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    納米孔尺度對DNA輸運速度的影響

    圖一:實驗示意圖 圖二:分子動力學仿真模型示意圖 基于納米孔單分子傳感器的第三代DNA測序技術,因其低成本,高通量等優勢很有可能成為人類測序史上的創舉。最近的一項研究發現,DNA在穿過10.8納米的納米孔道時的速度比穿過4.8納米的納米孔的速度降低了一倍,這對于實現DNA減速及單堿基精準測序意義重大。 這篇名為“氮化硅納米孔尺度對poly(dT)30單鏈DNA過孔信號的影響機理”的研究論文發表于《中國科學:技術科學》英文版2013年第10期,從實驗(圖1)和理論(圖2)上解釋了DNA穿過大孔的輸運速度較小孔慢的原因,由東南大學江蘇省微納生物醫療器械設計與制造重點實驗室陳云飛教授擔任通訊作者,其博士生司偉撰寫。 自2006年公布了人類第一號染色體的基因測序圖之后,基因測序技術繼續不斷發展成熟,然而距離1000美元24小時測序的目標還存在一定距離。其中主要原因之一是DNA在納米孔測序時的過孔速度極快,甚至達到10......閱讀全文

    納米孔技術有望顛覆DNA測序市場

      Christopher Mason有一個喜歡在會議上展示的技巧。通過從志愿者手機上收集的化驗樣本獲取DNA,他和同事能在1個小時內現場進行譜系分析,甚至詳細描述出捐贈者一天的生活細節。“我們能從手機上的殘留物預言誰剛吃了一個橘子或者誰吃了豬肉。”美國紐約威爾康奈爾醫學院計算生物學家Mason表示

    納米孔測序發現DNA損傷的新策略

      最近,美國猶他大學的化學家們,設計了一種新的方法來檢測DNA化學損傷,DNA損傷有時會導致基因突變,引發許多疾病,包括各種癌癥和神經系統疾病。相關研究結果發表在十一月六日的《NatureCommunications》。  本文通訊作者、化學教授CynthiaBurrows說:“我們更進一步了解了

    納米孔測序的最低DNA量是多少

    第三代測序技術則是基于納米孔的單分子讀取技術,全基因組的測序以及RNA-seq測序有DNA測序和RNA測序,之前比較早的測序是以芯片為基礎,這種方法讀取數據更快,現在常用的是二代測序。隨之而來的是第三代測序技術、有望大大降低測序成本。望滿意,目前比較高級的還有單細胞測序

    納米孔可成為DNA快速閱讀器

      據《每日科學》近日報道,由美國華盛頓大學物理學家領導的研究小組設計了一種新技術,可在納米孔內對DNA進行快速測序,而且價格比較便宜。新方法可為癌癥、糖尿病或某些成癮患者量身繪制個性化基因測序藍圖,提供更加高效的個體醫療。   論文主要作者、華盛頓大學物理教授簡斯·岡德拉克表示,

    納米孔測序發現DNA損傷的新策略

    最近,美國猶他大學的化學家們,設計了一種新的方法來檢測DNA化學損傷,DNA損傷有時會導至基因突變,引發許多疾病,包括各種癌癥和神經系統疾病。相關研究結果發表在十一月六日的《Nature Communications》。延伸閱讀:科學家解開DNA修復的謎團。本文通訊作者、化學教授Cynthia

    納米孔測序技術有望顛覆DNA測序市場?

     Scott Tighe(左)等研究人員利用MinION設備在南極泰勒谷測序微生物DNA。  “我們能從手機上的殘留物預言誰剛吃了一個橘子或者誰吃了豬肉。”美國紐約威爾康奈爾醫學院計算生物學家Mason表示。你們相信嗎?Christopher Mason有一個喜歡在會議上展示的技巧。通過從志愿者手機

    納米孔尺度對DNA輸運速度的影響

    圖一:實驗示意圖 圖二:分子動力學仿真模型示意圖   基于納米孔單分子傳感器的第三代DNA測序技術,因其低成本,高通量等優勢很有可能成為人類測序史上的創舉。最近的一項研究發現,DNA在穿過10.8納米的納米孔道時的速度比穿過4.8納米的納米孔的速度降低了一倍,這對于實現DNA減速及單堿基精準測序

    PNAS:新技術實現納米孔內快速測序DNA

      據《每日科學》近日報道,由美國華盛頓大學物理學家領導的研究小組設計了一種新技術,可在納米孔內對DNA進行快速測序,而且價格比較便宜。新方法可為癌癥、糖尿病或某些成癮患者量身繪制個性化基因測序藍圖,提供更加高效的個體醫療。相關論文發表于美國《國家科學院院刊》(PNAS)。  論文主要作者

