QExactive中TMT定量工作流程的參數優化和ProteomeDi...（五）
MS1 參數 TMT 標記對于母離子來說是真正的同量異序標簽，因此 MS1分辨能力的設置是與未標記樣品完全相同的: 對于 Q Exactive Plus MS 和 Q Exactive HF MS 來說，其分辨率分別為 70,000 和 120,000。這樣的設置足以在不顯著影響數據依賴掃描模式循環時間的前提下，分辨絕大部分共洗脫物質。 推薦 AGC 目標為 3e6，有利于提高全掃的動態范圍。 MS2 分辨能力 MS2 分辨能力不夠會導致背景或雜質離子信號與報告離子信號混為一談，影響對 S/N 的評估。對于 TMTsixplex 標記的樣品來說，分辨率設置為 30,000 能夠保證報告離子與相近報告離子的同位素峰實現基線分離。12對于 TMT10plex 試劑來說，13C 和 15N 同位素異構體的質量差異僅為 6 mDa。圖 15 中顯示的是不同比例下經 4 通道 （128N，128C，129N，12......閱讀全文
Q－Exactive中TMT定量工作流程的參數優化和Proteome－Di...（五）
MS1 參數 TMT 標記對于母離子來說是真正的同量異序標簽，因此 MS1分辨能力的設置是與未標記樣品完全相同的: 對于 Q Exactive Plus MS 和 Q Exactive HF MS 來說，其分辨率分別為 70,000 和 120,000。這樣的設置足以在不顯著影響數據依賴掃描
Q－Exactive中TMT定量工作流程的參數優化和Proteome－Di...（六）
?圖 17. TMT-標記的純 E. coli 中的比值。預期比例用虛線表示。請注意對于 128/126 和 129/126 比例，方法 4 的定量分析準確度最高。?MS2 自動增益目標值（AGC）自動增益目標值是需要設置的另一個關鍵參數，其大小決定了 C trap 能積累并進入 Orbitra
Q－Exactive中TMT定量工作流程的參數優化和Proteome－Di...（四）
?圖 10. 運用本研究中每個研究因素篩選蛋白質組（上圖）和肽段組（下圖）鑒定結果的濾篩。?圖 11. 篩濾后肽段組的定量分析結果總覽。?圖 12. 結果中的 Abundance Ratios 欄。比值分別按 Isolation Windows 和 Quan Channel 排序。比例上調或下調的蛋
Q－Exactive中TMT定量工作流程的參數優化和Proteome－Di...（三）
4. 工作流程設置和定量比值的定義首先在 workflows tab 下打開 Processing Workflow。模板里已經包含了質量數容許偏差、報告離子定量分析說明和常見修飾，只需要再細化以下幾個參數。1. 在 Processing Workflow 的 SequestHT 節點下，選擇 Pr
Q－Exactive中TMT定量工作流程的參數優化和Proteome－Di...（一）
Q Exactive中TMT定量工作流程的參數優化和Proteome Discoverer2.1數據處理方法Xiaoyue Jiang1, Tabiwang Arrey2, Eugen Damoc2, Michaela Scigelova2, David Horn1, Rosa Viner1, an
Q－Exactive中TMT定量工作流程的參數優化和Proteome－Di...（二）
數據處理采用 Proteome Discoverer 軟件 2.1 版本（PD 2.1）進行數據處理。該軟件的特色是提供了全新改進版的 TMT 定量分析工作流程，其新功能包括：1）可用于添加報告離子同位素分布的全新用戶界面；2）解析 TMT10plex 試劑中報告離子同位素雜質的能力；3
“Q－Exactive－蛋白質組學研究的綜合平臺”網絡講座
9月27日，賽默飛世爾科技借分析測試百科網這一平臺成功舉辦了“Q Exactive 蛋白質組學研究的綜合平臺”網絡講座。賽默飛世爾科技李靜工程師為大家介紹了Q Exactive高性能臺式四極桿—軌道阱系統的基本組成及特點，著重講解了Q Exactive 在蛋白質組學應用的優勢。 賽默飛世爾科技
Orbitrap－Exploris?－480的鑒定性能、軟件特性和蛋白質組學應用2
3.前所未有的TMT定量體驗 困擾：對于10標以及11標的TMT定量來說我們一直受到兩個問題的困擾。 1第一個問題 10標TMT的相鄰報告離子基團僅存在質量虧損級的質量差異，因此我們需要采用50,000的分辨率進行采集，從而使得掃描速度變慢，降低了對樣品的測序深度。 2第二個問題 共流出肽段的干擾，
“QExactive－蛋白質組學研究綜合平臺”視頻講座進行中......
