北大生科院PNAS發布單細胞測序新技術
來自北京大學生命科學學院等處的研究人員發表了題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章，開發出了一種新型微流控單細胞全轉錄測序新方法，這種方法有效地消除轉錄組高度動態特性所帶來的測量差異，提高單細胞全轉錄組分析的準確性和可靠性。 這一研究成果公布在《美國國家科學院院刊》（PNAS）雜志上，文章的通訊作者分別是北京大學生物動態光學成像中心的趙亮博士，黃巖誼教授和湯富酬 教授。生物動態光學成像中心（Biodynamic Optical Imaging Center, BIOPIC）是北京大學于2010年成立的一個跨學科合作實體研究中心。中心的目標是發展和利用最先進的生物成像與基因測序手段，在分子和細胞水平上進 行生命科學與醫學基礎研究。該中心聚集了多位知名的科學家，如謝曉亮，莊小威等。 近年來不斷發展的實驗技術，提供了更加定量與客觀的證據，表明......閱讀全文
單細胞轉錄組制備儀的技術指標
將 C1 應用于單細胞 mRNA 測序，可以從多個細胞個 體平行處理多達 96 個 cDNA 文庫，在任何 Illumina 測序儀上對 mRNA表達進行相對定量。此系統的主要特征包括： 高通量 ?-可對 96 個單細胞進行大規模平行、連貫的制備， 引入條形碼序列標記（Barcode），可將測序
科學家開發單細胞全轉錄組測序新技術
北京大學生物動態光學成像中心黃巖誼、湯富酬課題組在《美國科學院院刊》（PNAS）上發表題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的論文。該研究利用微流控芯片技術實現了高質量單細胞的全轉錄組測序樣品準備，全面提高了單細胞全
單細胞轉錄組制備儀的功能
fluidigm C1 單細胞自動制備儀用于 mRNA 測序 更完整的流程 ?-首尾相連的流程對單細胞進行全轉錄組分析 最高的通量 ?-每次運行可前所未有的平行處理 96 個單細胞 更容易的操作 ?-直接從單細胞開始，簡化的樣本制備，只需 3 小時手工操作時間，沒有 片段化和純化步驟 更節省的成
回顧：單細胞轉錄組技術發展之十年歷程
俗話說，十年是個風水嶺，單細胞轉錄組技術發展至今十年間，在促進對生物學和疾病的認識上發揮出的巨大潛力有目共睹。那么，十年間單細胞轉錄組是如何發展至今的？又取得了哪些新的進展呢？今天，讓我們跟隨Sarah Aldridge和Sarah Teichmann兩位大神，一起來回顧單細胞轉錄組學技術十年發
空間轉錄組和單細胞轉錄組測序聯合應用的典型案例
單細胞轉錄組測序技術的如火如荼，伴隨著空間轉錄組測序技術的蓬勃發展，可以看到，在現有的高通量檢測技術領域，這兩種技術已為科學研究的發展提供了前所未有的技術支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術進展，到2020年空間轉錄組技術也被評為年度技術進展，相信在接
家蠶絲腺單細胞轉錄組圖譜繪成
中新網重慶6月15日電 (記者 鐘旖)記者15日從家蠶基因組生物學國家重點實驗室(西南大學)獲悉，我國家蠶研究又有新進展。該實驗室徐漢福教授課題組近日在國際知名期刊Nature Communications《自然通訊》上發表相關主題研究論文，以單細胞分辨率揭示了家蠶絲腺的全細胞異質性及其基因轉
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞轉錄組重要研究文獻匯總（二）
4.單細胞轉錄組測序在植物領域嶄露頭角相比動物的單細胞研究，由于植物具有細胞壁的特點，使得植物的單細胞研究相比較難，但是繼2月份的擬南芥根組織單細胞轉錄組學研究[8]，本月在《Developmental Cell》上又發表了一篇基于擬南芥根組織的單細胞轉錄組學研究報道[9]。來自德國圖賓根大學植
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞轉錄組重要研究文獻匯總（一）
1.單細胞測序用于生殖領域研究持續火熱精子生成過程是一個復雜又具有嚴格分化過程的生理過程，繼18年10月份《Cell Research》上的成年人睪丸轉錄組圖譜研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生與成年人睪丸細胞單細胞水平鑒定分類[2]的步伐，本月在《Nature
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
突破性單細胞表觀基因組與轉錄組分析新技術
由英國及比利時的研究人員開發出的一種新方法，使得在單細胞中同時研究表觀基因組及轉錄組成為可能。發布在《自然方法》（Nature Methods）上的實驗方案，可幫助科學家們精確描繪出DNA甲基化改變與基因表達之間的關系。 近年來單細胞測序技術發展迅速，被廣泛用于研究細胞間的基因表達譜（轉錄組）
單細胞測序新技術：同時分析轉錄組和甲基化組
單細胞轉錄組和甲基化組分析已經成為了單細胞研究的強大工具。然而，在單細胞中揭示DNA甲基化與基因表達的直接關聯還比較困難。這是因為細胞之間存在較大的差異，又不能同時檢測一個細胞的轉錄組和甲基化組。加州大學范國平教授和同濟大學薛志剛教授領導團隊解決了這個問題。他們在Genome Biology雜志上發
單細胞測序新技術：同時分析單個細胞的轉錄組和甲基...
