生物信息學新進展
計算機技術和人類基因組計劃的發展，應運而生了一門新興的學科——生物信息學，該學科包含了兩個交叉領域的工作：用于建立現代生物學所需信息系統框架（支持生物學的信息管理系統、分析工具和通訊網絡）的研究開發工作，即傳統意義上的生物信息學（bioinformatics）；旨在理解基本生物學問題的基于計算的研究工作，即計算生物學（computational biology）。生物信息學和基因組研究（Bioinformatics and Genome Research）系列會議于1990年開始舉辦，1997年6月11~12日在美國加州舊金山舉辦了第六屆國際生物信息學和基因組研究年會，年會的主要議題包括正在出現的新技術、基因的功能分析、新的數據工具和制藥先導的基因和蛋白質發現[1]。現將有關內容簡介如下： 一、正在出現的技術 Klingler(Lncyte pharmaceuticals,PaloAl......閱讀全文
生物信息學新進展
計算機技術和人類基因組計劃的發展，應運而生了一門新興的學科——生物信息學，該學科包含了兩個交叉領域的工作：用于建立現代生物學所需信息系統框架（支持生物學的信息管理系統、分析工具和通訊網絡）的研究開發工作，即傳統意義上的生物信息學（bioinformatics）；旨在理解基本生物學問題的基于計算的研究
生物信息學教程
Sequence - Evolution - FunctionComputational Approaches in Comparative GenomicsbyEugene V. KooninNational Center for Biotechnology Information, Bethes
生物信息學技術的原理
生物信息學在生命科學研究中起著越來越重要的作用。利用生物信息學對蛋白質組的各種數據進行處理和分析，也是蛋白質組研究的重要內容。生物信息學是蛋白質組學研究中不可缺少的一部分。生物信息學的發展，已不僅是單純的對基因組、蛋白質組數據的分析，而且可以對已知的或新的基因產物進行全面分析。在蛋白質組數據庫中儲存
生物信息學技術的技術原理
生物信息學在生命科學研究中起著越來越重要的作用。利用生物信息學對蛋白質組的各種數據進行處理和分析，也是蛋白質組研究的重要內容。生物信息學是蛋白質組學研究中不可缺少的一部分。生物信息學的發展，已不僅是單純的對基因組、蛋白質組數據的分析，而且可以對已知的或新的基因產物進行全面分析。在蛋白質組數據庫中儲存
生物信息學—促動BT與IT雙贏
? 無論是與結構基因組學對應的“基因時代”，還是與功能基因組學、蛋白質組學相應的“后基因時代”；無論你稱呼21世紀是“信息時代”、“后信息時代”，還是“生物時代”，所有這一切，都將BT(生物技術)與IT(信息技術)緊密結合起來。而這其中，無疑“生物信息學”占據了天時地利、出盡了風頭，雖然它自身及其相
生物芯片用于生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
Cystatin基因家族的生物信息學分析
實驗概要半胱氨酸蛋白酶抑制劑(cystatin)基因廣泛存在于植物物種中。該類基因能夠起到抑制某些病原微生物和昆蟲體內半耽氨酸蛋白酶的作用，在植物的防衛體系中起到重要作用。我們利用已經分離出植物cystatin基因的cystatin結構域為檢索序列在基因組水平上對擬南芥和水稻中的cystatin基因
生物信息學中的HSP的含義
熱休克蛋白（英文：heat shock protein ）又稱應激蛋白，是機體細胞在一些理化因素刺激后高效表達的一組蛋白質，因最先發現于果蠅唾液腺的熱應激反應中而得名，此后的研究表明，熱休克蛋白廣泛存在于人、動物、微生物和植物的細胞中，是一類在遺傳上高度保守的分子，能保護細胞并促進細胞對各種刺激所造
Science：生物信息學，神秘的新職業
今天的生物信息學家迎來了好時候。由于各個部門生成了幾乎無窮無盡的生物數據，因此形成了對于生物、統計學和計算機科學交叉領域中有經驗的專業人才的高度需求。科學家如果能夠分析大量信息并將其清晰地展示給決策制定者，就會發現自己的工作和職業生涯前途無量，尤其是在大型制藥和生物技術部門。 “在大數據時代，
成都生物所開發新型生物信息學軟件
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm????? ?近年來，隨著測序技術的快速發展，動物（尤其是非模式動物）全基因組數據（WGS）獲取變得簡單、便宜，這使得數據庫中全基因組數據量呈指數態勢增長。全基因組測序數據往往同時包含
生物芯片技術用于生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
生物芯片技術用于生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
特征選擇在生物信息學中的應用
隨著生物信息學的發展，許多模式識別技術無法滿足處理大量不相關特征的需求，因此特征選擇技術（FS techniques）在生物信息學中的應用就變得越來越重要了。在過去的幾年里，應用特征選擇技術已經從僅僅作為一個說明性的例子發展到了建立模型所需要的先決條件了。特征選擇技術最重要的目的有3點：（1）避免過
生物芯片技術應用與生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
上海生科院《Genome－Res》生物信息學新成果
十月十三日，國際基因組研究權威刊物《Genome Research》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所（中國科學院—馬普學會計算生物學伙伴研究所）的一項最新研究，題為“A probabilistic method for testing and estimating sele
北京大學PLOS生物信息學新成果