本次講座主要介紹Q-Exactive高性能臺式四極桿—軌道阱系統的基本組成以及其特點，著重講解了Q-Exactive在蛋白質組學應用的優勢。 點擊參加：http://www.antpedia.com/ant_video/thermo/thermo9-10/page2.h
藥物代謝研究新流程Quanformation網絡講座
2011年10月25日，賽默飛世爾科技“藥物代謝研究新流程Quanformation”網絡講座在分析測試百科網舉行。此前，賽默飛世爾科技舉行已經在分析測試百科網舉行了三次Q-Exactive系列講座，分別是“四極桿-軌道阱質譜儀的特性和功能”、“Q-Exactive -蛋白組
Q－Exactive－Focus－不同高分辨定量方式在藥物分析中的應用－二
2.3 樣品制備取鹽酸美金剛片雜質 N-（二甲基金剛烷）甘氨酸對照品儲備液，逐級稀釋后制成含 N-（二甲基金剛烷）甘氨酸 0.12、 0.6、1.2、 6.0、 12.0、 60、 120、 600、 1200、 6000、 12000 ng/ml（ppb）的溶液，分別按上述不同掃描模式進樣
Q－Exactive－Focus－不同高分辨定量方式在藥物分析中的應用－一
1. 引言質譜技術因其出色的靈敏度和專屬性已經被廣泛的應用于藥物分析，傳統質譜定量采用單位分辨選擇離子檢測 SIM 或選擇反應監測 SRM 的定量方式，高分辨質譜具有獲得化合物離子精確質量數和分離相鄰質量峰的能力，被越來越多的應用于定量分析中。基于 Orbitrap 靜電場軌道阱技術的 Q Exac
Q－Exactive－Focus－不同高分辨定量方式在藥物分析中的應用－三
3.3 平行反應監測（PRM）平行反應檢測（PRM）高分辨定量通過四極桿對目標化合物進行選擇性通過，離子在通過后立即進入碰撞池并發生高能碰撞碎裂，所產生的碎片將被同時送入 Orbitrap 進行高分辨掃描，然后選擇高分辨的二級子離子進行定量。該定量方法的特點為，在四極桿過濾掉大量干擾離子提高了靈敏度
賽默飛世爾科技精彩亮相第六屆AOHUPO大會
2012年5月5~7日，第六屆亞太人類蛋白質組組織(AOHUPO)大會在國家會議中心卡隆重召開，這是亞太地區規模最大、影響最廣、學術水平最高的蛋白質組學學術峰會。賽默飛世爾科技作為此次大會的金牌贊助商，展示了其蛋白質組學領域的最新產品技術及解決方案。賽默飛世爾科技展臺大會入口處擺設了賽
賽默飛在ASMS－2017上推出Q－Exactive－HFX－Orbitrap質譜儀
分析測試百科網訊 在2017年6月4日-8日舉行的ASMS 2017上，賽默飛推出了Q Exactive HF-X Hybrid Quadrupole Orbitrap質譜儀，為深度分析、定量準確性和重現性設定了新的標準，為生命科學研究和生物制藥應用的挑戰性工作提供卓越的數據質量，供研究復雜蛋白
什么是Orbitrap－？－Q－Exactive－？
Orbitrap（靜電場軌道阱）是一種擁有超高分辨率的質量分析器，是賽默飛ZL獨有的高分辨質譜技術，如圖 6 所示。Orbitrap是繼磁質譜質量分析器、飛行時間質量分析器（ToF）、傅立葉變換離子回旋共振質量分析器（FT-ICR）這些高分辨質譜技術之后，發明原理完全創新的高分辨質譜技術，克
定量蛋白質組表達譜分析技術iTRAQ/TMT
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技術是分別由美國AB Sciex公司和Thermo公司研發的多肽體外標記定量技術。這兩種技術采用2-10種穩定同位素標簽，通過特異性 標記多肽的
利用高分辨質譜Q－Exactive－Focus定量分析小麥和飼料中的...