單細胞測序新技術：同時分析單個細胞的轉錄組和甲基化組 單細胞轉錄組和甲基化組分析已經成為了單細胞研究的強大工具。然而，由于細胞之間存在較大的差異，又不能同時檢測一個細胞的轉錄組和甲基化組，在單細胞中揭示DNA甲基化與基因表達的直接關聯還比較困難。 近日，加州大學范國平教授和同濟大學薛志剛教授
華大基因再出手－單細胞轉錄組學測序技術的系統分析
單細胞轉錄組測序(Single-cell RNA-seq)是在單細胞水平對轉錄組（mRNA）進行測序的一項新技術，可發現細胞群體中真正起作用的細胞，特別適合對高度異質性的干細胞、腫瘤細胞及胚胎發育早期的細胞群體進行研究，認識細胞分子機制和基因調控網絡。單細胞RNA-seq技術需要在測序前制備文庫
單細胞核RNA測序技術建立了種子早期胚乳發育的轉錄圖譜
種子是裸子植物和被子植物特有的繁殖體，是胚珠經過受精以后形成的結構，在植物生命周期中處于關鍵位置。種子主要由種皮、胚和胚乳組成。其中胚乳是大多數開花植物雙受精后產生的組織，一般為三倍體（每個細胞核有三套染色體），胚乳中含有豐富的營養物質，是人類消耗熱量的主要來源。 基因組印跡是一種表觀遺傳基因
3月單細胞轉錄組重要研究文獻匯總
1.單細胞測序用于生殖領域研究持續火熱 精子生成過程是一個復雜又具有嚴格分化過程的生理過程，繼18年10月份《Cell Research》上的成年人睪丸轉錄組圖譜研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生與成年人睪丸細胞單細胞水平鑒定分類[2]的步伐，本月在《Nature
高通量單細胞轉錄組測序發展與展望
單細胞轉錄組測序技術這幾年的發展之快，運用之廣已眾所周知。為更好的在國內推廣該技術，也為更好的將該技術運用到廣大科研工作者的實際工作中，上海生物芯片有限公司生物信息團隊通過對該技術的整理和歸納，在《生命科學》雜志上發表了名為“高通量單細胞轉錄組測序發展與展望”綜述文章，希望能進一步提升科研工作者對該
玉米單細胞轉錄組測序，11種細胞類型
近日，廣東省科學院南繁種業研究所生物育種研究室在玉米單細胞轉錄組測序研究方面取得新進展。相關研究在線發表于《作物學報》（The Crop Journal）。廣東省科學院南繁種業研究所李旭輝博士為該論文第一作者，齊永文研究員為通訊作者。玉米是全球重要的糧食和能源作物，而其產量形成的基礎依賴其特殊的根系
3月單細胞轉錄組重要研究文獻匯總
1.單細胞測序用于生殖領域研究持續火熱 精子生成過程是一個復雜又具有嚴格分化過程的生理過程，繼18年10月份《Cell Research》上的成年人睪丸轉錄組圖譜研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生與成年人睪丸細胞單細胞水平鑒定分類[2]的步伐，本月在《Nature
單細胞轉錄組高級分析之細胞譜系分析
基于單細胞轉錄組數據的細胞軌跡分析常見形式有細胞變化軌跡分析和細胞譜系分析，在上一篇中，我們詳細介紹了常規擬時間序列分析的相關內容（具體內容查看鏈接）。在這里，我們主要就細胞譜系分析進行介紹和解讀。細胞譜系分析，最簡明的理解就是細胞領域的進化樹，通常指的是某類祖源細胞，在特定條件下，有多個發育軌跡和
單細胞分離技術