    兩篇PNAS:蛋白納米孔檢測DNA甲基化

      兩個獨立的研究團隊利用通道蛋白實現納米孔測序,成功鑒別了5-甲基胞嘧啶和5-羥甲基胞嘧啶。這兩篇文章發表在同一期的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。   基因組所蘊含的編碼信息,包括DNA序列和核苷酸修飾兩個部分。其中,動態的DNA甲基化模式,是基因表達的重要調控者,與細胞分化、胚胎發育和癌癥

    納米孔測序技術

    測序長度和準確率的快速提升使得納米孔測序有望顛覆DNA測序市場。紐約威爾康奈爾醫學院的計算生物學家Christopher Mason喜歡在會議上表演一個“絕活”:他和同事先從志愿者手機上收集DNA樣本,然后就能在一個小時內現場進行譜系分析,甚至敘述志愿者一天的生活細節。“我們能從留在手機上的DNA信

    DNA測序新突破:新納米孔通過電流變化檢測DNA序列

      在個體化醫療前景的誘惑下,研究人員將研發出更有效的基因測序新方法視為首要任務。如今,賓夕法尼亞大學物理學家利用固態的納米孔區分單鏈DNA分子,這一有前景的技術,在DNA穿過納米孔時,通過檢測電流變化進而讀取DNA序列。相關研究發表在《ACS Nano》期刊上。  領導這項研究的是藝術與科學學院物

    牛津納米孔收購加拿大Northern-Nanopore-擴張固態納米孔領域

      近日,牛津納米孔技術公司(Oxford Nanopore)表示收購加拿大生物技術初創公司Northern Nanopore Instruments(NNi),這家公司開發了一種固態納米孔制造技術。  本次收購沒有披露財務條款。  據Oxford Nanopore介紹,NNi專門從事低成本、精確的

    固態納米孔中DNA的傳輸行為和機制研究取得系列進展

      近期,中國科學院重慶綠色智能技術研究院精準醫療單分子診斷技術研究中心在固態納米孔中DNA的傳輸行為和機制研究方面取得系列進展,相關成果發表在Nano Letters、Carbon、Sensors and Actuators B: Chemical上。  DNA蘊含的信息可用于遺傳疾病根源確定和特

    DNA二氧化硅固態納米孔實現精確制備

      中科院上海應用物理研究所研究員樊春海與合作者提出了一種框架核酸誘導的團簇預水解策略,將經典硅化學引入DNA結構體系, 成功實現了精確可控的DNA-二氧化硅固態納米孔制備。該成果于北京時間7月17日凌晨在線發表于《自然》雜志。  近年來,科學家提出了一種全新的DNA自組裝方法——DNA折紙技術,即

    固態納米孔:下一代DNA測序技術原理、工藝與挑戰

      科學通報,中國科學C輯:生命科學,這兩份期刊均是由中國科學院和國家自然科學基金委員會共同主辦的,我國學術期刊中的知名品牌,被國內外各主要檢索系統收錄,如國內的《中國科學論文與引文數據庫》(CSTPCD)、《中國科學引文數據庫》(CSCD)等;美國的SCI、CA、EI,英國的SA,日本的《科技文獻

    詳解牛津納米孔測序儀

    ?牛津納米孔測序儀在美國人類遺傳學學會年會上公布技術參數  2014年的ASHG年會于10月18日開始在圣地亞哥舉行,有幸親眼目睹了牛津納米孔公司MinIon的現場演示,技術之創新,令人震驚!21日下午,牛津納米孔公司特地在旁邊的Hardrockho舉行了一個小型的封閉式的技術說明會,講解了納米孔的

    納米孔ZL之爭落下帷幕

    美國國際貿易委員會近日發布文件稱,Illumina公司和英國牛津納米孔公司的官司已經庭外和解。納米孔公司同意不再出口或售賣包含氨基酸序列納米孔的產品,并銷毀目前庫存的產品。但該文件也明確表示,這些限制不會影響牛津納米孔對CsgG的使用。CsgG是相關訴訟開始后不就,牛津納米孔發布的另一種新孔,基于全

    詳解牛津納米孔測序儀

     2014年的ASHG年會于10月18日開始在圣地亞哥舉行,有幸親眼目睹了牛津納米孔公司MinIon的現場演示,技術之創新,令人震驚!21日下午,牛津納米孔公司特地在旁邊的Hardrockho舉行了一個小型的封閉式的技術說明會,講解了納米孔的測試結果。  尺寸  MinION的尺寸之小,大大出乎我的

