Cell：單細胞測序繪制骨髓基質細胞全景圖譜
最新發布在Cell上的一項研究表明，單細胞測序可以繪制骨髓基質細胞的完整類群，并為白血病研究提供新的視角。這一新研究由美國哈佛大學的David T. Scadden教授和馬薩諸塞州綜合醫院Broad研究所的Aviv Regev團隊合作而成。他們創新地使用單細胞RNA測序（scRNA-seq）技術對急性髓（細胞）性白血病（AML）小鼠的骨髓基質細胞進行研究。 新研究視角：骨髓基質 AML是一種高度致命的白血病類型，常常發生在骨髓細胞成長周期發生中斷時血液中未成熟細胞過度繁殖的情形下。一般情況下，被診斷為AML的成年人5年生存率最多只有30％。 本次研究中便針對這一“絕對致命”的血癌類型進行研究。通過AML小鼠模型研究發現，在病程發展過程中，骨髓基質細胞改變了骨髓微環境，導致骨髓干細胞和血液發育干細胞因子的生長被阻斷。 因此，探索骨髓基質細胞映射骨髓微環境或許成為白血病研究提供了新的視角。盡管基質細胞充斥在幾乎所有器官中......閱讀全文
Cell：單細胞測序繪制骨髓基質細胞全景圖譜
最新發布在Cell上的一項研究表明，單細胞測序可以繪制骨髓基質細胞的完整類群，并為白血病研究提供新的視角。這一新研究由美國哈佛大學的David T. Scadden教授和馬薩諸塞州綜合醫院Broad研究所的Aviv Regev團隊合作而成。他們創新地使用單細胞RNA測序（scRNA-seq）技術
Cell：利用單細胞測序描繪骨髓間質完整的細胞類群
2019年5月23日，哈佛大學的研究人員在Cell上發表了題為“A Cellular Taxonomy of the Bone Marrow Stroma in Homeostasis and Leukemia”的文章。研究者們從單細胞角度系統地對骨髓間質細胞進行了詳細的分類學研究，揭示了急性髓
Cell：科學家利用單細胞測序描繪骨髓間質完整細胞類群
哈佛大學的研究人員在Cell上發表了題為“A Cellular Taxonomy of the Bone Marrow Stroma in Homeostasis and Leukemia”的文章。研究者們從單細胞角度系統地對骨髓間質細胞進行了詳細的分類學研究，揭示了急性髓系白血病對間質細胞群體
單細胞測序技術(single－cell－sequencing)－綜述（一）
單細胞生物學最近幾年是非常熱門的研究方向。在這一領域中，最前沿的則是單細胞測序技術。傳統測序方法一次處理成千上萬個細胞，得到的變異水平也是成千上萬個細胞的平均后水平。但是，就如同世界上沒有完全相同的兩片樹葉一樣，沒有兩個細胞是完全相同的。所以，單細胞測序對于研究單個細胞就顯得至關重要。單細胞測序可以
單細胞測序技術(single－cell－sequencing)－綜述（二）
DroNC-seq10月，Broad研究所張鋒教授團隊在Nature Methods上發表題為“Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq (doi: 10.1038/nmeth.4407)” 的文章，提出了一個新的測
Cell：單細胞測序深度解析三陰乳腺癌
美國MD安德森癌癥中心聯合瑞典卡羅林斯卡學院的研究人員利用單細胞測序對三陰乳腺癌展開分析，表明耐藥性是來源于現有的帶有基因突變的克隆。這些結果于周四發表在《Cell》雜志上，將對這種癌癥的診斷、預后和治療具有臨床意義。 三陰乳腺癌是指雌激素受體、孕激素受體和原癌基因Her-2均為陰性的乳腺癌。
Cell－Stem－Cell巧用單細胞測序解析生發過程深層次調控機制
單細胞轉錄組測序是這兩年來非常流行的高通量組學研究工具，然而，是不是所有的研究都適合用該方法？是不是所有的問題都可以通過該方法來解釋？這是一個值得探討的問題。從現有的研究報道來說，單細胞轉錄組學研究很好地解決了細胞圖譜，發育過程等重要的生物學問題。但是在相對比較傳統的研究方向，是否也能利用單細胞
Cell－Res重點論文：單細胞表觀多組學測序技術最新突破
