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    單細胞表觀組學:單細胞ChIPseq解碼細胞命運決定機制

    在國家重點研發計劃“干細胞及轉化”重點專項(批準號:2017YFA0103402)等資助下,北京大學分子醫學研究所、北大-清華生命科學聯合中心何愛彬課題組近期突破單細胞表觀遺傳研究的瓶頸,開發了兩種具有普適性、操作簡單、風格迥異的單細胞ChIP-seq技術,可適應于不同課題研究需要,解析發育與疾病狀態下細胞命運決定調控機制。這兩項技術分別于2019年8月27日在Molecular Cell和2019年9月3日在Nature Cell Biology在線發表。研究論文題目分別為“CoBATCH for high-throughput single-cell epigenomic profiling”和“Profiling chromatin state by single-cell itChIP-seq”。 多細胞生物體由具有相同基因組的不同細胞類型組成,在器官組織發育過程中,細胞狀態和細胞命運決定的機制一直是領域普遍關心的......閱讀全文

    單細胞表觀組學:單細胞ChIPseq解碼細胞命運決定機制

      在國家重點研發計劃“干細胞及轉化”重點專項(批準號:2017YFA0103402)等資助下,北京大學分子醫學研究所、北大-清華生命科學聯合中心何愛彬課題組近期突破單細胞表觀遺傳研究的瓶頸,開發了兩種具有普適性、操作簡單、風格迥異的單細胞ChIP-seq技術,可適應于不同課題研究需要,解析發育與疾

    新一代單細胞itChIP技術解析早期胚胎細胞命運決定機制

      2019年9月3日,北京大學分子醫學研究所、北大-清華生命科學聯合中心何愛彬組在《Nature Cell Biology》在線發表了題為Profiling chromatin state by single-cell itChIP-seq的文章,報道了利用一種全新的普適性,易操作的單細胞ChIP

    單細胞組學解碼泛癌腫瘤微環境中的T細胞

    T細胞是最關鍵的抗腫瘤免疫細胞。腫瘤微環境中存在“腫瘤浸潤T細胞”亞群,能夠對腫瘤抗原產生反應,肩負著清除腫瘤細胞的重任,也是摧毀癌細胞的“主力軍”。然而,隨著腫瘤發展,這些英勇的“戰士”常常陷入功能失調狀態,“戰斗力”大幅下降,被科學家稱為“T細胞耗竭”。越來越多的證據表明,不同癌癥的腫瘤微環境對

    單細胞脂質組學技術的機制及意義

      5月17日,清華大學精密儀器系質譜研究團隊發文報道基于質譜的單細胞脂質組精細結構表征技術,實現了哺乳動物單細胞內脂質的大規模精細結構分析,解決了單細胞質譜領域長期面臨的關鍵技術挑戰。基于單細胞內多種類型脂質異構體的鑒定與相對定量,該團隊實現了野生型非小細胞肺癌(HCC827)細胞群體中耐藥細胞的

    最新!北京大學何愛彬研究組Molecular-Cell發文

      2019年8月27日,北京大學分子醫學研究所,北京大學-清華大學生命科學聯合中心研究員何愛彬研究組在Molecular Cell雜志在線發表題為“CoBATCH for high-throughput single-cell epigenomic profiling”的文章,報道了一種新的具有普

    機器學習遇到單細胞組學:Perturbation-Modeling

    ? ? ? ?細胞生物學的相關研究一直受限于數據的完整性和表型的完整性,對應激狀態和穩態下的細胞區別觀察不夠充分。過去五年中,計算機視覺和語音識別領域通過對大量的無標簽數據進行學習、建模,很好的解決了數據不足的問題。同樣在最近的研究中,機器學習方法使用單細胞數據進行擾動建模也推動了細胞生物領域前進。

    當代謝組學技術遇到單細胞測序技術

    代謝組的狀態是對遺傳因素、外部環境和治療干預等信息的綜合反映,因此是一個跟蹤和了解上述因素對表型影響的理想研究目標。代謝組可做多種樣品類型、結果富含各種信息、可作為連接其他組學數據與表型之間的橋梁。過去20年,組學研究飛速發展,處于中心法則末端的代謝組學雖然起步較晚但是發展很快。很多組學研究目前已進