    納米孔測序!耗資1.8億美元的DNA“條形碼”旨在發現新物種

      幾百年以來,生物學家都在以一種極其緩慢的速度探索新物種,描述其定義特征。如今,伴隨著新一代測序技術的突破,生物學家已經可以在幾個小時內確定一份樣本是否為新物種,并且這一成本將有望降至幾美分。這是一場由短鏈DNA驅動的科技革命,這段DNA我們稱之為DNA“條形碼(barcode)”。它們的多樣性足

    納米孔測序技術發展簡介

      隨著對DNA結構和序列的研究,DNA測序技術不斷發展,成為生命科學研究的核心領域,對生物、化學、電學、生命科學、醫學等領域的技術發展起到巨大的推動作用。利用納米孔研究出新型的快速、準確、低成本、高精度及高通量的DNA測序技術是后人類基因組計劃的熱點之一。  納米孔測序技術發展簡介  納米孔檢測技

    牛津納米孔技術公司CEO卸任

      Oxford Nanopore Technologies(ONT),即牛津納米孔技術公司,近期發布消息稱,Gordon Sanghera 已通知董事會,計劃辭去首席執行官(CEO)一職并退出董事會。ONT 董事會現已正式啟動尋找繼任者的工作,旨在帶領公司邁向新的增長與商業化階段。  Gordon

    石墨烯上成功制備可控納米孔

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2017/9/387887.shtm俄羅斯國家研究型工藝大學(NUST MISIS)的專家,與其他國家物理學家組成的國際小組共同開展一系列快重離子輻照石墨烯實驗。結果顯示,可以通過這種方式在石墨烯上制備直徑可控的納米孔。

    納米孔測序的過去、現在和將來

      縱觀測序技術的發展歷程,沒有哪一個技術像納米孔測序那樣慢熱,但也沒有哪一個技術像納米孔測序這么接近普羅大眾。將單鏈DNA拉過蛋白孔,檢測堿基穿過時電導的微小改變,納米孔測序的這一基礎理念已經有十幾年歷史了。  1996年哈佛大學的DanielBranton、加州大學的DavidDeamer及其同

    -Oxford-Nanopore:納米孔測序儀開放試用

      在上個月的美國人類遺傳學協會年會上,英國Oxford Nanopore Technologies公司宣布將啟動MinION測序儀的試用計劃。這次,它果然沒有食言。MinION試用計劃于11月25日啟動,將延續到2014年初,具體截止日期未定。   根據這項試用計劃,參與者須支付1,000美

    Nature-Methods:納米孔測序儀潛力無限

      來自英國Oxford Nanopore公司的MinION是第一臺商業化的納米孔測序儀。它在帶來無限希望的同時,也承受著高錯誤率的質疑。英國伯明翰大學的Nicholas J. Loman和愛丁堡大學的Mick Watson在最新一期的《Nature Methods》上撰文,稱新開發的工具讓納米孔測

    納米孔測序儀真機現身ASHG

      英國Oxford Nanopore Technologies公司在年初的基因組生物學技術進展年會(AGBT)上發布了一款便攜式的基因組測序儀MinION,性能強勁,價格給力,引發市場轟動。然而,大半年過去了,納米孔測序儀卻遲遲不見蹤影,連更早發布的GridION也未上市。于是,生物界開始議論

    利用2D納米孔檢測DNA甲基化?新型癌癥診斷技術有望被開發

      對癌癥進行早期檢測,就好像DNA中所發生的改變,或許能夠幫助增強研究人員對癌癥的診斷和療法的進行,同時還能夠幫助理解疾病的發病機制,日前,一項刊登在國際雜志npj 2D Materials and applications上的研究報告中,來自伊利諾伊大學的研究人員通過研究開發了一種新方法,該方法

    5納米石墨烯納米孔精確制備技術研究取得進展

      日前,中國科學院重慶綠色智能技術研究院精準醫療單分子診斷技術研究中心在5納米石墨烯納米孔精確制備技術研究方面取得進展,研究成果以Precise fabrication of a 5nm graphene nanopore with a helium ion microscope forbiomo

    小小納米孔破解蛋白質測序難題

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503589.shtm

    利用納米孔強化金屬-強度獲得大幅提升

    從中國科學院金屬研究所沈陽材料科學國家研究中心獲悉,該中心金海軍研究員團隊提出,如果細化至百納米以下并彌散分布于材料中,孔洞將從有害材料缺陷轉變為有益的“強化相”。該團隊以金為模型材料,在研究中發現,添加彌散納米孔在不損失甚至提高塑性的同時,可有效降低材料密度并大幅提升其強度。相關研究結果8月9日發

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