近日，北京大學分子醫學研究所李川昀課題組與何愛彬研究員合作，在國際著名遺傳學雜志《PLOS Genetics》發表一項重要研究成果，題為“Emergence, Retention and Selection: A Trilogy of Origination for Functional De
德國生物信息學家發現新冠病毒新弱點
??近日，德國的生物信息學家通過計算機模型識別出人體中一種對新冠病毒繁殖至關重要的酶，如果抑制這種酶，病毒就會停止繁殖而不影響宿主細胞。該研究有助于找到對抗新冠病毒感染的新方法。 除了疫苗，尋找有效的治療新冠病毒感染的藥物也是戰勝疫情的重要手段之一。現在，來自德國感染研究中心和蒂賓根大學的德爾格
第五屆全國生物信息學大會召開
第五屆全國生物信息學與系統生物學學術大會日前在哈爾濱召開，來自海內外的600余位生物信息學專家、學者出席會議。與會專家以“高通量時代的生物信息學與系統生物學”為主題，分別就利用基因組信息學分類細菌的新方法、細菌基因組組織形式、系統生物學在醫學發展中的應用和研究策略以及基因組非編碼
生物信息學應用：序列分析，電子克隆等初探
生物信息學可指利用信息技術管理和分析生物學數據。這就意味著生物信息學所涉及的范圍相當廣泛，從人工智能、機器人一直到基因組(genome)分析。就基因組分析這一角度來看，生物信息學主要是指核酸和蛋白質序列數據的計算機處理和分析。近年來，蛋白質結構數據的快速增長，使蛋白質三維結構的處理分析也歸入到生物信
生物信息學技術：基因芯片實驗原理與方法
本實驗的目的是學會cDNA芯片的使用方法。了解各種基因芯片的基本原理和優缺點。基因芯片這一技術方法在1991年的Science雜志上被提出，其高通量、并行檢測的特點適應了分析人類基因組計劃所提供的海量的基因序列信息的需要，可以說，人類基因組計劃是基因芯片技術發展的原因，而對深人研究基因突變和基因表達
生物信息學數據庫和軟件的搜索實驗
實驗方法原理熟練掌握上網搜索生物信息學數據庫和軟件的方法及技能。實驗材料電腦實驗步驟一、搜索生物信息學數據庫或者軟件數據庫是生物信息學的主要內容，各種數據庫幾乎覆蓋了生命科學的各個領域。核酸序列數據庫有GenBank，?EMBL，?DDB等，蛋白質序列數據庫有SWISS-PROT，?PIR，OWL，
生物信息學技術分離蛋白質組的介紹
生物信息學在生命科學研究中起著越來越重要的作用。利用生物信息學對蛋白質組的各種數據進行處理和分析，也是蛋白質組研究的重要內容。生物信息學是蛋白質組學研究中不可缺少的一部分。生物信息學的發展，已不僅是單純的對基因組、蛋白質組數據的分析，而且可以對已知的或新的基因產物進行全面分析。在蛋白質組數據庫中
生物專業最強“殺手锏”：如何自學生物信息學？
當下，在部分學習生物專業的學生面臨工作難找、科研難做的多重窘境之際，基因產業和個體化用藥卻在以前所未有的速度蓬勃發展，遺傳咨詢師行業亦初露頭角。傳統學習生物專業的學生，可謂是趕上了“最好的時代”，倘若你知道如何解開維系健康的生命密碼信息，你將變得無可替代。那么問題來了，如何自學生物信息學？本文是
臨床精準醫療必須重視的新興科學：臨床生物信息學
由世界最大出版社“施普林格-自然”2016年出版的“臨床生物信息學的應用”在短短幾個月被下載近萬次，引起國際同行的廣泛重視和密切關注。該書融臨床信息學、醫學信息學、遺傳信息學、生物信息學和系統生物學為一體，詳細和系統地闡述了基因組學、蛋白組學、基因測序、基因表觀學、代謝組學、計算機數學、大數據
生物信息學mapping率高或低代表什么意思
生物信息學高度依賴于網絡。實際上，你需要的幾乎所有資源，都可以從網上下到。你需要關注你研究領域所需要的那些，而不是全部的資源。我原來常用的：NCBI：持有INSDC的節點。網站上有核酸、蛋白、基因名、基因組名等等的搜索工具，以及BLAST序列比對搜索工具，PUBMED文獻數據庫，Taxonomy數據
采用生物信息學和實驗方法聯合分析轉錄組信息
The wealth of transcript information that has been made publicly available in recent years requires the development of high-throughput functional geno
安捷倫科技生物信息學套裝新增整合生物學分析功能
安捷倫科技生物信息學套裝新增整合生物學分析功能 GeneSpring 現可實現通路水平的多組學及新一代測序數據分析 2012 年 3 月 27 日，加利福尼亞州圣克拉拉市——安捷倫科技公司(紐約證交所：A)今日發布了其廣受歡迎的生物信息學軟件的重要擴展版本
《Nature－Biotechnology》：新型生物信息學工具使轉錄組形象化
目前，日本RIKEN生命科學技術中心開發出一種免費可用的新型生物信息工具——ZENBU，可讓研究人員快速輕松地對大規模下一代測序實驗中產生的大量基因組信息，進行整合、形象化和比較分析。 下一代測序(Next-generation sequencing)技術已經徹底改變了功能基因組學，例
Nature－Genetics：細胞重編程迎來革命性生物信息學工具
Duke-NUS醫學院、Bristol大學、Monash大學和RIKEN的研究團隊開發了一個革命性的計算工具，能夠準確預測將一種人類細胞轉變為另一種類型所需的細胞因子。這項研究發表在一月十八日Nature Genetics雜志上，對細胞重編程和再生醫學的進一步發展有重要意義。 我們知道，特定的
新的生物信息學工具，可以分析CRISPR合并的篩選數據
由貝勒醫學院的研究人員領導的團隊開發了一種新的生物信息學工具，可以分析CRISPR合并的篩選數據，并以比其他現有方法更高的靈敏度和準確度確定潛在相關基因的候選基因。新的基于網絡的分析工具也更快，更友好，因為它不需要生物信息學培訓來使用它。該研究發表在《Genome Research》雜志上。