    Cell-Res重點論文:單細胞表觀多組學測序技術最新突破

      2017年6月16日,北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

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      2017年6月16日,北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

    北大湯富酬課題組發表單細胞表觀多組學測序技術新成果

      2017年6月16日,北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

    Nature發布單細胞基因組學新技術

      胚胎是如何形成我們肺臟、肌肉、神經和其他組織中的細胞的?一種新的方法可以解碼使得胚胎萬能細胞能夠增殖并轉變為機體許多特化細胞類型的遺傳指令。   一開始是一團相同的細胞,隨著增殖不斷地改變形狀和功能,最終變為我們肺臟、肌肉、神經和機體所有其他特化組織中的細胞。胚胎擁有這種創造奇跡的能力。  

    布魯克發布全新空間單細胞代謝組學研究策略

      摘要  * 創新的無偏原位空間單細胞代謝組學(SSCM)能夠以單細胞分辨率實現高通量代謝組織樣本表征;  * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技術可在大視場內提供幾乎無偽影的小分子圖像;  * 創新的 4D-代謝組學可通過 CCS-Predict

    單細胞和空間組學技術在肝臟領域應用

      近期,中國科學院上海營養與健康研究所李虹研究組在《肝臟病學雜志》(Journal of Hepatology)上,發表了題為Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的綜述文章。該文章闡述了前沿的單細胞

    2025蛋白質組學大會之單細胞蛋白質組學研究

      2025年10月13日上午10:10,第12屆AOHUPO大會暨第8屆AOAPO大會、π-HuB國際大科學計劃第三屆全球峰會暨第13屆CNHUPO大會“Single Cell Proteomics”分論壇在廣州白云國際會議中心汕頭廳(Shantou Hall)成功舉行。  本場論壇由浙江大學方群

    人視網膜神經發育和再生的潛在新機制獲揭示

    近日,中山大學中山眼科中心教授胡友金團隊報道了一種名為scRICA-seq(single-cell RNA isoform and chromatin accessibility sequencing)的單細胞多組學測序方法,該技術能夠同時檢測單細胞水平染色質可及性、RNA表達,以及 isoform

    我國在單細胞蛋白質組學研究獲突破

      浙江大學化學系微分析系統研究所方群教授團隊,聯合北京大學醫學部精準醫療多組學研究中心主任黃超蘭教授團隊,在單細胞蛋白質組學分析研究領域取得突破性進展。研究論文近日在線發表在美國《分析化學》雜志上。  黃超蘭介紹,近年來,基于細胞群體內的蛋白質組學研究,已越來越難以滿足對生命功能深入探究的需要。從

    單細胞和空間組學技術在肝臟領域的應用

      近期,中國科學院上海營養與健康研究所李虹研究組在《肝臟病學雜志》(Journal of Hepatology)上,發表了題為Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的綜述文章。該文章闡述了前沿的單細胞

    突破性單細胞表觀基因組與轉錄組分析新技術

      由英國及比利時的研究人員開發出的一種新方法,使得在單細胞中同時研究表觀基因組及轉錄組成為可能。發布在《自然方法》(Nature Methods)上的實驗方案,可幫助科學家們精確描繪出DNA甲基化改變與基因表達之間的關系。  近年來單細胞測序技術發展迅速,被廣泛用于研究細胞間的基因表達譜(轉錄組)

    科學家開發單細胞命運軌跡預測技術

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506231.shtm

    -Nat-Met:新型單細胞技術助力表觀遺傳研究

      跨學科組織的專家們首次為臨床醫生實現“無艾滋病時代”的目標設計了最新的改進方案,方案融合了尖端的生物醫學技術以及基礎的行為干預方法。該研究發表在《美國醫學協會雜志》上。  這項方案是由國際抗病毒組織IAS-USA召集的專家志愿者小組提出的,為臨床醫生實施新型HIV預防方法提供了指導方針。專家們對

    新研究揭示炎癥決定細胞命運的機制

      最新研究顯示,人體炎癥可以通過一種獨特的、高度組織化的受體來控制,這種受體可以在細胞表面"跳舞"。  這一發現發表在《Science Signaling》雜志上,解釋了這個過程如何決定細胞是死亡、繁殖還是在體內遷移。  來自雷丁大學和位于維爾茨堡的德國研究機構的研究小組記錄了一種名為TNFR1的

