如何利用TCGA數據庫進行深度癌癥研究及發大牛文章？
玩轉數據庫，助你發牛文！癌癥研究究竟有多難？讓我們來捋一下基本思路：首先，要有一定數量的高質量腫瘤臨床樣本；其次……等一下，是不是在“首先”這一步就卡住了？癌癥研究中的高質量的腫瘤樣本不但要有切除適當的腫瘤瘤體和癌旁組織，還需要每個病人的各項病理指征、家族病史、治療手段、療效以及對病人不間斷的隨訪信息。要滿足這些苛刻的要求，無論對于戰斗在一線的臨床醫生，還是各大高校的科研人員都是十分困難的。難道真的沒有解決辦法嗎？當然有！TCGA數據庫，質量高、樣本多，而且還是免費的！【歡脫的傳送門：https://cancergenome.nih.gov/】TCGA（The Cancer Genome Atlas）,即癌癥和腫瘤基因圖譜計劃，是由美國國家癌癥和腫瘤研究所（NCI）和國家人類基因組研究所(NHGRI）聯合進行的。該計劃通過應用基因組分析技術，特別是采用大規模的基因組測序，將人類全部癌癥(近期目標為50種包括亞型在內的腫瘤）的......閱讀全文
如何利用TCGA數據庫進行深度癌癥研究及發大牛文章？
玩轉數據庫，助你發牛文！ 癌癥研究究竟有多難？讓我們來捋一下基本思路：首先，要有一定數量的高質量腫瘤臨床樣本；其次……等一下，是不是在“首先”這一步就卡住了？癌癥研究中的高質量的腫瘤樣本不但要有切除適當的腫瘤瘤體和癌旁組織，還需要每個病人的各項病理指征、家族病史、治療手段、療效以及對病人不
如何利用TCGA數據庫進行深度癌癥研究及發大牛文章？
玩轉數據庫，助你發牛文！癌癥研究究竟有多難？讓我們來捋一下基本思路：首先，要有一定數量的高質量腫瘤臨床樣本；其次……等一下，是不是在“首先”這一步就卡住了？癌癥研究中的高質量的腫瘤樣本不但要有切除適當的腫瘤瘤體和癌旁組織，還需要每個病人的各項病理指征、家族病史、治療手段、療效以及對病人不間斷的隨訪信
Nature癌癥綜述：如何用CRISPR進行癌癥研究
CRISPR/Cas9系統可以很容易地改寫多種生物的基因組，這一技術很快如風暴一般席卷了整個基因組工程領域。可想而知，以CRISPR/Cas9為基礎的各種應用也將為癌癥遺傳學領域帶來一場變革。麻省理工霍華德?休斯醫學研究所的Tyler Jacks就是這方面的先行者，他去年連發兩篇Nature文
Nature綜述：如何用CRISPR進行癌癥研究
CRISPR–Cas9系統可以很容易地改寫多種生物的基因組，這一技術很快如風暴一般席卷了整個基因組工程領域。可想而知，以CRISPR–Cas9為基礎的各種應用也將為癌癥遺傳學領域帶來一場變革。麻省理工霍華德?休斯醫學研究所的Tyler Jacks就是這方面的先行者，他去年連發兩篇Nature文章
癌癥基因組項目(TCGA)完成之反思
經過美國不懈的努力，涉及上萬個癌基因的癌基因組項目正式告一段落。該項目在2006年開始，預計花費1億美元進行研究，并且癌癥基因組圖譜（TCGA）現在已經成為國際癌癥基因組協會最大的組成部分，該項目匯聚了來自16個國家的科學家，并發現了接近10萬個與癌癥相關的基因突變。 現在的問題是，下一步怎么
腫瘤免疫火得飛起，更新后的TIMER－2.0數據庫真心好用！
腫瘤微環境中免疫細胞的組成和豐度是影響腫瘤進展和免疫治療效果的重要因素。由于直接測量方法的局限性，計算算法通常用于從腫瘤轉錄組圖譜推斷免疫細胞組成。這些估計的腫瘤免疫浸潤人群與腫瘤的基因組和轉錄組學變化相關，提供了對腫瘤免疫相互作用的見解。今天我們就一起來看這個腫瘤免疫分析的又一神器——TIME
深度解析癌癥免疫療法—如何訓練機體來抵御癌癥？
人類機體的免疫系統非常強大而且復雜，其能夠有效鑒別并且破壞幾乎具有無限多樣性的外來入侵者，但不幸的是，被破壞的癌細胞還會繼續保持在機體中，并且不斷發展，損傷細胞這種“識別和自我忽略”的信號就會讓其躲避免疫系統的檢測，因此這些損傷細胞的生長就不會受到“煩擾”，從而就會破壞機體組織和器官中的正常生理
2019年，大牛們都在研究什么？—m6A文章盤點
19年悄悄的已經將近過半，但RNA甲基化研究馬不停歇。單單過去一個半月的時間里高分文章就有十多篇，Nature，Cell子刊均有相關文章發表；造血干細胞分化，癌細胞上皮間質轉化，樹突細胞活化，心肌細胞肥厚，內源性免疫應答調控都有它的身影。這里小編給大家列舉展示幾篇最新的m6A RNA甲基化研究成