利用高分辨質譜Q Exactive Focus定量分析小麥和飼料中的真菌毒素引言真菌毒素是真菌在食品或飼料里生長所產生的代謝產物，對人和動物都具有極大的健康隱患。據聯合國糧農組織（FAO）統計，全球每年約有 25% 的農產品受到真菌毒素污染。為了保證食品和飼料的安全，全世界多個國家通過法規或
定量蛋白質組表達譜分析技術——iTRAQ/TMT
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技術是分別由美國AB Sciex公司和Thermo公司研發的多肽體外標記定量技術。這兩種技術采用2-10種穩定同位素標簽，通過特異性 標
賽默飛世爾科技：為蛋白質組學提供深層次解決方案
定量蛋白試劑盒 在蛋白分析相關的試劑消耗品方面，Thermo Fisher Scientific都是直接在儀器上開發的。由于試劑和儀器時配套的，從而能夠提高分析效率。例如細胞培養氨基酸穩定同位素標記技術（SILAC）和串聯質譜標簽（tandem mass tag）試劑盒。 細胞培養氨基酸穩定
一小時－DDA－鑒定－DIA－定量－4000－個－Hela－蛋白（一）
引言數據非依賴性的掃描模式（data-independent acquisition, DIA）是近幾年來發展的一種新的質譜數據采集方式[1]。它的理念是用二級碎片離子進行蛋白相對/絕對定量。DIA 掃描模式中，超高分辨質譜對特定質量范圍內的所有母離子進行碎裂，采集所有母離子的碎片離子，并快
Thermo－Fisher－Scientific和Biognosys推出非相關數據采集（DIA）
分析測試百科網訊 在2017年6月4日-8日舉行的ASMS 2017上，世界科學服務領先供應商賽默飛世爾科技公司宣布與下一代蛋白質組學領導者Biognosys AG達成共同營銷協議，為數據庫的創建和數據處理研究，通過組合使用Orbitrap質譜儀和Spectronaut Pulsar軟件，為非相
液相色譜耦聯Q－Exactive－臺式軌道阱質譜儀分析利...（五）
表 5. 單糖的化學組成和分子量??表 6. 用于計算表 4 和表 5 分子量的元素的單同位素原子量和平均原子量?最初的計算是根據發表在 DrugBank 數據庫【2】的序列進行的，然而計算結果與我們實驗測得的質量數并不匹配。通過將 DrugBank 中的序列與之前文獻發表過的序列【3】進行
一小時DDA鑒定DIA定量4000個Hela蛋白（一）
引言數據非依賴性的掃描模式（data-independent acquisition, DIA）是近幾年來發展的一種新的質譜數據采集方式[1]。它的理念是用二級碎片離子進行蛋白相對/絕對定量。 DIA 掃描模式中，超高分辨質譜對特定質量范圍內的所有母離子進行碎裂，采集所有母離子的碎片離子，并
用QExactive篩查未知非法添加劑－三聚氰胺事件不再重演
Sensitivity：提高靈敏度，高分辨下可以保持高靈敏度 靈敏度也是食品安全及其它應用關心的問題，針對記者提出的“Orbitrap為什么在高分辨時還具有高靈敏度？”的問題，James博士回答說，“Orbitrap的體積很小，僅有2寸大小；真
在食品農產品檢測中Q－Exactive的作用
Q Exactive 作為高分辨質譜儀，廣泛應用于食品農產品中未知物、危險物的篩查，比如農藥殘留、獸藥殘留、生物毒素殘留等多種有機污染物的定性篩查，保證食品農產品的安全。此外，Q Exactive 還擁有媲美高端三重四極桿的定量能力，對于復雜基質樣品中目標分析物進行高分辨定量，更是高分辨質譜
使蛋白質檢測更容易
圖1.? Q Exactive質譜儀器內部結構。 Q Exactive是賽默飛世爾科技在2011年ASMS上推出的新型四極桿和軌道阱雜交高分辨質譜儀，將高選擇性四極桿的離子過濾與Orbitrap高分辨準確質量數（HR/AM）測量技術相結合，在分辨率、掃描速度和靈敏度性能上進一步提
Q－Exactive－Focus在多農殘快速篩查和確證分析中的應用
引言近年來，對于農藥殘留的分析不斷地朝快速化、大規模化發展。而目前，在食品安全中的多農殘篩查分析多采用三重四極桿質譜儀，但該質譜系統需要用標準品來優化儀器參數，且能同時分析的化合物數目有限，對于大規模農殘篩查具有一定的局限性。在對復雜基質樣品分析時，也存在一定的假陽性概率。本文采用具有高分辨率、精確
賽默飛在ASMS－2017推出一系列創新質譜產品
分析測試百科網訊 第65屆美國質譜年會 (ASMS 2017) 上，賽默飛世爾科技有限公司（NYSE：TMO）推出了一系列新技術，推動尖端研究，改進應用市場。 分析儀器高級副總裁兼總裁Dan Shine表示：“在ASMS期間，客戶將了解我們的新型質譜技術將如何推動生物研究、轉化醫學、食品和