來自于技術偏好呢？要獲得可靠的結果又需要研究多少細胞呢？這
單細胞測序預測化療的有效性
在近一項研究中，來自密歇根大學的Jun Hee Lee博士課題組使用一種單細胞RNA測序的技術，*展示了單個癌細胞群中的各個細胞對化學療法引起的DNA損傷的基因表達差異。他們發現，這些反應可以被分為三類：激控制細胞死亡，細胞分裂或應激反應。相關結果發表在近的《Cell Reports》雜志上。“不同
計算小RNA分子的單細胞測序新法
最近，卡羅林斯卡學院的研究人員開發出了一種單細胞程序，測量了單個胚胎干細胞中短的非編碼RNA序列的絕對數量。這種新方法可以加深我們對于“基因是如何被調節、不同的細胞類型如何發展”的理解。相關研究結果發表在10月31日的《Nature Biotechnology》。當我們基因中的信息被使用時――例如構
單細胞測序有望揭示胃癌異質性
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514613.shtm
同濟大學發布單細胞測序新技術
單細胞轉錄組和甲基化組分析已經成為了單細胞研究的強大工具。然而，在單細胞中揭示DNA甲基化與基因表達的直接關聯還比較困難。這是因為細胞之間存在較大的差異，又不能同時檢測一個細胞的轉錄組和甲基化組。 加州大學范國平教授和同濟大學薛志剛教授領導團隊解決了這個問題。他們在五月五日的Geno
北大生科院PNAS發布單細胞測序新技術
來自北京大學生命科學學院等處的研究人員發表了題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章，開發出了一種新型微流控單細胞全轉錄測序新方法，這種方法有效地消除轉錄組高度動態特性所帶來的測量差異，提高單細胞全轉錄組分析的準
當宏基因組遇上單細胞測序
日前，科學家們通過宏基因組測序和單細胞測序鑒定了一類新細菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性，使其成為了微生物檢測和分類鑒定的強有力工具。這種方法為科學家們揭示了微生物群體的高度復雜性，但它還是有所遺漏。美國能源部聯合基因組研究所上周的一次會議上，研究者人員向人們展示了在四個溫泉樣本
單細胞多組學高通量測序平臺（一）
一單細胞多組學高通量測序技術簡介通過測序手段檢測細胞多層次信息，如基因組、表觀組、轉錄組甚至蛋白組已經成為生物學研究的重要手段。幾乎一切生命體的活動都圍繞著DNA->RNA->蛋白質的過程，而現有的組學技術也圍繞這一過程獲取信息（如DNA層面的基因序列），從而解讀生物體運行機制，應用于疾病的診斷和治