    定量解析“基因開關”,探索細胞命運決定機制

    細胞可以通過命運決定過程來不斷適應環境變化,實現和完善其自身功能。理解細胞命運決定的具體機理對于回答復雜生命如何誕生、實現組織和器官再生、以及合成人工生命體等問題非常重要。北京時間3月24日,一項發表于《自然—化學生物學》的研究通過定量實驗和數理模型的手段,深入探究了經典人工合成基因線路“撥動開關”

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      細胞可以通過命運決定過程來不斷適應環境變化,實現和完善其自身功能。理解細胞命運決定的具體機理對于回答復雜生命如何誕生、實現組織和器官再生、以及合成人工生命體等問題非常重要。  北京時間3月24日,一項發表于《自然—化學生物學》的研究通過定量實驗和數理模型的手段,深入探究了經典人工合成基因線路“撥

    單細胞分離用于單細胞基因擴增

     單細胞分離連接不同管徑大小的毛細玻璃針,可分離捕獲各種非貼壁狀態的單細胞和微粒等,如細菌、酵母、藻類細胞、植物花粉、原生動物單細胞、懸浮細胞、血液細胞、免疫細胞、卵細胞、各種懸液中單細胞及特殊標記的單細胞等。  單細胞分離用于各種類型的細胞分離培養、純化、檢測;獲得單克隆細胞;用于單細胞基因擴增,

    單細胞蛋白質組學:讓細胞個體研究更加精細

    ????細胞是生命活動的基本單元。對細胞的精確認知是理解細胞在生理和病理過程中功能的先決條件。????在組織、器官或個體中,細胞具有非常大的異質性,而傳統的研究手段針對大量細胞進行分析,得到的是大量細胞的平均結果,無法區分不同細胞個體對于大量樣品結果的具體貢獻值,從而忽視或掩蓋了單細胞的個體差異,不

    上海交通大學醫學院單細胞組學與疾病研究中心成立

       11月3日,上海交通大學醫學院單細胞組學與疾病研究中心揭牌成立。當天還舉行了單細胞組學技術與應用國際研討會,中外科學家會聚一堂探討這一新的研究方法和及其發展前景。  據悉,該中心依托上海交通大學公共衛生學院管理,將聚焦疾病領域前沿科學問題,運用新興的單細胞組學研究手段,揭示個體差異的分子基礎,

    Nature論述:單細胞基因組學揭開“免疫新世界”

      人類對生命的好奇,從來沒有減退。一個多世紀以來,科學家們一直試圖解析構成我們機體的成千上萬億個細胞,從一米長的神經元到8微米寬的紅細胞。他們希望從中找到解析重要生理、病理過程,挖掘重要的細胞類型和信號通路。  但是,過去幾十年,包括熒光抗體標記技術、DNA和RNA測序技術等在內的研究工具卻不能解

    單細胞基因組學:通往個體化醫療之門

      隨著第二代測序技術的普及,單細胞測序迎來了迅猛發展。  近日,南方科技大學生物學系副教授賀建奎在美國冷泉港參加了單細胞分析會議后,在科學網博客里寫道:“這是一個非常令人激動的前沿學術會議,我深深地體會到了單細胞基因組學時代的來臨。”  他對《中國科學報》表示:“單細胞基因測序技術的突破,只是開了

    IsoPlexis單細胞蛋白質組學檢測服務即將啟動啦!

      重磅消息來襲  你想要的單細胞  蛋白質組學檢測服務即將啟動啦!  單細胞蛋白質檢測技術  傳統的細胞分析通常包含數千個或更多的細胞,提供了一個總體平均值,掩蓋了重要的細胞異質性,尤其是一些發揮重要作用的稀有細胞群體的意義,比如免疫細胞、腫瘤細胞、干細胞等均展現出廣泛的異質性。  當前,隨著單細

    首個棉花纖維起始發育單細胞時空組學圖譜發布

    近日,中國農業科學院棉花研究所鄉村振興科技創新團隊牽頭構建了首個結合單細胞轉錄組、空間轉錄組及空間代謝組的棉花纖維起始發育圖譜。利用該圖譜可以識別關鍵基因的表達模式及其與代謝途徑的關系,深入剖析纖維發育過程中的核心調控機制。相關研究成果發表在《自然通訊(Nature Communications)》

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