單細胞測序日趨火爆的原因很大程度上得益于單細胞分離技術的不斷完善。這一講，我們將跟大家一起回顧傳統的單細胞分離技術，并重點介紹單細胞分離技術的新寵微孔芯片技術及微流控技術。圖1為目前常見單細胞分離設備。圖1：目前常見單細胞分離設備傳統單細胞分離技術相信許多實驗人員，都見過下面我們要介紹的傳統的單細胞
楊樹次生木質部單細胞轉錄組圖譜建立
近日，北京林業大學教授張德強團隊在《植物生物技術雜志》發表研究論文。該研究以楊樹為研究模式，利用單細胞測序技術、基因組分析、RNA原位雜交、愈傷組織遺傳轉化等技術建立了楊樹次生木質部的單細胞轉錄組圖譜，重構了完整的楊樹次生木質部細胞類群，鑒定了調控木質部發育過程的關鍵轉錄因子，系統解答了次生木質
單細胞轉錄組測序研究熱點和發文錦囊
從Top50期刊2000余篇文獻統計： 在剛剛發布的“十四五”規劃中，“基因與生物技術”作為前沿科技攻關領域之一。而在這個領域，近年來最具里程碑的技術突破必然不能忽略“單細胞轉錄組測序”。本文通過對PubMed數據庫中Top50期刊的共計2357篇單細胞轉錄組測序的引文進行數據分析，幫助讀者了
新型微生物群體單細胞分辨率高通量空間轉錄組分析技術
近日，美國加州理工學院研究團隊開發了一種新的高通量空間轉錄組成像方法——并行連續熒光原位雜交par-seqFISH（parallel sequential fluorescence in situ hybridization）技術，能夠在單細胞水平鑒定和觀察微生物基因表達譜和微尺度環境中的空間信
同濟大學發表單細胞轉錄組研究新成果
人類大腦是極為復雜的，數十億神經元形成的龐大網絡控制著我們的行為和情感。正因如此，解析神經回路的分子基礎并不是一件容易的事。過去人們大多是在一塊腦組織上進行遺傳學和表觀遺傳學圖譜分析，但這樣的方法往往無法提供足夠的精確性。 同濟大學醫學院的研究團隊將電生理學技術與單細胞轉錄組分析結合起來，揭示
科學家繪制水稻幼苗根葉單細胞轉錄圖譜
水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄組二維UMAP圖與組織解剖圖 圖片來源：錢文峰等 中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組應用單細胞轉錄組測序技術，獲得了水稻幼苗葉和根超過20萬個單細胞的轉錄組信息，利用細胞類型標記基因和原位雜交技術，對每個細胞的身份進行了鑒定，構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄
人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果
人腦是由多種不同類別細胞組成的極其復雜的器官。傳統的細胞分類方法只能根據少數已知的細胞的標記分子（marker）對細胞進行分類，對每一類細胞的認識也非常有限。斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其團隊利用單細胞測序技術，對466個人大腦皮層的單細胞進行了轉錄組測序，通過數據分析發
研究人員繪制七鰓鰻單細胞轉錄組圖譜
雷氏七鰓鰻作為現存的無頜脊椎動物代表，是一種由無脊椎動物向脊椎動物進化的過渡類型，被視為研究脊椎動物演化的重要模式生物。近日，華大生命科學研究院聯合遼寧師范大學七鰓鰻研究中心等單位在《自然—通訊》發表最新研究成果，團隊基于華大自主研發的DNBelab C4和 DNBSEQ測序平臺，采用單細胞RNA測