2019年，大牛們都在研究什么？—m6A文章盤點
19年悄悄的已經將近過半，但RNA甲基化研究馬不停歇。單單過去一個半月的時間里高分文章就有十多篇，Nature，Cell子刊均有相關文章發表；造血干細胞分化，癌細胞上皮間質轉化，樹突細胞活化，心肌細胞肥厚，內源性免疫應答調控都有它的身影。這里小編給大家列舉展示幾篇最新的m6A RNA甲基化研究成
如何利用－Immune－Cell－Atlas－基準數據集進行研究？
利用 Immune Cell Atlas 基準數據集進行研究可以采取以下步驟：??1. 明確研究問題 ? ?- 確定您想要探索的具體免疫學問題，例如特定疾病中免疫細胞的變化、免疫細胞發育的軌跡、免疫治療反應的機制等。??2. 數據獲取和預處理 ? ?- 從相關數據庫或研究團隊獲取數據集。
如何利用多種成像技術加速癌癥等疾病的研究！
近年來，科學家們通過研究開發出了多種成像技術來加速人類癌癥、肥胖等疾病的研究，本文中，將相關重要研究成果進行整理，分享給大家！與大家一起學習！ 【1】Cell Rep：利用組合性成像技術成功追蹤阿爾茲海默病患者大腦的退化過程 近日，一項刊登在國際雜志Cell Reports上的研究報告中，來
大牛！不到半年，發兩篇Nature！
今年3月，彭慧勝團隊成功將顯示器件的制備與織物編織過程實現融合，在高分子復合纖維交織點集成多功能微型發光器件，揭示了纖維電極之間電場分布的獨特規律，實現了大面積柔性顯示織物和智能集成系統。相關研究成果以《大面積顯示織物及其功能集成系統》（“Large-area display textiles in
捏造了一個年發180篇論文假“大牛”，后續文章將面臨處理
為了表達對論文數、被引數等量化評價指標的不滿，Camille No?s1年前首次出現在研究領域。從那以后，No?s成為180篇期刊論文的作者，涉及的領域包括天體物理學，分子生物學和生態學，并且正在被引用。Camille No?s 由 RogueESR 憑空創造，這是一個由法國高等教育和研究（簡稱
如何利用XRF技術進行檢測？
分析儀發出X射線。X射線撞擊到被測樣品，使樣品中的元素發出熒光，然后再返回到分析儀中的X射線探測器。分析儀對返回的X射線進行計數，并通過數學運算，得出分析結果。
腫瘤研究大牛PNAS解析與癌癥生長有關微量元素
銅是人體所必需的微量元素，如果出現不平衡，就會導致各種病理狀況，比如癌癥的發生。然而目前關于這種微量元素與癌癥之間的分子和細胞作用機制，科學家們了解的還并不多。 來自瑞士洛桑聯邦理工學院的一組研究人員發表了題為“Bioavailable copper modulates oxidative
全球首例利用細胞移植治療癌癥手術成功進行
全球首宗利用細胞移植治癌手術日前成功進行。英國53歲的血癌患者斯科特(Joanne Scott)在化療無效后接受女兒捐贈的細胞，成功抑制了癌細胞擴散。?據香港《明報》報道，此前醫生稱斯科特只有8個月的生命。倫敦皇家自由醫院(Royal Free Hospital)的醫生從其女兒身上取走細胞，經實驗室
6篇Nature齊發！癌癥基因組計劃成果成井噴之勢
除了Nature一次性發表6篇論文外，Nature Genetics雜志發表了3篇，Nature Communications發表9篇，Nature Biotechnology一篇，詳細報道BioArt后續會陸續發布。文章合集網址：https://www.nature.com/collectio
癌癥基因組——癌癥研究和云計算的里程碑
圖片來源：https://www.nature.com/articles/d41586-020-00308-w 2001年，人類基因組計劃完成，整個計劃花費約30億美元，1985年提出，1990年正式啟動，歷經十余年。腫瘤是最熱門的研究領域之一，該領域的研究者們一直希望可以借助測序手段去表征腫瘤的
多篇亮點文章共同解讀癌癥“幫兇”如何助紂為虐！
我們都知道，癌癥的發生很復雜，而且往往是由于多種因素互相作用而引起的，然而有時候癌癥的發生或擴散往往需要幫手來幫忙，那么到底有那些因素會成為癌癥的“幫兇”來幫助癌癥發展呢？本文中小編整理了近年來相關的研究報告，分享給各位！讓我們一起來認識一下癌癥都有哪些“幫兇”！ 【1】兩項研究揭示骨髓源性免