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Cell－Res重點論文：單細胞表觀多組學測序技術最新突破
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
單細胞測序基準數據集－Immune－Cell－Atlas－有哪些應用場景？
單細胞測序基準數據集 Immune Cell Atlas 具有以下應用場景：??1. 新算法和分析工具的評估與驗證：研究人員開發新的單細胞數據分析算法或工具時，可以使用該數據集來檢驗其性能和準確性，并與現有的方法進行比較。??2. 免疫細胞類型和狀態的精準鑒定：幫助優化細胞類型和狀態的分類算法，提高
單細胞測序需要準備什么再去測序
DNA測序的測序原理： DNA測序是指分析特定DNA片段的堿基序列，也就是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）與鳥嘌呤的（G）排列方式。快速的DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。
單細胞測序方法匯總
單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題，而且-前沿的領域就是單細胞RNA測序了（scRNA-seq）。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序，并給出平均差異，但并沒有兩個細胞是完全一樣的，而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變，甚至這種技術還能夠闡明完整
什么是單細胞測序？
單細胞測序是一種能夠在單個細胞水平上對基因組、轉錄組、表觀遺傳組等進行分析的技術。通過單細胞測序，可以：揭示細胞的異質性：了解即使是看似相同的細胞群體中，每個細胞在基因表達、染色質可及性等方面的獨特特征。發現新的細胞類型和狀態：識別出傳統方法難以區分的稀有細胞類型以及細胞在不同生理或病理條件下的特殊
Nature：單細胞測序（上）
Nicholas Navin所需要的就只是一個細胞――問題是如何得到它。這是在2010年，冷泉港實驗室的博士后研究員正在探究驅動乳腺癌的遺傳改變。此前的大部分癌癥基因組研究都是碾碎少量的腫瘤組織，一并將這些DNA進行測序，生成的是一張癌癥基因組的一致圖像。但Navin想要解析來自單個細胞的序
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位，研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位，研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
單細胞測序方法介紹
單細胞RNA測序（scRNA-seq）作為一種全基因組測序的方式，在單細胞層面廣泛用于確定細胞類型和細胞變異的鑒定。Namocell單細胞分離儀可以通過細胞標記CD27以及一種細胞活性的染料，來分選出單個活的B細胞。通過分析分離后的單細胞基因表達情況，對比靜息記憶B細胞，可以從單細胞層面研究基因表達
Nature：單細胞測序（下）
隨著技術的飛速發展，成本大大降低，使得基因組測序成為常規技術。然而，大多數的人類基因組、癌癥或其他仍然是通過從多個細胞中抽提DNA來進行測序，它所忽略的細胞間的差異對于控制基因表達、細胞行為和藥物反應卻有可能是至關重要的。 該研究小組也觀測了其他類型的乳腺癌。將腫瘤作為一個整體測序，研究小
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位，研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。
Namocell單細胞分離儀應用——單細胞測序