如何利用土壤取樣器具進行土壤取樣？
近幾年，隨著農業科技的發展，在農業生產中對于作物生長環境我們需要通過各種樣本檢測是非常重要的一項工作，其中項目zui多的就是土壤檢測，，我們必須在檢測之前采集足夠具有代表性的土壤樣本，過去我們都通過工具隨機選擇獲得，但是那樣會影響我們需要測試的土壤樣品。自從我們了解這一情況以來，而市面上就出現了各種
如何利用歷史監測數據進行苔蘚物種監測？
利用歷史監測數據進行苔蘚物種監測可以通過以下步驟：數據整理與分析對歷史監測數據進行系統的整理，包括苔蘚物種的種類、數量、分布地點、監測時間等信息。運用統計學方法和數據分析工具，分析數據的趨勢、變異性和相關性。確定基線根據整理和分析的結果，確定苔蘚物種的基線狀態，例如常見物種的正常分布范圍、數量水平等
如何利用透析法進行脫鹽濃縮蛋白
二、蛋白質的分離純化蛋白質的分離純化方法很多，主要有：（一）根據蛋白質溶解度不同的分離方法1、蛋白質的鹽析中性鹽對蛋白質的溶解度有顯著影響，一般在低鹽濃度下隨著鹽濃度升高，蛋白質的溶解度增加，此稱鹽溶；當鹽濃度繼續升高時，蛋白質的溶解度不同程度下降并先后析出，這種現象稱鹽析，將大量鹽加到蛋白質溶液中
如何利用酶標儀進行細胞增殖與活力測定
酶標儀在細胞生物學與藥物篩選方面有著非常高的使用頻率，而在各種細胞檢測實驗中，細胞增殖能力的檢測是最為常見也是最基礎的檢測之一。 ●為什么要檢測細胞狀態呢？ 細胞狀態是直接反應細胞生理狀態的重要指標，通過監測細胞在各種化合物刺激作用下的反應狀態，從而確定測試分子是否對細胞增殖有影
如何利用歷史監測數據進行苔蘚物種監測？
利用歷史監測數據進行苔蘚物種監測可以采取以下步驟：數據整合與清理收集所有相關的歷史監測數據，將其整理為統一的格式。檢查數據的完整性和一致性，清理錯誤或缺失的數據。時空分析按時間順序分析苔蘚物種的分布和數量變化，了解其動態趨勢。對比不同地理位置的監測數據，發現區域差異和共性。物種多樣性評估計算不同時期
如何利用土壤取樣器具進行土壤取樣？
?近幾年，隨著農業科技的發展，在農業生產中對于作物生長環境我們需要通過各種樣本檢測是非常重要的一項工作，其中項目zui多的就是土壤檢測，，我們必須在檢測之前采集足夠具有代表性的土壤樣本，過去我們都通過工具隨機選擇獲得，但是那樣會影響我們需要測試的土壤樣品。自從我們了解這一情況以來，而市面上就出現了各
利用生物炭技術進行邊際土地生態利用研究獲進展
近日，廣東省農業科學院農業資源與環境研究所特聘教授林啟美聯合中國農業大學教授商建英等科研人員，在利用生物炭技術進行邊際土地生態利用研究方面取得新進展。相關研究發表于Biochar。 保護耕地紅線是我國基本國策，我國邊際土地面積是耕地的2倍以上，由于土壤條件惡劣，其糧食生產價值很低，科學地利用邊
利用生物炭技術進行邊際土地生態利用研究獲進展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498603.shtm
－“10,000個癌癥基因組計劃”宣告完成
旨在繪制出1萬個腫瘤基因組景觀圖譜的美國重大科研項目——“癌癥基因組圖集”（The Cancer Genome Atlas，TCGA）計劃已正式宣告結束。這一于2006年啟動，耗資1億美元的研究項目現在是國際腫瘤基因組協作組(International Cancer Genome Consort
又一國產高分數據庫，堪稱lncRNA神器
之前我們介紹了好用的CRN數據庫，可以在線分析差異表達lncRNA并繪制與差異mRNA聯系的網絡圖。那么有沒有能直接出lncRNA與預后相關的生存曲線圖的工具呢？答案當然是有的！這次我們就一起來看一下這個數據庫！ lnCAR數據庫（https://lncar.renlab.org/）是由中山大
Science：5篇頂級癌癥研究文章重復率差！
Science日前報道了癌癥生物學領域重現性項目（Reproducibility Project:Cancer Biology）指出該領域中一些高影響力癌癥研究文章可重復性非常差。其中，第一階段的5篇備受矚目的癌癥研究文章，在嚴格按照原始研究的實驗Protocol下進行重復性驗證后，發現只有兩篇