2018年11月，Namocell與CZ-Biohub（Chan Zuckerburg Biohub）合作，在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞，并且將其進行單細胞測序，為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序（scRNA-s
時空分辨單細胞測序技術與其他單細胞測序技術的差異
時空分辨單細胞測序技術與其他單細胞測序技術主要在以下方面存在區別：空間信息獲取普通單細胞測序技術：通常不提供細胞在原始組織中的空間位置信息。時空分辨單細胞測序技術：能夠同時獲取細胞的基因表達等信息以及它們在組織內的空間位置。細胞間相互作用分析普通單細胞測序技術：難以直接推斷細胞間基于空間位置的相互作
時空分辨單細胞測序技術和傳統單細胞測序技術的區別
時空分辨單細胞測序技術和傳統單細胞測序技術主要有以下區別：空間信息獲取傳統單細胞測序：通常無法獲取細胞在組織中的空間位置信息，只是對分離出的單細胞進行獨立分析。時空分辨單細胞測序：能夠在測定單細胞基因表達等信息的同時，明確細胞在原始組織中的具體空間位置。細胞互作研究傳統單細胞測序：難以直觀地揭示基于
單細胞測序技術在－Immune－Cell－Atlas－數據集中的作用是什么？
單細胞測序技術在 Immune Cell Atlas 數據集中起到了關鍵作用，包括以下幾個方面：??1. 揭示細胞異質性：能夠檢測到單個免疫細胞之間基因表達的細微差異，從而發現不同的免疫細胞亞型和細胞狀態，這對于全面了解免疫系統的復雜性至關重要。??2. 精準定義細胞類型：通過分析單個細胞的基因表達
單細胞測序基準數據集－Immune－Cell－Atlas－包含了多少種細胞類型？
Immune Cell Atlas 涵蓋了非常廣泛的免疫細胞類型，包括但不限于數十種常見和罕見的類型。具體的數量可能會隨著研究的推進和新數據的納入而有所變化。常見的免疫細胞類型如 T 細胞、B 細胞、NK 細胞、巨噬細胞、樹突狀細胞等都包含在內，并且對這些細胞的不同亞型和活化狀態也有詳細的表征。
Cell－Ranger－開源代碼在分析單細胞測序數據時有哪些優點？
Cell Ranger 開源代碼在分析單細胞測序數據時具有以下優點：針對性和兼容性好專為 10x Genomics 平臺生成的數據設計，能很好地兼容和處理該平臺產生的各種單細胞測序數據，確保數據處理的準確性和可靠性。高效的數據分析流程提供了從原始數據的預處理、基因定量到細胞聚類和差異表達分析的一站式
開源代碼－Cell－Ranger－可以處理哪些類型的單細胞測序數據？
Cell Ranger 主要用于處理由 10x Genomics 平臺生成的單細胞測序數據，包括以下幾種常見類型：單細胞 RNA 測序（scRNA-seq）數據單細胞免疫組庫（scVDJ-seq）測序數據單細胞 ATAC 測序（scATAC-seq）數據（在較新的版本中支持）它為這些數據提供了從原始
單細胞測序基準數據集－Immune－Cell－Atlas－涵蓋了哪些免疫細胞類型？
Immune Cell Atlas（免疫細胞圖譜）涵蓋了多種免疫細胞類型，包括但不限于以下常見類型：??1. T 細胞：如 CD4+ T 細胞（輔助性 T 細胞）、CD8+ T 細胞（細胞毒性 T 細胞）、調節性 T 細胞等。?2. B 細胞：包括初始 B 細胞、記憶 B 細胞、漿細胞等。?3. 自
Cell：機械敏感性基質影響
細胞能感知周圍細胞微環境，并對此做出反應，這些微環境十分重要，會影響細胞的形態、蛋白質水平和定位、基因表達，乃至核完整性。組織微韌性（micro-stiffness）在很大程度上受到細胞外基質的影響，但有機體內基質變化很大，因此也許可以作為分析和組織許多細胞類型和分子進程的一個有用參數，比如用于
骨髓基質肌樣細胞的純化方法介紹
在血液細胞和骨髓細胞靜置培養時，常有許多肌樣細胞和骨髓基質細胞貼壁生長，但也有許多淋巴細胞、單核細胞、粒細胞粘附其上，種類混雜，鑒于粘附細胞貼壁不牢固，也可用酶消化法使粘附細胞脫壁分離，以達到骨髓基質細胞或血液中肌樣細胞與淋巴細胞分開和純化的目的。其方法如下：①待基質或肌樣細胞基本形成單層時，倒去舊